| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,386,276 | A→G | V638A (GTA→GCA) | aaeB ← | p‑hydroxybenzoic acid efflux system component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,386,276 | 0 | A | G | 98.9% | 332.6 / NA | 88 | V638A (GTA→GCA) | aaeB | p‑hydroxybenzoic acid efflux system component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (40/47); minor base T (1/0); total (41/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGTCACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTACCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATCACATGGTCTGC > NC_000913/3386140‑3386406 | cGTCACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGcc < 1:385954/139‑1 (MQ=255) tttCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCg < 2:1053107/139‑1 (MQ=255) tCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTTCCGGTTCCGTc > 2:1166247/1‑139 (MQ=255) aGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCgg < 2:1477191/139‑1 (MQ=255) tGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGgcg < 2:1574510/139‑1 (MQ=255) tGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGgcg < 2:1214238/139‑1 (MQ=255) cGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCtt > 1:701892/1‑139 (MQ=255) cATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTTCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCa < 1:1431222/139‑1 (MQ=255) aGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCttt > 2:1491876/1‑139 (MQ=255) ccATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTc < 2:47474/104‑1 (MQ=255) ccATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTc > 1:47474/1‑104 (MQ=255) cATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTcc < 1:249976/139‑1 (MQ=255) tGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTg > 2:512750/1‑139 (MQ=255) gAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGcc > 2:672666/1‑119 (MQ=255) gAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGcc < 1:672666/119‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAATGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGt > 1:112116/1‑139 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGt < 2:1220135/139‑1 (MQ=255) aCCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGAtt > 2:726620/1‑139 (MQ=255) cTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACACATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGtt < 1:875588/139‑1 (MQ=255) gACTTAACTATCGGTCAATGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCa < 2:112116/139‑1 (MQ=255) aCTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGgcg > 1:1287815/1‑77 (MQ=255) aCTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGgcg < 2:1287815/77‑1 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcga < 2:250444/139‑1 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcga < 1:1491876/139‑1 (MQ=255) cGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCa < 2:450922/128‑1 (MQ=255) cGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCa > 1:450922/1‑128 (MQ=255) ggTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGcc > 1:310167/1‑77 (MQ=255) ggTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGcc < 2:310167/77‑1 (MQ=255) aaCGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGt > 1:1337265/1‑48 (MQ=255) aaCGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGt < 2:1337265/48‑1 (MQ=255) aCGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGTTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGttt > 1:252873/1‑139 (MQ=255) cGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTcc > 2:1265374/1‑109 (MQ=255) cGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTa < 2:701892/139‑1 (MQ=255) cGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCACTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTcc < 1:1265374/109‑1 (MQ=255) cATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt < 2:428731/114‑1 (MQ=255) cATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt > 1:428731/1‑114 (MQ=255) gTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGt > 1:164639/1‑46 (MQ=255) gTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGt < 2:164639/46‑1 (MQ=255) ttATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 1:564616/139‑1 (MQ=255) ttATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg > 1:774621/1‑139 (MQ=255) ttATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 2:1249035/139‑1 (MQ=255) tATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg > 1:1324323/1‑138 (MQ=255) tATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 2:1324323/138‑1 (MQ=255) aTGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt > 1:1779443/1‑101 (MQ=255) aTGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt < 2:1779443/101‑1 (MQ=255) aTGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGacgacg < 1:1501532/120‑1 (MQ=255) aTGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGacgacg > 2:1501532/1‑120 (MQ=255) aTGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGc > 1:484366/1‑138 (MQ=255) aTGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGc < 2:484366/138‑1 (MQ=255) aTGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCa > 2:988921/1‑139 (MQ=255) tGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAg < 1:1517979/139‑1 (MQ=255) ggAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 2:743291/135‑1 (MQ=255) ggAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg > 1:743291/1‑135 (MQ=255) ggACCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGa > 2:1213573/1‑139 (MQ=255) aGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCa < 2:131044/53‑1 (MQ=255) aGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCa > 1:131044/1‑53 (MQ=255) gCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAg < 2:1528722/104‑1 (MQ=255) gCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAg > 1:1528722/1‑104 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCATCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt < 2:1060781/95‑1 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCAGCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt > 1:1060781/1‑95 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGc > 2:1779487/1‑56 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGc < 1:1779487/56‑1 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTcc > 2:1786344/1‑88 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTcc < 1:1786344/88‑1 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcgacg > 2:1122874/1‑111 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcgacg < 1:1122874/111‑1 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcgac < 1:478747/110‑1 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcgac > 2:478747/1‑110 (MQ=255) aTCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt > 2:1749081/1‑94 (MQ=255) aTCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt < 1:1749081/94‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAg > 2:1579610/1‑71 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAg < 1:1579610/71‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 2:1639603/129‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg > 1:1639603/1‑129 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac < 1:726620/139‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac > 2:1026342/1‑139 (MQ=255) ccccGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAg < 1:1138699/49‑1 (MQ=255) ccccGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAg > 2:1138699/1‑49 (MQ=255) ccccGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAg > 1:430550/1‑131 (MQ=255) ccccGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAg < 2:430550/131‑1 (MQ=255) ccccGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcaca > 2:106070/1‑139 (MQ=255) gCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac > 1:558404/1‑130 (MQ=255) gCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac < 2:558404/130‑1 (MQ=255) gCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATCACATGGTctgc < 1:1213573/139‑1 (MQ=255) ccGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCt > 1:1029216/1‑50 (MQ=255) ccGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCt < 2:1029216/50‑1 (MQ=255) ccGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg > 2:1175532/1‑119 (MQ=255) ccGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTAGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 1:1175532/119‑1 (MQ=255) | CGTCACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTACCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATCACATGGTCTGC > NC_000913/3386140‑3386406 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |