Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,547,591 | T→C | F307L (TTC→CTC) | murP → | N‑acetylmuramic acid permease, EIIBC component, PTS system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,547,591 | 0 | T | C | 100.0% | 253.0 / NA | 66 | F307L (TTC→CTC) | murP | N‑acetylmuramic acid permease, EIIBC component, PTS system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (33/33); total (33/33) |
TCACCCTGCTGATCACCGCTACGCTTGCGTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGTTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGC > NC_000913/2547457‑2547723 | tCACCCTGCTGATCACCGCTACGCTTGCGTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCt > 2:199298/1‑139 (MQ=255) aTCACCGCTACGCTTGCGTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTgg > 1:790869/1‑139 (MQ=255) gCGTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGcc > 2:911741/1‑120 (MQ=255) gCGTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGcc < 1:911741/120‑1 (MQ=255) gCGTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATc > 1:1750483/1‑139 (MQ=255) gTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAg < 2:1272506/139‑1 (MQ=255) tGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCtt > 1:879635/1‑139 (MQ=255) gATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCtt > 2:658366/1‑138 (MQ=255) gATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCtt < 1:658366/138‑1 (MQ=255) aTCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTa < 2:1006075/139‑1 (MQ=255) tCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCt < 2:1328830/103‑1 (MQ=255) tCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCt < 2:268608/103‑1 (MQ=255) tCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCt > 1:490845/1‑103 (MQ=255) tCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCt < 2:490845/103‑1 (MQ=255) tCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCt > 1:268608/1‑103 (MQ=255) tCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCAGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCt > 1:1328830/1‑103 (MQ=255) tATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGTGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTa > 1:724217/1‑134 (MQ=255) tATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGTGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTa < 2:724217/134‑1 (MQ=255) tGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGt > 1:1765314/1‑139 (MQ=255) cTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTAtt < 2:1187030/107‑1 (MQ=255) cTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTAtt > 1:1187030/1‑107 (MQ=255) cTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTAcc > 1:431651/1‑139 (MQ=255) cTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTAcc > 1:1588333/1‑139 (MQ=255) cTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTAcc > 1:1480118/1‑139 (MQ=255) tGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCt < 2:879635/139‑1 (MQ=255) tATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGa < 2:1480118/139‑1 (MQ=255) cGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCTCCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAg < 1:1282907/103‑1 (MQ=255) cGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAg > 2:1282907/1‑103 (MQ=255) tATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGAGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGa < 2:1539560/139‑1 (MQ=255) tGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCg > 1:2151/1‑87 (MQ=255) tGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCg < 2:2151/87‑1 (MQ=255) tGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGAtt > 1:1507299/1‑139 (MQ=255) gTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGc < 1:630623/97‑1 (MQ=255) gTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGc > 2:630623/1‑97 (MQ=255) gTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGcc < 2:216673/131‑1 (MQ=255) gTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGcc > 1:216673/1‑131 (MQ=255) cATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCaa < 2:1765314/139‑1 (MQ=255) cATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCaa < 2:1750483/139‑1 (MQ=255) ggCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTAt > 1:919171/1‑97 (MQ=255) ggCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTAt < 2:919171/97‑1 (MQ=255) gCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCg < 2:1022032/80‑1 (MQ=255) gCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCg > 1:1022032/1‑80 (MQ=255) cTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGa > 1:1653366/1‑119 (MQ=255) cTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGa < 2:1653366/119‑1 (MQ=255) cTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAAc < 1:325337/135‑1 (MQ=255) cTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAAc > 2:325337/1‑135 (MQ=255) cTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCt > 2:1681843/1‑139 (MQ=255) tGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCtt < 2:431651/139‑1 (MQ=255) gCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTccc < 2:300147/139‑1 (MQ=255) tGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCt > 1:444583/1‑139 (MQ=255) gAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCtt < 1:1252067/139‑1 (MQ=255) aaCAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTcg < 1:671414/94‑1 (MQ=255) aaCAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTcg > 2:671414/1‑94 (MQ=255) aaCAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCt < 2:7652/124‑1 (MQ=255) aaCAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCt > 1:7652/1‑124 (MQ=255) tAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATg > 1:1241387/1‑139 (MQ=255) cGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCg > 1:1406585/1‑39 (MQ=255) cGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCg < 2:1406585/39‑1 (MQ=255) ttCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGgcg < 2:444583/139‑1 (MQ=255) ttCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGgcg < 2:1588333/139‑1 (MQ=255) ggTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGgcg < 1:910016/136‑1 (MQ=255) ggTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGgcg > 2:910016/1‑136 (MQ=255) ggTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCgg > 1:1705779/1‑139 (MQ=255) ccGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCAt > 1:927848/1‑103 (MQ=255) ccGGGCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCAt < 2:927848/103‑1 (MQ=255) gggCTGCTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGggcgcggcgc < 2:1507299/139‑1 (MQ=255) gctgctCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGa < 1:1734329/69‑1 (MQ=255) gctgctCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGa > 2:1734329/1‑69 (MQ=255) | TCACCCTGCTGATCACCGCTACGCTTGCGTACCTGATCATTATGCCGCTGGGTGGCTGGTTATTCGAAGGTATGTCATGGCTGTTTATGCACCTGAACAGTAATCCGTTCGGTTGTGCGGTTTTAGCCGGGCTGTTCCTGATCGCCGTGGTATTTGGCGTGCATCAGGGCTTTATTCCTGTTTACCTCGCGTTAATGGACAGCCAGGGATTCAACAGCTTATTTCCCATCCTTTCAATGGCAGGCGCGGGCCAGGTGGGCGCGGCGC > NC_000913/2547457‑2547723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |