| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,428,109 | C→T | L206L (CTG→CTA) | insH1 ← | IS5 transposase and trans‑activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,428,109 | 0 | C | T | 100.0% | 87.2 / NA | 31 | L206L (CTG→CTA) | insH1 | IS5 transposase and trans‑activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (12/19); total (12/19) | |||||||||||
TCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGA > NC_000913/1427973‑1428232 | tCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAg < 1:496726/139‑1 (MQ=255) aaGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCt > 2:440474/1‑139 (MQ=255) tttttACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGAtt < 1:417030/139‑1 (MQ=255) ccTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTc < 1:391777/139‑1 (MQ=37) aCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTg > 2:1078931/1‑139 (MQ=25) tCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCcg < 1:417683/139‑1 (MQ=25) cGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggt < 2:931361/139‑1 (MQ=25) cGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggt < 2:412765/139‑1 (MQ=25) gCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGAc < 2:1033119/139‑1 (MQ=21) cAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTCAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCa < 1:440474/139‑1 (MQ=21) cacaTCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCtg < 1:25110/139‑1 (MQ=21) ccTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGc < 2:954744/112‑1 (MQ=25) ccTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGc > 1:954744/1‑112 (MQ=37) ccTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAg > 2:510387/1‑139 (MQ=21) ggCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCa > 1:552823/1‑139 (MQ=21) ctcctcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCcg > 1:585825/1‑104 (MQ=38) ctcctcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCcg < 2:585825/104‑1 (MQ=25) ctcctcGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTg < 1:801600/139‑1 (MQ=21) cgcgCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATc > 1:1040627/1‑139 (MQ=37) ggCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGAtt > 1:1048369/1‑54 (MQ=255) ggCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGAtt < 2:1048369/54‑1 (MQ=255) aaaTTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTg < 2:1040627/139‑1 (MQ=17) aaTTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGc < 1:1078931/139‑1 (MQ=17) aaTTGCTCCTCTACGGGAAGGAGATTAGCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTGGGCGGCGGTGGTGACCGCGCTGTGGATCAGGCCACTATTGGCATCGACGTCAATGTGGGCATTCATGCCAAAGGGCCACTGATTGc < 1:1029263/139‑1 (MQ=11) aTTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggt > 1:898565/1‑61 (MQ=255) aTTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCggt < 2:898565/61‑1 (MQ=255) tcctcTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCtg < 2:1024108/69‑1 (MQ=255) tcctcTCCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCtg > 1:1024108/1‑69 (MQ=25) tcCATGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTc > 2:103098/1‑139 (MQ=18) ctGAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGa < 1:1037379/138‑1 (MQ=17) gAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGt > 1:752553/1‑64 (MQ=16) gAAGCAGATTACCTAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGt < 2:752553/64‑1 (MQ=16) | TCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCTCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGAAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCTGTGGGTCAGGCCACTCTTGGCATCGACACCAATGTGGGCCTTCATGCCAAAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGA > NC_000913/1427973‑1428232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |