| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 585,217 | C→T | W139* (TGG→TGA) | ompT ← | DLP12 prophage, outer membrane protease VII, outer membrane protein 3b |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 585,217 | 0 | C | T | 100.0% | 290.1 / NA | 83 | W139* (TGG→TGA) | ompT | DLP12 prophage, outer membrane protease VII, outer membrane protein 3b |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (48/35); total (48/35) | |||||||||||
GGGAAGGAGCCGATATCATCTCTGAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGG > NC_000913/585083‑585346 | gggAAGGAGCCGATATCATCTCTGAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGagtcagc < 2:1631243/139‑1 (MQ=255) aaGGAGCCGATATCGTCTCTGAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCGGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGACATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGGCtt < 2:1093791/139‑1 (MQ=255) aaGGAGCCGATATCATCTCTGAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCtt < 2:350348/139‑1 (MQ=255) gCCGATATCATCTCTGAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGata > 2:834558/1‑139 (MQ=255) atcTCTGAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATTAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCa > 2:37661/1‑139 (MQ=255) gAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCg > 1:30698/1‑139 (MQ=255) aaTCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGt < 1:588383/139‑1 (MQ=255) aTCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGtt > 2:6234/1‑139 (MQ=255) ctcctcAGAACTGTAGATATAGGATCCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGagtcagc > 1:1208935/1‑110 (MQ=255) ctcctcAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGagtcagc > 2:163340/1‑110 (MQ=255) ctcctcAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGagtcagc < 1:163340/110‑1 (MQ=255) ctcctcAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATCTTCAGATCAAATTCGTTGGCa > 1:1204462/1‑139 (MQ=255) ctcctcAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCa > 1:330943/1‑139 (MQ=255) ctcctcAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCa > 1:1465904/1‑139 (MQ=255) atcctcAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGagtcagc < 2:1208935/109‑1 (MQ=255) aaCTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGagtcagc < 2:900791/102‑1 (MQ=255) 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1:17154/1‑126 (MQ=255) aaCCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGtt < 2:17154/126‑1 (MQ=255) aaCCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATc > 1:854814/1‑133 (MQ=255) aaCCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATc < 2:854814/133‑1 (MQ=255) aaCCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGgt > 1:483959/1‑138 (MQ=255) aaCCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGgt < 2:483959/138‑1 (MQ=255) caccTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGtt > 2:228198/1‑123 (MQ=255) caccTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGtt < 1:228198/123‑1 (MQ=255) caccTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCt > 1:1186345/1‑139 (MQ=255) accTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAgg < 1:1274519/132‑1 (MQ=255) accTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAgg > 2:1274519/1‑132 (MQ=255) accTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTa > 1:1553645/1‑139 (MQ=255) accTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCAGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTa > 1:1067769/1‑139 (MQ=255) 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aaTTGGGTTCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATAtt < 1:1393455/139‑1 (MQ=255) ttCGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCt > 1:1735344/1‑139 (MQ=255) cGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGt > 1:502283/1‑39 (MQ=255) cGTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGt < 2:502283/39‑1 (MQ=255) gTTGAGGAGTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCgg < 2:30698/139‑1 (MQ=255) gagTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCt < 2:839495/130‑1 (MQ=255) gagTCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCt > 1:839495/1‑130 (MQ=255) | GGGAAGGAGCCGATATCATCTCTGAATCCCTCCTCAGAACTGTAGATATAGGAACCACCTCTGGCTGTAAAGCTATAACGGCTTTCCTGATATCCGGCCATGAGTCCCAGGCGGTAATTGGGTTCGTTGAGGAGCCAGCCTTTGATATTCAGATCAAATTCGTTGGCATAATTGAGTTGTGTATCAGGGTGTCTACTTTCATCCGTCCAGGTTCCGGGGTTACTGGAATCCATCCAGTCCTGATCGACCATATTGCCACCTCGG > NC_000913/585083‑585346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |