| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,366,245 | G→A | T106T (ACG→ACA) | arnB → | uridine 5'‑(beta‑1‑threo‑pentapyranosyl‑4‑ulose diphosphate) aminotransferase, PLP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,366,245 | 0 | G | A | 100.0% | 99.2 / NA | 29 | T106T (ACG→ACA) | arnB | uridine 5'‑(beta‑1‑threo‑pentapyranosyl‑4‑ulose diphosphate) aminotransferase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (17/12); total (17/12) | |||||||||||
TCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCGAACGTTACGGCATCGCA > NC_000913/2366115‑2366377 | tCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGt < 2:591840/139‑1 (MQ=255) ttGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTa > 1:96024/1‑139 (MQ=255) ttGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTc < 2:96024/139‑1 (MQ=255) ggTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCAt > 2:415534/1‑139 (MQ=255) ccTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGc > 2:439306/1‑100 (MQ=255) ccTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGc < 1:439306/100‑1 (MQ=255) ccTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGatat > 2:22694/1‑139 (MQ=255) ccTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGatat > 2:101751/1‑139 (MQ=255) ccTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGatat > 1:571850/1‑139 (MQ=255) ttgttgGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTg > 2:353732/1‑139 (MQ=255) gttgGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGAc < 1:353732/139‑1 (MQ=255) tGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTa < 2:250794/59‑1 (MQ=255) tGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTa > 1:250794/1‑59 (MQ=255) tGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCcagca < 1:449455/124‑1 (MQ=255) tGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCcagca > 2:449455/1‑124 (MQ=255) tGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCAtt > 1:588665/1‑139 (MQ=255) tGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCAtt > 1:463275/1‑139 (MQ=255) tGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCAtt > 2:423179/1‑139 (MQ=255) cAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTcg < 2:571850/139‑1 (MQ=255) cGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTa > 1:573633/1‑69 (MQ=255) cGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTa < 2:573633/69‑1 (MQ=255) cGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACt < 2:269283/80‑1 (MQ=255) cGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACt > 1:269283/1‑80 (MQ=255) aTGGTGGATGTCGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCg < 1:233643/139‑1 (MQ=255) cGACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCGAACGTTACGGc > 1:198352/1‑139 (MQ=255) gACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCGAACGTTa > 2:245662/1‑134 (MQ=255) gACCGCGATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCGAACGTTa < 1:245662/134‑1 (MQ=255) gcgATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCGAACGTTACGGCATCGc > 2:398622/1‑139 (MQ=255) cgATACACTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCGAACGTTACGGCATCGCa < 2:52916/139‑1 (MQ=255) | TCACGCTAATGGCGTTGAAAATTGGCAAGGGCGATGAAGTGATTACGCCTTCCCTGACCTGGGTTTCAACCCTCAATATGATTTCCTTGTTGGGTGCAACGCCGGTAATGGTGGATGTCGACCGCGATACGCTGATGGTCACGCCTGAAGCTATCGAGTCAGCCATTACGCCACGCACTAAAGCCATCATTCCGGTGCATTATGCCGGTGCGCCAGCAGATATTGACGCCATTCGCGCCATTGGCGAACGTTACGGCATCGCA > NC_000913/2366115‑2366377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |