| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 584,639 | C→T | intergenic (+209/+41) | appY → / ← ompT | global transcriptional activator, DLP12 prophage/DLP12 prophage, outer membrane protease VII, outer membrane protein 3b |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 584,639 | 0 | C | T | 100.0% | 348.2 / NA | 99 | intergenic (+209/+41) | appY/ompT | global transcriptional activator, DLP12 prophage/DLP12 prophage, outer membrane protease VII, outer membrane protein 3b |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (49/50); total (49/50) | |||||||||||
ACCATTAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGAAGTGTTATTATTG > NC_000913/584504‑584770 | aCCATTAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCgg > 1:605526/1‑139 (MQ=255) ccATTAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCggg < 2:332214/139‑1 (MQ=255) aTTAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGc > 1:538255/1‑139 (MQ=255) aTTAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGc > 2:76159/1‑139 (MQ=255) ttAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCggg > 2:405604/1‑136 (MQ=255) ttAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCggg < 1:405604/136‑1 (MQ=255) gCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGaaa > 1:569747/1‑139 (MQ=255) tttATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAGCCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg < 1:746605/139‑1 (MQ=255) tttATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg < 1:76159/139‑1 (MQ=255) tacatacTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCt > 2:241591/1‑139 (MQ=255) acTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTaaaa > 1:883227/1‑139 (MQ=255) acTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTaaaa > 2:602122/1‑139 (MQ=255) acTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTaaaa > 2:702821/1‑139 (MQ=255) acTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTaaaa > 2:1083462/1‑139 (MQ=255) acTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCT‑GTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAt > 1:448686/1‑139 (MQ=255) cTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAt > 1:1053666/1‑139 (MQ=255) ataATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAtgt < 2:41818/139‑1 (MQ=255) taATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAtgtg < 1:241591/139‑1 (MQ=255) taATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAAtgtg < 2:538255/139‑1 (MQ=255) ttGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTAc > 2:827774/1‑139 (MQ=255) ttGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTAc > 2:592751/1‑139 (MQ=255) gATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACtt > 2:410424/1‑139 (MQ=255) aTGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTa > 2:400601/1‑139 (MQ=255) aTGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTa > 2:319522/1‑139 (MQ=255) ggTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAg > 1:1041927/1‑139 (MQ=255) ggTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAg < 1:400601/139‑1 (MQ=255) ggTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAg > 1:342771/1‑139 (MQ=255) ggTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAg < 1:341520/139‑1 (MQ=255) ggTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAg > 2:264703/1‑139 (MQ=255) ttCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACca > 1:33642/1‑139 (MQ=255) tCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcag < 2:569747/139‑1 (MQ=255) tCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcag < 2:342771/139‑1 (MQ=255) gATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCagtagt > 1:32004/1‑139 (MQ=255) tttAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGtga < 1:319522/139‑1 (MQ=255) aGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGtgatga > 1:1009270/1‑139 (MQ=255) atatCCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTta < 2:1041927/139‑1 (MQ=255) ataaCCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTta < 1:264703/139‑1 (MQ=255) aaCCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTtata < 1:592751/139‑1 (MQ=255) aaCCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTtata < 1:702821/139‑1 (MQ=255) tCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTGCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg < 1:780198/89‑1 (MQ=255) tCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTGCATTGAAATGGCTAGATATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg > 2:780198/1‑89 (MQ=255) tCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCt > 2:400880/1‑69 (MQ=255) tCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCt < 1:400880/69‑1 (MQ=255) tCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGACGTTATAGtttt > 1:718649/1‑139 (MQ=255) tCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTtata < 2:1009901/134‑1 (MQ=255) tCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTtata > 1:1009901/1‑134 (MQ=255) tGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTGTTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCt > 1:294209/1‑139 (MQ=255) tGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg > 1:574574/1‑87 (MQ=255) tGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg < 2:574574/87‑1 (MQ=255) ggTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAg < 2:81644/131‑1 (MQ=255) ggTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAg > 1:81644/1‑131 (MQ=255) tttATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAc > 2:674705/1‑139 (MQ=255) tttATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAc < 2:718649/139‑1 (MQ=255) tttATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAc < 1:410424/139‑1 (MQ=255) ttATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAcc < 2:32004/139‑1 (MQ=255) tATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTTATGAAGTTATAGTTTTTTATACCt < 1:674705/139‑1 (MQ=255) aTTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcagcag < 1:285017/109‑1 (MQ=255) aTTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcagcag > 2:285017/1‑109 (MQ=255) ttAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTc < 2:33642/139‑1 (MQ=255) tAATGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTcc < 1:1083462/139‑1 (MQ=255) aaGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCtt > 2:628895/1‑80 (MQ=255) aaGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCtt < 1:628895/80‑1 (MQ=255) tAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcag > 1:448501/1‑95 (MQ=255) tAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcag < 2:448501/95‑1 (MQ=255) tAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTg > 2:754102/1‑139 (MQ=255) aaTTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCt > 2:714673/1‑48 (MQ=255) aaTTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCt < 1:714673/48‑1 (MQ=255) aTTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCt < 2:1009270/139‑1 (MQ=255) tACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAc < 1:613314/118‑1 (MQ=255) tACATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAc > 2:613314/1‑118 (MQ=255) aCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAACATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTc > 2:1015055/1‑139 (MQ=255) aCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAg < 2:24738/82‑1 (MQ=255) aCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAg > 1:24738/1‑82 (MQ=255) aCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGAcc > 2:943375/1‑85 (MQ=255) aCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGAcc < 1:943375/85‑1 (MQ=255) aCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcagcag > 2:180168/1‑90 (MQ=255) aCATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACcagcag < 1:180168/90‑1 (MQ=255) cATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTGTAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCt > 1:694800/1‑132 (MQ=255) cATTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCt < 2:694800/132‑1 (MQ=255) aTTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTg < 2:681317/139‑1 (MQ=255) aTTGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTg < 1:754102/139‑1 (MQ=255) aTTGAAATGGCT‑GTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGa < 2:448686/139‑1 (MQ=255) tGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGAc < 1:623254/80‑1 (MQ=255) tGAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGAc > 2:623254/1‑80 (MQ=255) gAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGAAg < 1:416518/139‑1 (MQ=255) gAAATGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGAAg < 1:602122/139‑1 (MQ=255) aaaTGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGt > 1:790997/1‑102 (MQ=255) aaaTGGCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGt < 2:790997/102‑1 (MQ=255) gCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg < 1:862796/50‑1 (MQ=255) gCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCg > 2:862796/1‑50 (MQ=255) gCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGt < 1:133299/124‑1 (MQ=255) gCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGt > 2:133299/1‑124 (MQ=255) gCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGaa > 1:265681/1‑132 (MQ=255) gCTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGaa < 2:265681/132‑1 (MQ=255) cTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAcc < 1:355049/106‑1 (MQ=255) cTAGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATAcc > 2:355049/1‑106 (MQ=255) aGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGAAgtgt > 1:644612/1‑133 (MQ=255) aGTTATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGAAgtgt < 2:644612/133‑1 (MQ=255) ttATTCCTCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGAAGTGTTATTATtg < 2:605526/139‑1 (MQ=255) | ACCATTAATTTGTAATTGGGTTGCTGTCGCCTATTTTATACATACTATAATTGATGGTTTTCTATGTGATTTAGTTAATAACCTTCTGGGTTTATTTTAAGGGTTAATTGTTACATTGAAATGGCTAGTTATTCCCCGGGGCGATTTTCACCTCGGGGAAATTTTAGTTGGCGTTCTTAAAATGTGTACTTAAGACCAGCAGTAGTGATGAAGTTATAGTTTTCTATACCTGCTCCATTTTTGCTGTAGTCTGAAGTGTTATTATTG > NC_000913/584504‑584770 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |