| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,386,276 | A→G | V638A (GTA→GCA) | aaeB ← | p‑hydroxybenzoic acid efflux system component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,386,276 | 0 | A | G | 100.0% | 270.7 / NA | 73 | V638A (GTA→GCA) | aaeB | p‑hydroxybenzoic acid efflux system component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (33/40); total (33/40) | |||||||||||
CGTCACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTACCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATCACATGGTCTGCTGTG > NC_000913/3386140‑3386410 | cGTCACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGcc > 2:1338288/1‑139 (MQ=255) gTCACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCg < 1:1338288/139‑1 (MQ=255) gTCACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCg < 2:3950/139‑1 (MQ=255) cACGTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGt > 1:514122/1‑139 (MQ=255) gTTTCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTcc < 1:254538/139‑1 (MQ=255) ttCGCGGCGAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGt < 2:389554/139‑1 (MQ=255) gAGTTCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCg < 2:554297/139‑1 (MQ=255) tCTGCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCCTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTgg < 1:806567/139‑1 (MQ=255) gCCGTGCATCGCTAAGTATAGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGgcgc > 2:1470806/1‑139 (MQ=255) aGCCATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCttt > 2:1263063/1‑139 (MQ=255) ccATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCAc < 2:424684/106‑1 (MQ=255) ccATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCAc > 1:424684/1‑106 (MQ=255) ccATGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTc > 2:1263634/1‑139 (MQ=255) tGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCgg < 2:833329/109‑1 (MQ=255) tGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCgg > 1:833329/1‑109 (MQ=255) tGAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTg > 2:249343/1‑139 (MQ=255) gAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGTCAGATGCGTAGCTTTTCCTgg > 2:1390939/1‑139 (MQ=255) gAAAAAACCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTgg < 1:249343/139‑1 (MQ=255) gAAAAAACCGACGCTTTTGGCCTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTgg < 1:40834/139‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGtt > 1:25789/1‑94 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGtt < 2:25789/94‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGt > 1:460945/1‑139 (MQ=255) gACGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTcc > 1:1183087/1‑139 (MQ=255) cGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATg < 2:1223123/113‑1 (MQ=255) cGCTTTTGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATg > 1:1223123/1‑113 (MQ=255) tttGGCGTCGGTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCTAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGatct < 2:970299/139‑1 (MQ=255) ggTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAAc > 2:1048794/1‑139 (MQ=255) gTTTTGACTTAACTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACt < 2:514122/139‑1 (MQ=255) aaCTATCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTa > 2:1307249/1‑139 (MQ=255) aTCGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcga < 1:564501/139‑1 (MQ=255) cGGTCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACcgacg < 1:1470806/139‑1 (MQ=255) tCAACGCATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGacgacg < 2:930629/139‑1 (MQ=255) cATGTTGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTatc < 2:746909/139‑1 (MQ=255) ttGATACTTATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCg > 1:36673/1‑139 (MQ=255) ttATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 1:1263063/139‑1 (MQ=255) ttATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACggg < 2:301338/139‑1 (MQ=255) tATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGc < 2:991818/139‑1 (MQ=255) tATGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGc < 1:1307249/139‑1 (MQ=255) tGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCAc > 2:359255/1‑38 (MQ=255) tGGAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCAc < 1:359255/38‑1 (MQ=255) ggAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCaa < 1:1503016/97‑1 (MQ=255) ggAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCaa > 2:1503016/1‑97 (MQ=255) ggAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCACTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGa < 1:899100/139‑1 (MQ=255) gAGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGat < 2:36673/139‑1 (MQ=255) aGCATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGata > 1:241036/1‑139 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGacgacg > 2:1250824/1‑114 (MQ=255) cATCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGacgacg < 1:1250824/114‑1 (MQ=255) aTCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGacgacg < 1:174087/113‑1 (MQ=255) aTCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGacgacg > 2:174087/1‑113 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGt < 1:462337/38‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGt > 2:462337/1‑38 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTa < 2:785464/125‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACgg > 1:358891/1‑128 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACgg < 2:358891/128‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGc < 2:1239006/130‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGc > 1:1239006/1‑130 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGatat > 1:757442/1‑136 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGatat < 2:757442/136‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac > 1:932057/1‑139 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac < 1:1263634/139‑1 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac > 1:736253/1‑139 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac > 1:193294/1‑139 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac > 2:1376969/1‑139 (MQ=255) tCCCCGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGCTTATCATCGCTa > 1:785464/1‑125 (MQ=255) cccGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac > 2:341723/1‑137 (MQ=255) cccGCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATcac < 1:341723/137‑1 (MQ=255) gCCAGCCGATTTGCCGGTTCCGTCACCTGCGGTGGCGCTTGCCAGATGCGTAGCTTTTCCTGGTAGATTTCCAGTTCTTCCAGCAACTGGCCAAAGTACCGACGACGTTTATCATCGCTACGGGCAGATATCACATGGt < 2:764995/139‑1 (MQ=255) 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NC_000913/3386140‑3386410 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |