Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,574,101 | T→C | pseudogene (183/2937 nt) | yjiV → | pseudogene, conserved hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,574,101 | 0 | T | C | 100.0% | 344.4 / NA | 91 | pseudogene (183/2937 nt) | yjiV | pseudogene, conserved hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (40/51); total (40/51) |
ATCGATGTCTGTTCAGGGACTCAACCTAATGCAAAGGATCCCGCATTTCTTAAAGTCAGGGCGCATATCTTCCAGCGTAATACCTAGGGAATATGGGCTTGTGTTGATAAAGATTGCAGATTAAAGCACGGTACACCGCTCGACAAAGGCTGGCCCTTTGGCTATGTGTATGTGAACCAGCGACAAAATTGTGACTGTGGAAGCCCTGTATACGAAGTTGCATTCTGTAATGATTGTAATGAGCCTCATCTTCTGGCAC > NC_000913/4573970‑4574228 | aTCGATGTCTGTTCAGGGACTCAACCTAATGCAAAGGATCCCGCATTTCTTAAAGTCAGGGCGCATATCTTCCAGCGTAATACCTAGGGAATATGGGCTTGTGTTGATAAAGATTGCAGATTAAAGCACGGCACACCGc < 2:1491638/139‑1 (MQ=255) aTGTCTGTTCAGGGACTCAACCTAATGCAAAGGATCCCGCATTTCTTAAAGTCAGGGCGCATATCTTCCAGCGTAATACCTAGGGAATATGGGCTTGTGTTGATAAAGATTGCAGATTAAAGCACGGCACACCGCTCGa > 1:1653452/1‑139 (MQ=255) tGTCTGTTCAGGGACTCAACCTAATGCAAAGGATCCCGCATTTCTTAAAGTCAGGGCGCATATCTTCCAGCGTAATACCTAGGGAATATGGGCTTGTGTTGATAAAGATTGCAGATTAAAGCACGGCACACCGCTCGAc < 2:1299025/139‑1 (MQ=255) gTCTGTTCAGGGACTCAACCTAATGCAAAGGATCCCGCATTTCTTAAAGTCAGGGCGCATATCTTCCAGCGTAATACCTAGGGAATATGGGCTTGTGTTGATAAAGATTGCAGATTAAAGCACGGCACACCGCTCGACa < 2:176696/139‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |