Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 293,774 | 0 | A | . | 100.0% | 394.0 / NA | 95 | coding (145/699 nt) | yagL | CP4‑6 prophage, DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (56/39); total (56/39) |
GCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTAAAAAAATGAACGCATCTGATGCACTCCGGTGTCATAAATTATTTTTTGATACCTGAATAATGTCATTTTGCATAAAAAACAACCAAAAATAGAGAGTGATTGCCAGCGATACTTTAACTGGTAAAGTAGTATTT > NC_000913/293639‑293908 | gCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTaaaa > 2:870654/1‑139 (MQ=255) gCTCTGAAACAACCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGTaaaa > 2:1172607/1‑139 (MQ=255) caacCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACTTGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCTTATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGT‑AAAAAATGAACGc < 2:865996/139‑1 (MQ=255) acCTCTTTAATATCTACCTGCTCGATCACAACATGTTCAGGTAGAATATTAAATTTTTGGCATATCTCAGCAAGTGAGTGATGATCTGTAATGCTTTCTTGCTGTTCGCTACTGCATATGGTGT‑AAAAAATGAACGCAt > 1:1465544/1‑139 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |