| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,066,288 | T→C | T296A (ACG→GCG) | ygfI ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,066,288 | 0 | T | C | 97.9% | 356.9 / ‑0.4 | 96 | coding (886/897 nt) | ygfI | putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (45/49); minor base . (1/1); total (46/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.41e-01 | |||||||||||
CCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCC > NC_000913/3066155‑3066412 | ccTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGt > 1:388975/1‑139 (MQ=255) aTGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCAc > 1:943544/1‑139 (MQ=255) tGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg > 2:493790/1‑139 (MQ=255) tCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCt > 1:591058/1‑139 (MQ=255) gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 2:333012/1‑139 (MQ=255) gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 1:53922/1‑139 (MQ=255) gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 2:686667/1‑139 (MQ=255) gggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATATAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTc > 1:1091111/1‑139 (MQ=255) ggATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCa > 2:825887/1‑139 (MQ=255) ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg < 1:176858/129‑1 (MQ=255) ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg > 2:176858/1‑129 (MQ=255) ttATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCa < 2:713879/139‑1 (MQ=255) tATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa < 2:628743/139‑1 (MQ=255) aTCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa > 1:735668/1‑138 (MQ=255) aTCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa < 2:735668/138‑1 (MQ=255) cTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACTTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAg < 2:963310/138‑1 (MQ=255) cTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAg > 1:963310/1‑138 (MQ=255) gAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:37690/139‑1 (MQ=255) gAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:256251/139‑1 (MQ=255) gAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:333012/139‑1 (MQ=255) aaaTGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGTTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCg > 2:995142/1‑139 (MQ=255) aaTGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCgg < 2:1043205/139‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtat > 2:976809/1‑139 (MQ=255) cgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 1:799480/1‑132 (MQ=255) cgcCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:799480/132‑1 (MQ=255) tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACga < 2:1091111/139‑1 (MQ=255) tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACga < 1:825887/139‑1 (MQ=255) tGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACga > 2:314405/1‑139 (MQ=255) ggACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACgatgat < 1:893427/139‑1 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGa < 1:157064/139‑1 (MQ=255) atTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGa < 1:686667/139‑1 (MQ=255) tCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGAtt > 1:575285/1‑139 (MQ=255) caccacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTg > 2:897285/1‑139 (MQ=255) cacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt < 2:575285/139‑1 (MQ=255) cacGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt < 1:976809/139‑1 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATaa > 2:110210/1‑139 (MQ=255) cGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCG‑CCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATaaa > 2:414408/1‑139 (MQ=255) tCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa < 1:249123/139‑1 (MQ=255) ttAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata < 1:314405/139‑1 (MQ=255) ttAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCCTAGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata > 1:751069/1‑139 (MQ=255) tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa < 2:547787/136‑1 (MQ=255) tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGa > 1:547787/1‑136 (MQ=255) tAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCG‑CCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATAtt < 1:414408/139‑1 (MQ=255) aGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATAtt < 2:592906/139‑1 (MQ=255) aGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATAtt < 2:890801/139‑1 (MQ=255) gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGTTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:591770/102‑1 (MQ=255) gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGTTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:591770/1‑102 (MQ=255) gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTc < 2:388975/139‑1 (MQ=255) gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTc > 1:951671/1‑139 (MQ=255) gCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTc < 1:493790/139‑1 (MQ=255) ccACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTcc < 1:897285/139‑1 (MQ=255) cGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTc < 2:633900/116‑1 (MQ=255) cGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTc > 1:633900/1‑116 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGTAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:428337/1‑97 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGTAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:428337/97‑1 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata > 2:638517/1‑104 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata < 1:638517/104‑1 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGATTAAAGATATTCCTGCa > 2:753264/1‑139 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTcc > 2:771853/1‑135 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTcc < 1:771853/135‑1 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCa > 2:100035/1‑139 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCa > 1:166933/1‑139 (MQ=255) gTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCa > 1:221385/1‑139 (MQ=255) tCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCat < 2:221385/139‑1 (MQ=255) tCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCat < 1:753264/139‑1 (MQ=255) cTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGt > 1:597652/1‑93 (MQ=255) cTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGt < 2:597652/93‑1 (MQ=255) gACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACa < 2:380736/139‑1 (MQ=255) cacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:131220/85‑1 (MQ=255) cacCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:131220/1‑85 (MQ=255) gTAATTTAATTGCAACCGGTTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCtgtg < 1:995142/139‑1 (MQ=255) taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa < 2:264088/62‑1 (MQ=255) taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCaa > 1:264088/1‑62 (MQ=255) taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:747124/80‑1 (MQ=255) taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 1:747124/1‑80 (MQ=255) taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTg > 1:924202/1‑79 (MQ=255) taatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTg < 2:924202/79‑1 (MQ=255) aatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 1:945591/79‑1 (MQ=255) aatttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 2:945591/1‑79 (MQ=255) atttaattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCgg < 1:110210/139‑1 (MQ=255) aattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata > 2:828817/1‑81 (MQ=255) aattGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGtata < 1:828817/81‑1 (MQ=255) attGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCAt < 2:951671/139‑1 (MQ=255) ttGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATc > 2:355818/1‑139 (MQ=255) aCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg < 2:142936/38‑1 (MQ=255) aCCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACg > 1:142936/1‑38 (MQ=255) ggCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata < 1:937906/98‑1 (MQ=255) ggCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGata > 2:937906/1‑98 (MQ=255) cGATGCTGGGTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAg < 2:751069/139‑1 (MQ=255) gggTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGcc > 1:630735/1‑139 (MQ=255) ggTTAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCt < 2:715481/91‑1 (MQ=255) ggTAAATGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCt > 1:715481/1‑91 (MQ=255) aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg > 1:38026/1‑47 (MQ=255) aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTgg < 2:38026/47‑1 (MQ=255) aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt < 1:514355/74‑1 (MQ=255) aTGACTCGCCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAAt > 2:514355/1‑74 (MQ=255) | CCTATGTATCGGGATTATCTGCATCGCTATCTGGAAAATGCGCCTGGCGGACATATTCACCACGATCTTAGCCACGTCTTCGACTTACACCGTAATTTAATTGCAACCGGCTCGATGCTGGGTTAATGACTCGTCCCGTCACGATCTTCAGCAATATGCTGAAGCATCGTGGCGGTATAACGATGATTTCTGATTGAATAAAGATATTCCTGCATATACATCGGCCTGTGCGGTGCATCAAAATATTTCAGCGTTGCC > NC_000913/3066155‑3066412 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |