| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,450,674 | G→A | P231S (CCA→TCA) | rplB ← | 50S ribosomal subunit protein L2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,450,674 | 0 | G | A | 100.0% | 76.5 / NA | 23 | P231S (CCA→TCA) | rplB | 50S ribosomal subunit protein L2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (15/8); total (15/8) | |||||||||||
GCTACGGCGACGTACGATGAATTTATCAGTACGCTTGTTGCTGCGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGGGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCGCAGCATATGCTCAGCATTGCCAACTTCGCCCAGAGTTGCACGGCAGTCTG > NC_000913/3450549‑3450808 | gCTACGGCGACGTACGATGAATTTATCAGTACGCTTGTTGCTGCGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCggg < 1:346257/139‑1 (MQ=255) tACGCTTGTTGCTGCGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACg > 1:65346/1‑139 (MQ=255) aCGCTTGTTGCTGCGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGa > 2:553337/1‑139 (MQ=255) cGCTTGTTGCTGCGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGaa > 2:297774/1‑139 (MQ=255) gttgCTGCGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAAcacca > 2:580959/1‑139 (MQ=255) cGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAATGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACg < 1:222252/134‑1 (MQ=255) cGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAATGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACg > 2:222252/1‑134 (MQ=255) ggTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAAcacca < 1:203215/115‑1 (MQ=255) ggTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAAcacca > 2:203215/1‑115 (MQ=255) gTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTg < 1:611716/124‑1 (MQ=255) gTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTg > 2:611716/1‑124 (MQ=255) cccACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAAcgcg > 1:576777/1‑139 (MQ=255) cccACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAAcgcg > 2:157860/1‑139 (MQ=255) cGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCgcagc < 1:580959/139‑1 (MQ=255) tACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGCACgcgc > 2:459011/1‑130 (MQ=255) tACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACgcgc < 1:459011/130‑1 (MQ=255) tACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCGCAGCATATGc > 1:42778/1‑139 (MQ=255) tACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGAGTGGTCTACCGGGTTCAGCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCGCAGCATATGc > 1:146063/1‑139 (MQ=255) caccaTGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCGCAGCATATGCTCa < 2:280098/107‑1 (MQ=255) caccaTGTGAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCGCAGCATATGCTCa > 1:280098/1‑107 (MQ=255) tgtgAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAAcgcg < 2:222950/89‑1 (MQ=255) tgtgAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAAcgcg > 1:222950/1‑89 (MQ=255) tgtgAGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCGCAGCATATGCTCAGCATTGCCAACTTCGCCCAGAGTTGCACGGCAGTCTg > 2:445178/1‑139 (MQ=255) | GCTACGGCGACGTACGATGAATTTATCAGTACGCTTGTTGCTGCGGGTCTTCTTACCTTTGGTCTGAACGCCCCACGGAGTTACCGGGTGCTTACCAAAGTTACGACCTTCACCACCACCATGTGGGTGGTCTACCGGGTTCATCGCGGTACCGCGAACGGTCGGACGAACACCACGCCAGCGTGCAGCACCTGCTTTACCCAGAACGCGCAGCATATGCTCAGCATTGCCAACTTCGCCCAGAGTTGCACGGCAGTCTG > NC_000913/3450549‑3450808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |