| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 427,630 | (T)5→4 | intergenic (+11/‑17) | yajC → / → secD | SecYEG protein translocase auxillary subunit/SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 427,626 | 0 | T | . | 100.0% | 157.8 / NA | 39 | intergenic (+7/‑21) | yajC/secD | SecYEG protein translocase auxillary subunit/SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (20/19); total (20/19) | |||||||||||
TGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGAT > NC_000913/427489‑427756 | tggttggtCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAAtt > 2:51730/1‑139 (MQ=255) tCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTa > 2:784623/1‑139 (MQ=255) tCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTa > 1:225284/1‑139 (MQ=255) cAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTg < 2:1093458/139‑1 (MQ=255) cGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTa < 1:108358/139‑1 (MQ=255) gAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTaaa < 1:61422/139‑1 (MQ=255) aCGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGt > 1:679141/1‑139 (MQ=255) cGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGtt > 1:176196/1‑139 (MQ=255) cTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATc < 1:637945/139‑1 (MQ=255) cTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATc < 2:679335/139‑1 (MQ=255) aCATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCt < 2:176196/139‑1 (MQ=255) aCATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCt < 1:163860/139‑1 (MQ=255) cTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTgg > 2:719432/1‑139 (MQ=255) cgcgCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGt < 1:784623/139‑1 (MQ=255) gcTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACg < 2:566797/139‑1 (MQ=255) gAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCa > 1:188761/1‑139 (MQ=255) gtTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGt > 2:299158/1‑139 (MQ=255) ttattaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGc < 1:1041359/84‑1 (MQ=255) ttattaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGc > 2:1041359/1‑84 (MQ=255) ttattaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTa > 1:260553/1‑91 (MQ=255) ttattaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTa < 2:260553/91‑1 (MQ=255) attaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTc > 1:1094734/1‑116 (MQ=255) attaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTc < 2:1094734/116‑1 (MQ=255) taAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTa > 1:280470/1‑87 (MQ=255) taAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTa < 2:280470/87‑1 (MQ=255) aCTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTctgctg > 2:861167/1‑139 (MQ=255) aCTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCT‑ATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGt > 1:1061978/1‑139 (MQ=255) ccGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACg < 2:315889/92‑1 (MQ=255) ccGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACg > 1:315889/1‑92 (MQ=255) tCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTa < 2:171752/47‑1 (MQ=255) tCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTa > 1:171752/1‑47 (MQ=255) tCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACAGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAAc > 1:688185/1‑139 (MQ=255) aCCATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGa < 2:688185/139‑1 (MQ=255) ccATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTg > 2:881909/1‑41 (MQ=255) ccATGAAGGCGCTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTg < 1:881909/41‑1 (MQ=255) cgcTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGtt < 1:665285/139‑1 (MQ=255) gcTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGaa > 2:441480/1‑59 (MQ=255) gcTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGaa < 1:441480/59‑1 (MQ=255) cTGTAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCa > 1:825514/1‑139 (MQ=255) tAATTAAAA‑TTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGAt > 1:860076/1‑139 (MQ=255) | TGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGAT > NC_000913/427489‑427756 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |