Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,937,802 | A→G | D112G (GAC→GGC) | fucK → | L‑fuculokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,937,802 | 0 | A | G | 100.0% | 133.6 / NA | 35 | D112G (GAC→GGC) | fucK | L‑fuculokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (19/16); total (19/16) |
AGTGAACTGACTGAATGCCACATCCGCGGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCT > NC_000913/2937666‑2937936 | aGTGAACTGACTGAATGCCACATCCGCGGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCa > 1:293182/1‑139 (MQ=255) aTGCCACATCCGCGGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTa > 1:643628/1‑139 (MQ=255) cgGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGc < 1:688627/135‑1 (MQ=255) cgGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGc > 2:688627/1‑135 (MQ=255) cGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTg < 2:293182/139‑1 (MQ=255) cGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAg < 2:643628/139‑1 (MQ=255) accaccTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGaa > 1:606091/1‑108 (MQ=255) accaccTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGaa < 2:606091/108‑1 (MQ=255) gATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAg > 2:661381/1‑139 (MQ=255) cgcTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCttt > 2:129001/1‑139 (MQ=255) tGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGc > 2:110272/1‑112 (MQ=255) tGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGc < 1:110272/112‑1 (MQ=255) aGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAAt < 1:661381/139‑1 (MQ=255) gATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 1:264318/139‑1 (MQ=255) gCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAg < 1:378754/91‑1 (MQ=255) gCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAg > 2:378754/1‑91 (MQ=255) aaGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa > 1:307857/1‑132 (MQ=255) aaGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATa < 2:307857/132‑1 (MQ=255) aaGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTtata > 1:428351/1‑139 (MQ=255) cAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGc < 2:652073/92‑1 (MQ=255) cAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGc > 1:652073/1‑92 (MQ=255) cAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAg > 1:225784/1‑139 (MQ=255) ctATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTgg > 1:342546/1‑139 (MQ=255) ttattaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTACAGGCTATTTCTg > 2:394338/1‑87 (MQ=255) ttattaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTACAGGCTATTTCTg < 1:394338/87‑1 (MQ=255) ttaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGt < 2:324703/129‑1 (MQ=255) ttaGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGt > 1:324703/1‑129 (MQ=255) aGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAatc > 1:681546/1‑139 (MQ=255) aTGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACaa < 2:225784/139‑1 (MQ=255) cgcgAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg < 1:66881/95‑1 (MQ=255) cgcgAACAGCAGCGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACg > 2:66881/1‑95 (MQ=255) cagcGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGAGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAAcgcgc > 2:708846/1‑139 (MQ=255) agcGGTTATGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAAcgcgcg < 2:681546/139‑1 (MQ=255) aTGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCt > 1:615383/1‑139 (MQ=255) aTGGGCAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGAGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCt < 1:708846/139‑1 (MQ=255) | AGTGAACTGACTGAATGCCACATCCGCGGTATCGCCGTCACCACCTTTGGTGTGGATGGCGCTCTGGTAGATAAGCAAGGCAATCTGCTCTATCCGATTATTAGCTGGAAATGTCCGCGAACAGCAGCGGTTATGGACAATATTGAACGGTTAATCTCCGCACAGCGGTTGCAGGCTATTTCTGGCGTCGGAGCCTTTAGTTTCAATACGTTATATAAGTTGGTGTGGTTGAAAGAAAATCATCCACAACTGCTGGAACGCGCGCACGCCT > NC_000913/2937666‑2937936 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |