Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,035,437 | T→C | K282R (AAG→AGG) | prfB ← | peptide chain release factor RF‑2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,035,437 | 0 | T | C | 100.0% | 199.4 / NA | 54 | K282R (AAG→AGG) | prfB | peptide chain release factor RF‑2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (25/29); total (25/29) |
TAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGAT > NC_000913/3035305‑3035569 | tAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCt > 1:1200146/1‑139 (MQ=255) tAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCt > 2:256852/1‑139 (MQ=255) gAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTggg > 1:344760/1‑139 (MQ=255) gAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACg > 1:915580/1‑139 (MQ=255) aTCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGt > 1:259954/1‑139 (MQ=255) ggCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGtt < 2:259954/139‑1 (MQ=255) cTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCt > 2:908484/1‑139 (MQ=255) cccAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCa < 1:440806/139‑1 (MQ=255) aTGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCa < 1:304577/139‑1 (MQ=255) tGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCAc > 2:542371/1‑139 (MQ=255) tGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCAc > 1:427349/1‑139 (MQ=255) gATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATcc < 2:915580/139‑1 (MQ=255) tttGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCg < 1:256852/139‑1 (MQ=255) ttGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTTCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGGACGGTCGTTCTGGCACTGGGGGACGATCCCgg < 1:904478/139‑1 (MQ=255) tGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGTCATTTTTCTTCTGCATCTCCAATTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGt < 1:1155004/139‑1 (MQ=255) tATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCgg < 2:25093/139‑1 (MQ=255) tATCTTCCATCGCCTGTCTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTCGCACGGGGTCACGATCCAGGTCgg > 1:1175457/1‑139 (MQ=255) cATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTgg < 1:748337/139‑1 (MQ=255) cATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTgg < 1:1066385/139‑1 (MQ=255) ccTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGt > 2:739111/1‑124 (MQ=255) ccTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGt < 1:739111/124‑1 (MQ=255) ttcttcTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCgg > 1:1213798/1‑139 (MQ=255) ttctGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTAc < 2:1200146/139‑1 (MQ=255) ctGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACgg < 2:344760/139‑1 (MQ=255) gCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGtt < 2:427349/139‑1 (MQ=255) aaaGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCggg > 1:316951/1‑89 (MQ=255) aaaGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCggg < 2:316951/89‑1 (MQ=255) aaaGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGAccgcc > 1:556789/1‑139 (MQ=255) aaaGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGAccgcc < 2:1175457/139‑1 (MQ=255) tCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGcc > 2:916131/1‑139 (MQ=255) cGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACt > 2:167612/1‑62 (MQ=255) cGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACt < 1:167612/62‑1 (MQ=255) cGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCg > 1:580143/1‑139 (MQ=255) cGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCg > 2:486839/1‑139 (MQ=255) cGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCg > 1:305726/1‑139 (MQ=255) gCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCgg > 1:1206293/1‑139 (MQ=255) ttCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACg < 2:556789/139‑1 (MQ=255) cATCTGCTTCATGGCCTGATTTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGAATGTGGGTAATACGCACCGAAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTg < 2:580143/139‑1 (MQ=255) cATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTg < 1:106866/139‑1 (MQ=255) cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGAccgcc < 1:216733/120‑1 (MQ=255) cTTCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGAccgcc > 2:216733/1‑120 (MQ=255) ttCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATaaa > 1:469603/1‑139 (MQ=255) ttCATGGCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATaaa < 2:729398/139‑1 (MQ=255) ggCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCa > 2:1019484/1‑139 (MQ=255) ggCCTGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCa < 2:690030/139‑1 (MQ=255) tGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGAt > 1:637817/1‑62 (MQ=255) tGATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGAt < 2:637817/62‑1 (MQ=255) gATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCa > 1:1148856/1‑37 (MQ=255) gATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCa < 2:1148856/37‑1 (MQ=255) gATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGAc < 2:33730/119‑1 (MQ=255) gATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGAc > 1:33730/1‑119 (MQ=255) gATCTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATgcg < 1:916131/139‑1 (MQ=255) cTTTGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAg < 1:1099520/139‑1 (MQ=255) ttGTTCCTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTACTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGAt < 1:873735/139‑1 (MQ=255) | TAAGAACGAATCTGGCTGCCCCAGCCGATGTCGGATTTGTTATCTTCCATCGCCTGTTTCTCGGCATTTTTCTTCTGCATCTCCAGTTCATAAAGCTTCGCTTTCATCTGCTTCATGGCCTGATCTTTGTTCTTGTGCTGGGAACGGTCGTTCTGGCACTGGGTCACGATCCCGGTCGGGATGTGGGTAATACGCACCGCAGATTCGGTACGGTTAACGTGCTGACCGCCCGCGCCGGACGTGCGATAAACGTCAATGCGCAGAT > NC_000913/3035305‑3035569 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |