| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,143,783 | T→C | L173P (CTG→CCG) | yegE → | putative diguanylate cyclase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,143,783 | 0 | T | C | 97.3% | 274.5 / ‑2.6 | 75 | L173P (CTG→CCG) | yegE | putative diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (43/30); total (44/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
GCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTT > NC_000913/2143647‑2143918 | gCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCgg > 2:949032/1‑139 (MQ=255)gCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCgg > 1:1495511/1‑139 (MQ=255) ggCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTg > 2:1611423/1‑138 (MQ=255) ggCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTg < 1:1611423/138‑1 (MQ=255) ttGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTg < 1:794351/128‑1 (MQ=255) ttGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTg > 2:794351/1‑128 (MQ=255) gTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACcac < 1:717667/139‑1 (MQ=255) gTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTa < 2:996536/122‑1 (MQ=255) gTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTa > 1:996536/1‑122 (MQ=255) tgtTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGTTTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCg > 1:268843/1‑138 (MQ=255) tgtTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGTTTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCg < 2:268843/138‑1 (MQ=255) ttCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCaa > 1:608835/1‑139 (MQ=255) ggTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCa < 2:362853/139‑1 (MQ=255) gTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGt > 2:1560623/1‑139 (MQ=255) tCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGtt > 2:1439974/1‑139 (MQ=255) ctgctgACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGc > 2:451800/1‑139 (MQ=255) tgctgACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCCGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTACCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCt > 2:1115204/1‑139 (MQ=255) gCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAg > 2:1576766/1‑139 (MQ=255) ccGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTc < 1:494621/139‑1 (MQ=255) cGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCg < 1:1576766/139‑1 (MQ=255) gagaCGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCgct > 1:333526/1‑139 (MQ=255) agaCGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCgctg < 1:1022475/139‑1 (MQ=255) cGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTc < 2:608835/139‑1 (MQ=255) ctcAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTAt > 2:783605/1‑73 (MQ=255) ctcAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTAt < 1:783605/73‑1 (MQ=255) tcAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGc < 2:1495511/139‑1 (MQ=255) gggCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCAt > 2:197678/1‑139 (MQ=255) gCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATca < 1:949032/139‑1 (MQ=255) ttttGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACt > 1:53169/1‑139 (MQ=255) ttttGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACt > 1:980294/1‑139 (MQ=255) gggTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAg > 2:7818/1‑139 (MQ=255) ggTACTGTTAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCGATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGc < 2:980294/139‑1 (MQ=255) ggTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGc > 2:1376117/1‑139 (MQ=255) ggTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGc > 2:330020/1‑139 (MQ=255) tGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGtt < 1:456306/112‑1 (MQ=255) tGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGtt > 2:456306/1‑112 (MQ=255) gTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTCTTTAAAcc < 2:1070593/54‑1 (MQ=255) gTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAAcc > 1:1070593/1‑54 (MQ=255) tCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGt < 2:19630/97‑1 (MQ=255) tCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGt > 1:19630/1‑97 (MQ=255) gAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGAc < 2:228993/122‑1 (MQ=255) gAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGAc > 1:228993/1‑122 (MQ=255) gAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCg > 1:487228/1‑138 (MQ=255) gAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCg < 2:487228/138‑1 (MQ=255) gAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGa > 1:545716/1‑139 (MQ=255) aaTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCgctgc > 1:304329/1‑99 (MQ=255) aaTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCgctgc < 2:304329/99‑1 (MQ=255) aaTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGAt > 1:399340/1‑139 (MQ=255) aaTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGAt > 2:1213148/1‑139 (MQ=255) aTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATg > 1:1345067/1‑139 (MQ=255) aTCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATg > 2:757824/1‑139 (MQ=255) tCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGc < 1:197678/139‑1 (MQ=255) ccATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGtt > 2:1450592/1‑79 (MQ=255) ccATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGtt < 1:1450592/79‑1 (MQ=255) cATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTg > 1:1367133/1‑139 (MQ=255) aTCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGt > 2:260384/1‑139 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACg < 1:761875/116‑1 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACg > 2:761875/1‑116 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAAc < 1:570306/42‑1 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAAc > 2:570306/1‑42 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCttt < 1:680940/129‑1 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCttt > 2:680940/1‑129 (MQ=255) tCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTa > 1:1297880/1‑139 (MQ=255) cGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTAt < 2:1345067/139‑1 (MQ=255) ctctGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTg < 1:116233/118‑1 (MQ=255) ctctGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTg > 2:116233/1‑118 (MQ=255) ctctGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGcc > 1:779270/1‑139 (MQ=255) ctGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGt > 2:1512895/1‑139 (MQ=255) tGGCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTg < 2:779270/139‑1 (MQ=255) ggCACTGGTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTgg < 1:260384/139‑1 (MQ=255) gTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACg > 2:825663/1‑99 (MQ=255) gTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACg < 1:825663/99‑1 (MQ=255) gTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTa > 2:38111/1‑139 (MQ=255) gTGCCGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTa > 1:943721/1‑139 (MQ=255) cGCCGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACttt < 1:1560623/139‑1 (MQ=255) | GCACTCGGCAGCGCCATTGTTCCGCCTCTGTTGGGGGGTGTTCTGGTTGTCCTGCTGACGCCCGGAGACGATCCTCTCAGGGCATTTTTGATATGGGTACTGTCAGAATCCATCGGCGCTCTGGCACTGGTGCCGCTGGGATTGTTATTTAAACCACACTATCTGCTGCGCCATCGCAACCCACGGTTGCTTTTTGAGTCGCTGCTCACGTTAGCCATCACACTGACGTTAAGCTGGCTTTCGATGCTGTATCTGCCGTGGCCTTTTACTTT > NC_000913/2143647‑2143918 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |