| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 738,087 | A→G | intergenic (+126/‑5) | ybfL → / → ybfD | pseudogene, DDE domain transposase family,putative factor, Not classified, putative receptor protein/H repeat‑associated putative transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 738,087 | 0 | A | G | 100.0% | 212.3 / NA | 62 | intergenic (+126/‑5) | ybfL/ybfD | pseudogene, DDE domain transposase family,putative factor, Not classified, putative receptor protein/H repeat‑associated putative transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (33/29); total (33/29) | |||||||||||
CTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAG > NC_000913/737972‑738215 | cTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGa < 2:159919/139‑1 (MQ=255) ttGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGa > 2:330294/1‑139 (MQ=255) tGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGaa < 2:250947/139‑1 (MQ=255) tACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACa < 1:173684/139‑1 (MQ=25) 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aTCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAAGGGACCTTAAAAAATTGATGGAGCATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTtgt > 1:743036/1‑139 (MQ=255) cAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGc < 2:1091108/139‑1 (MQ=255) aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGAtt > 1:237546/1‑76 (MQ=255) aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGAtt < 2:237546/76‑1 (MQ=255) aaTACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCg > 2:1041657/1‑139 (MQ=255) tcttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGa > 2:1105993/1‑75 (MQ=255) tcttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGa < 1:1105993/75‑1 (MQ=255) tcttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTAt > 2:953822/1‑125 (MQ=37) tcttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTAt < 1:953822/125‑1 (MQ=37) tcttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAttt > 1:1045034/1‑139 (MQ=37) tcttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAttt > 2:884403/1‑139 (MQ=37) tcttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTAttt > 2:616719/1‑139 (MQ=25) cttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAATATTGATGGAAGatat > 2:706581/1‑52 (MQ=14) cttACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACatat < 1:706581/52‑1 (MQ=255) 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(MQ=21) tACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGt > 1:878280/1‑86 (MQ=255) tACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGt < 2:878280/86‑1 (MQ=255) aCATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTgg > 1:369057/1‑139 (MQ=21) aTTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAg > 2:596398/1‑139 (MQ=17) aTTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAg > 1:271915/1‑139 (MQ=18) aaGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGAc > 1:915291/1‑110 (MQ=17) aaGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGAc < 2:915291/110‑1 (MQ=17) | CTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAG > NC_000913/737972‑738215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |