| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 738,087 | A→G | intergenic (+126/‑5) | ybfL → / → ybfD | pseudogene, DDE domain transposase family,putative factor, Not classified, putative receptor protein/H repeat‑associated putative transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 738,087 | 0 | A | G | 100.0% | 178.8 / NA | 56 | intergenic (+126/‑5) | ybfL/ybfD | pseudogene, DDE domain transposase family,putative factor, Not classified, putative receptor protein/H repeat‑associated putative transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (29/27); total (29/27) | |||||||||||
GGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAACAAAATGGAACTTAAAAAATTGATGGAACATATTTCTATTATCCCCGATTACAGACAAGCCTGGAAAGTGGAACATAAATTATCGGATATTCTACTGTTGACTATTTGTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAGGC > NC_000913/737951‑738220 | ggCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCa < 1:563161/139‑1 (MQ=255) ccTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTaaaaaa > 1:663229/1‑139 (MQ=255) cTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGa > 1:404756/1‑139 (MQ=255) tttttGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCCTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAGATACTTCTTACATAATTAAGGAGAGCAAAATGGAACTTAAAAAATTGAt < 1:91925/139‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |