| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,121,934 | A→G | I225T (ATC→ACC) | pyrC ← | dihydro‑orotase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,121,934 | 0 | A | G | 100.0% | 103.7 / NA | 28 | I225T (ATC→ACC) | pyrC | dihydro‑orotase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (12/16); total (12/16) | |||||||||||
GCAGCCCGCGCAGCCGCAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGATGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGGCAGCATCTTTGGTG > NC_000913/1121801‑1122068 | gcagcCCGCGCAGCCGCAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAgggtgggt < 2:290705/139‑1 (MQ=255) cagcCCGCGCAGCCGCAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTa < 1:168232/139‑1 (MQ=255) cagcCCGCGCAGCCGCAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTa < 1:310856/139‑1 (MQ=255) cgcAGCCGCAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATa > 2:102173/1‑139 (MQ=255) cgcAGCCGCAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATa < 1:364938/139‑1 (MQ=255) cAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCg > 2:46787/1‑139 (MQ=255) ctctctTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGacgca < 2:155475/139‑1 (MQ=255) ttGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTc < 1:82906/139‑1 (MQ=255) cGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCa > 1:451631/1‑139 (MQ=255) gcAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGt < 2:35116/139‑1 (MQ=255) gcAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGt < 2:187087/139‑1 (MQ=255) cGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATc < 1:5040/139‑1 (MQ=255) aCCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGa > 2:179053/1‑139 (MQ=255) aaTACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCg < 1:46787/139‑1 (MQ=255) aaTGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAAc < 1:230731/68‑1 (MQ=255) aaTGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAAc > 2:230731/1‑68 (MQ=255) tGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGtt < 1:177915/84‑1 (MQ=255) tGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGtt > 2:177915/1‑84 (MQ=255) tGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACgg > 2:236201/1‑139 (MQ=255) gCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGGCGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGAtg > 1:22553/1‑95 (MQ=255) gCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGGCGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGAtg < 2:22553/95‑1 (MQ=255) aaTATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGgca < 1:236201/139‑1 (MQ=255) aaTATTACGTTTGAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGgca > 1:161236/1‑139 (MQ=255) gAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGtt < 2:383379/60‑1 (MQ=255) gAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGtt > 1:383379/1‑60 (MQ=255) gAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGgca < 1:129434/127‑1 (MQ=255) gAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGgca > 2:129434/1‑127 (MQ=255) gAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGGCAGCATCTTtggtg > 1:73995/1‑139 (MQ=255) gAGGGTGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGGCAGCATCTTtggtg < 1:102173/139‑1 (MQ=255) | GCAGCCCGCGCAGCCGCAACTGCTCTCTTTGCGATGACGTGCATGTGGCGCAGAATCCGTACCGAGGAATACTCGATTAAAACCGCTGGCGACCAGTTCACGCAATGCCTGTTGGTGAATATTACGTTTGAGGATGGGTAGACAATACAGGTGCGGACGCACGCCTCCAACCAGCATATGGTTGCGGTTAAACATCAGATGCTGCGGAGTGATGGTGGCAGCCAGCCGTTCATTTCCGTCACGGACATAGTCGGCAGCATCTTTGGTG > NC_000913/1121801‑1122068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |