| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,490,935 | A→G | L69L (TTG→CTG) | idnR ← | transcriptional repressor, 5‑gluconate‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,490,935 | 0 | A | G | 100.0% | 381.7 / NA | 100 | L69L (TTG→CTG) | idnR | transcriptional repressor, 5‑gluconate‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (47/53); total (47/53) | |||||||||||
TCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAAGATACCGAGGGTATAACTTTGTGCATTCAACAACATGCCGGGAGCGCGATTAGGGATATAATTGATCTCTTCCATAATTTTGGCGATGCGCTCGCCTGTTTCCTTTGCCACCTTTTTCGGCGAGCGGATATAA > NC_000913/4490803‑4491068 | tCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 1:1010037/139‑1 (MQ=255)tCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc > 2:76214/1‑139 (MQ=255)tCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 1:974692/139‑1 (MQ=255)tCACCGACTCTTCTTCGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATAcc < 1:16740/139‑1 (MQ=255) 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ttcttcGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGAGGGTATaa > 1:647167/1‑139 (MQ=255) ttcttcGGAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGAGGGTATaa > 2:367528/1‑139 (MQ=255) gAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGAGGGTATAACTTtgtg < 1:743120/139‑1 (MQ=255) gAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGAGGGTATAACTTtgtg > 2:413590/1‑139 (MQ=255) gAATCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGAGGGTATAACTTtgtg < 2:647167/139‑1 (MQ=255) aTCGCGATCGTAATTGTAATTAGCAATAAGGGTCTGATAATTATGCTCAGAGGTGACGGATTCTATTCCCGCGAGAATGTCAGCGAAGAGTTGATTTTGAAATGACGGAATCAGGATACCGAGGGTATAACTTTGTGCa < 1:454961/139‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |