| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 936,202 | C→T | T993T (ACC→ACT) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 936,202 | 0 | C | T | 88.0% | 59.7 / 2.7 | 25 | T993T (ACC→ACT) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base T (11/11); total (13/12) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.86e-01 | |||||||||||
CGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGTTTCATCATGATCGACCCGAAAATGCTGGAGCTTTCGGTTTATGAAGGCATTCCGC > NC_000913/936085‑936332 | cGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGgt > 2:264670/1‑139 (MQ=255) cgcgATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCga < 2:593609/139‑1 (MQ=255) cgcgATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCga > 2:247208/1‑139 (MQ=255) gTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGTCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGc < 1:139175/139‑1 (MQ=255) tggtgCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTATATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGc < 1:247208/139‑1 (MQ=255) tgCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGcaca < 2:407592/139‑1 (MQ=255) cTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGc > 2:652516/1‑139 (MQ=255) aGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGAt > 2:506708/1‑139 (MQ=255) aGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGAt > 2:43487/1‑139 (MQ=255) aGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGAt > 1:513200/1‑139 (MQ=255) cGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGt < 2:720707/139‑1 (MQ=255) cGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGt > 2:751493/1‑139 (MQ=255) gCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGtt < 2:299906/139‑1 (MQ=255) gCCGGTGAGACGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGtt < 2:513200/139‑1 (MQ=255) tGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGaa < 1:486949/84‑1 (MQ=255) tGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCAGTCGGTGTGaa > 2:486949/1‑84 (MQ=255) aaTGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGt < 2:422050/106‑1 (MQ=255) aaTGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGt > 1:422050/1‑106 (MQ=255) ttgttgGTTGCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGTTTCATCATGATCGACCCGAAAATGCTGGAGCTTTCGGTTTATg < 1:506708/139‑1 (MQ=255) tgCGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGTTTCATCATGATCGACCCGAAAATGCTGGAGCTTTCGGTTTATGAAGGCAtt > 1:285140/1‑139 (MQ=255) tgCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGTTTCATCATGAt > 2:131476/1‑99 (MQ=255) tgCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGTTTCATCATGAt < 1:131476/99‑1 (MQ=255) cGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCg > 2:129462/1‑85 (MQ=255) cGGGGACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCg < 1:129462/85‑1 (MQ=255) gggACTACTGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGTTTCATCATGATCGACCCGAAAATGCTGGAGCTTTCGGTTTATGAAGGCATTCCGc > 2:684937/1‑139 (MQ=255) | CGCCAAATTCCGCGATAATCCGTCGCCATTAACCGTGGTGCTGGGTAAAGATATCGCCGGTGAGCCGGTGGTTGCCGATCTGGCGAAAATGCCGCACTTGTTGGTTGCGGGGACTACCGGTTCCGGTAAATCTGTCGGTGTGAACGCGATGATCCTGAGCATGCTTTATAAAGCACAGCCAGAAGATGTGCGTTTCATCATGATCGACCCGAAAATGCTGGAGCTTTCGGTTTATGAAGGCATTCCGC > NC_000913/936085‑936332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |