| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,936,381 | C→T | T35M (ACG→ATG) | rbsB → | D‑ribose ABC transporter periplasmic binding protein, ribose chemotaxis receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,936,381 | 0 | C | T | 100.0% | 145.5 / NA | 43 | T35M (ACG→ATG) | rbsB | D‑ribose ABC transporter periplasmic binding protein, ribose chemotaxis receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (17/26); total (17/26) | |||||||||||
ACTACAGGACATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCACGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTGGACTCCCAGAACAACCCGGCGAAAGAGCTGGCGAACGTGCAGGA > NC_000913/3936259‑3936507 | aCTACAGGACATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTc > 2:579413/1‑139 (MQ=255) cAGGACATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTg < 2:355557/139‑1 (MQ=255) ggACATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTa < 1:579413/139‑1 (MQ=255) cATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCg > 1:577798/1‑139 (MQ=255) cATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCg < 2:577798/139‑1 (MQ=255) cATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCg > 2:507317/1‑139 (MQ=255) aTCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGtt < 1:7216/128‑1 (MQ=255) aTCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGtt > 2:7216/1‑128 (MQ=255) cTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTg > 2:556911/1‑139 (MQ=255) cTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTg > 2:10466/1‑139 (MQ=255) atatGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAAccc < 2:594958/118‑1 (MQ=255) atatGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAAccc > 1:594958/1‑118 (MQ=255) tGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTGAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATgg < 2:270788/139‑1 (MQ=255) cATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCGATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGgcgcg < 2:514968/139‑1 (MQ=255) gAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTaacaac > 2:530595/1‑106 (MQ=255) gAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTaacaac < 1:530595/106‑1 (MQ=255) aaaaCTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGaaa < 1:507317/139‑1 (MQ=255) tACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGTGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGAt < 2:158334/139‑1 (MQ=255) tGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACt < 1:10466/139‑1 (MQ=255) tCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCt < 2:372419/139‑1 (MQ=255) gCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCtata > 2:323714/1‑139 (MQ=255) gcgcTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCtgg < 2:551252/139‑1 (MQ=255) aGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGc < 2:190382/139‑1 (MQ=255) cgcCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTg > 1:671481/1‑139 (MQ=255) gcCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTgg < 1:323714/139‑1 (MQ=255) gcCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTgg < 1:556911/139‑1 (MQ=255) gAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTaacaac < 2:415649/52‑1 (MQ=255) gAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGAGGTCTCCATGCTTaacaac > 1:415649/1‑52 (MQ=255) aTGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTGGACTCCCAGAACAACCCGGCGa > 1:355383/1‑139 (MQ=255) ggCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTGGACTCCCAGAACAACCCGGCGaaa < 1:365013/139‑1 (MQ=255) cacCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGa > 2:323491/1‑57 (MQ=255) cacCATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGa < 1:323491/57‑1 (MQ=255) cATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTgg > 1:609976/1‑104 (MQ=255) cATCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTgg < 2:609976/104‑1 (MQ=255) tCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAAGAACCCGTTCTTTGTa < 1:467703/41‑1 (MQ=38) tCGCGCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTCGTa > 2:467703/1‑41 (MQ=255) cgcgCTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTGGACCCCCAGAACAACCCGGCGAAAGAGCTGGCGAACGTg < 2:257753/139‑1 (MQ=255) cgcgCTGGTAGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTGGACTCCCAGAACAACCCGGCGAAAGAGCTGGCGAACGTg < 1:480486/139‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTAt < 1:104304/37‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTAt > 2:104304/1‑37 (MQ=255) tggtggTCTCCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTGGACTCCCAGAACAACCCGGCGAAAGAGCTGGCGAACGTGCAGGa < 2:671481/139‑1 (MQ=255) tcCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAAc < 2:264280/64‑1 (MQ=255) tcCATGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAAc > 1:264280/1‑64 (MQ=255) | ACTACAGGACATCTTGAATATGAACATGAAAAAACTGGCTACCCTGGTTTCCGCTGTTGCGCTAAGCGCCACCGTCAGTGCGAATGCGATGGCAAAAGACACCATCGCGCTGGTGGTCTCCACGCTTAACAACCCGTTCTTTGTATCGCTGAAAGATGGCGCGCAGAAAGAGGCGGATAAACTTGGCTATAACCTGGTGGTGCTGGACTCCCAGAACAACCCGGCGAAAGAGCTGGCGAACGTGCAGGA > NC_000913/3936259‑3936507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |