| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 2,602,017 | (C)7→10 | coding (200/2019 nt) | hyfB → | hydrogenase 4, membrane subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2602010 | 4 (0.080) | 59 (1.100) +CCC |
32/200 | 0.4 | 93.6% | coding (193/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit |
| ? | NC_000913 | 2602011 = | 4 (0.070) | coding (194/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit | |||||
TCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTG‑‑CCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGG > NC_000913/2601878‑2602139 | tcgctgtttttactcggtctggacagactggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccccc < 1:709016‑M2/3‑1 (MQ=255) gtttttactcggtctggacagactggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccccccccctt < 2:399658‑M2/8‑3 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc > 2:809847‑M2/111‑139 (MQ=255) ctggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccccc > 2:447124‑M2/110‑112 (MQ=255) ctggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccccc < 1:447124‑M2/3‑1 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc > 2:653470‑M2/110‑139 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc < 1:1105855‑M2/30‑1 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc > 1:116976‑M2/110‑139 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc < 2:966745‑M2/30‑1 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc > 2:1146120‑M2/110‑139 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc > 2:1105855‑M2/110‑139 (MQ=255) actggctattaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc > 1:966745‑M2/110‑139 (MQ=255) attaagctttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGaa < 1:809847‑M2/36‑1 (MQ=255) tttccggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGc < 2:781611‑M2/44‑1 (MQ=255) cggcatcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctct < 1:1146120‑M2/48‑1 (MQ=255) tcacatcgctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCa > 2:455088‑M2/87‑139 (MQ=255) gctggtgggcggcgttattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg < 1:1020752‑M2/60‑1 (MQ=255) ctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccccc < 2:764835‑M2/3‑1 (MQ=255) ctggtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccccc > 1:764835‑M2/80‑82 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTGC‑CCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 1:664642/139‑1 (MQ=255) gtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgtttttccCCCCCCCTTTTGAATTTTCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 2:276276‑M2/76‑139 (MQ=255) gtgggcggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:247616‑M2/76‑139 (MQ=255) cggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAAttt > 2:640949‑M2/71‑87 (MQ=255) cggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAAttt < 1:640949‑M2/17‑1 (MQ=255) cggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGc < 1:1080245‑M2/19‑1 (MQ=255) cggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGc > 2:1080245‑M2/71‑89 (MQ=255) cggcgtgattggcatcatcagcggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa > 1:179415‑M2/71‑139 (MQ=255) gaaTTGGCATCTCCGGCGAATTTACGCAATAAC‑TGGTGGTGGTACCTTTTTAGCCCGGTTTTCCCCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTcc < 1:872759/137‑1 (MQ=255) agcggtattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcggccggtttgccCCCCCCCTTTTGTATTTCCCGATTTAACCCTGCGAATGGATCGCCTCTCGGCATATATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTggtgggggt < 2:116976‑M2/88‑1 (MQ=255) cggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccccc > 1:679206‑M2/51‑53 (MQ=255) cggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgcccccc < 2:679206‑M2/3‑1 (MQ=255) cggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccccc < 1:1173713‑M2/2‑1 (MQ=255) cggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccccc > 2:1173713‑M2/51‑52 (MQ=255) cggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg > 2:434986‑M2/50‑136 (MQ=255) cggaattacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg < 1:434986‑M2/87‑1 (MQ=255) ggaattacgcaattaaatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTg < 1:455088‑M2/91‑1 (MQ=255) attacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGc < 1:512539‑M2/52‑1 (MQ=255) attacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGc > 2:512539‑M2/46‑97 (MQ=255) attacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 1:456267‑M2/94‑1 (MQ=255) ttacgcaattacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtct < 2:247616‑M2/95‑1 (MQ=255) tacatgctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCa < 1:749974‑M2/104‑1 (MQ=255) gctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc < 1:364652‑M2/29‑1 (MQ=255) gctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc > 2:364652‑M2/31‑59 (MQ=255) gctggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGAc < 1:653470‑M2/109‑1 (MQ=255) tggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc > 2:218428‑M2/29‑77 (MQ=255) tggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc < 1:218428‑M2/49‑1 (MQ=255) tggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg < 2:67061‑M2/83‑1 (MQ=255) tggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 1:67061‑M2/29‑111 (MQ=255) tggtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACtt > 2:275327‑M2/29‑139 (MQ=255) gtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg > 1:1228335‑M2/27‑60 (MQ=255) gtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 2:1228335‑M2/34‑1 (MQ=255) gtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGc > 2:431144‑M2/27‑78 (MQ=255) gtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGc < 1:431144‑M2/52‑1 (MQ=255) gtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTtat > 1:1034602‑M2/27‑139 (MQ=255) gtgtaactttagtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTtat > 2:1078301‑M2/27‑139 (MQ=255) aGTCGCCC‑GTTTTGCCCCCCCCCTTTTGAATTTGc < 2:508312/35‑1 (MQ=255) aGTCGCCC‑GTTTTGCCCCCCCCCTTTTGAATTTGc > 1:508312/1‑35 (MQ=255) agtcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAAt > 2:981988‑M2/17‑139 (MQ=255) tcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAc < 1:981988‑M2/125‑1 (MQ=255) tcgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAc < 1:253051‑M2/125‑1 (MQ=255) cgcccgttttgccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACg < 1:276276‑M2/126‑1 (MQ=255) cgttttgcccCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATTCGCGAATACGAgg > 2:640841‑M2/11‑139 (MQ=255) | TCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCC‑GTTTTG‑‑CCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGG > NC_000913/2601878‑2602139 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |