New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1022041 = | 37 (1.170) | 6 (0.200) | 6/234 | NT | 14.3% | intergenic (‑52/+40) | dppB/dppA‑I | dipeptide ABC transporter permease/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 1022070 = | 37 (1.240) | intergenic (‑81/+11) | dppB/dppA‑I | dipeptide ABC transporter permease/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
AGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAT > NC_002947/1021925‑1022219 | aGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgtt < 2:92707/150‑1 (MQ=255) catggctcatccaaagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgt < 2:732498‑M1/36‑1 (MQ=255) aaGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgtt > 2:234551/1‑150 (MQ=255) aGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgttg < 2:427130/150‑1 (MQ=255) gctcatccaaagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgttgtt > 1:732498‑M1/111‑150 (MQ=255) gTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgttgtt < 1:842268/150‑1 (MQ=255) gCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAACCTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACt < 1:32541/150‑1 (MQ=255) ccaaagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaccgccggtccccgtgtgggtggccggcggTCGTTGTTGTTCTACtt < 1:569083‑M2/17‑1 (MQ=255) gCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAgttgt > 2:182149/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAgttgtt < 2:739357/150‑1 (MQ=255) aacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttg > 1:55632‑M1/78‑112 (MQ=255) aacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttg < 2:55632‑M1/35‑1 (MQ=255) aGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAgttgttgtt > 1:132013/1‑150 (MQ=255) cGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCag > 2:559478/1‑150 (MQ=255) gggCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCaga < 1:360264/150‑1 (MQ=255) ggCAATAAAACTCAACATTGTCGGGTTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCagag < 1:583280/150‑1 (MQ=255) cAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAggg < 1:234551/150‑1 (MQ=255) aaTAAAACTCAACTTTGTCGGGGTTACCTCATCAGGGCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGt < 1:563553/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTcc > 1:49730/1‑150 (MQ=255) cttACCTCCTCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGtt < 1:70568/149‑1 (MQ=255) tcatcaGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGACGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACg > 2:513580/1‑150 (MQ=255) atcaGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAgttgtt < 2:2948/106‑1 (MQ=255) atcaGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAgttgtt > 1:2948/1‑106 (MQ=255) gCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTc < 1:427875/72‑1 (MQ=255) gCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTc > 2:427875/1‑72 (MQ=255) gCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTc < 2:56680/140‑1 (MQ=255) gCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTc > 1:56680/1‑140 (MQ=255) ggggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGaa < 1:559478/150‑1 (MQ=255) gCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACAt > 1:698946/1‑150 (MQ=255) tCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACg < 2:364426/123‑1 (MQ=255) tCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACg > 1:364426/1‑123 (MQ=255) tCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCttt < 2:49730/150‑1 (MQ=255) tCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGATGTCACGCATGGCGGTGAACATCttt < 1:331510/150‑1 (MQ=255) aagtagaacaacaacgaCCGCCGGCCACCCACACGGG‑GACCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTgg < 1:569083‑M1/133‑1 (MQ=255) ccGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCa > 1:315155/1‑104 (MQ=255) ccGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCa < 2:315155/104‑1 (MQ=255) aacaacaacgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGc > 1:732498‑M2/41‑150 (MQ=255) ggCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGaa < 2:841051/131‑1 (MQ=255) ggCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGaa > 1:841051/1‑131 (MQ=255) gCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGc > 1:535365/1‑150 (MQ=255) acaacgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATg < 2:732498‑M2/114‑1 (MQ=255) caacgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGtt < 2:55632‑M2/77‑1 (MQ=255) caacgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGtt > 1:55632‑M2/36‑112 (MQ=255) aGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGt > 2:351515/1‑125 (MQ=255) aGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGt < 1:351515/125‑1 (MQ=255) gTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGa < 1:182149/150‑1 (MQ=255) GCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCttt < 1:335326‑M1/129‑1 (MQ=255) GCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCttt > 2:335326‑M1/1‑129 (MQ=255) GCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAg < 1:733758‑M1/150‑1 (MQ=255) ccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGgttg < 2:569083‑M2/128‑1 (MQ=255) gggtggCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGc > 2:153843/1‑123 (MQ=255) gggtggCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGc < 1:153843/123‑1 (MQ=255) gCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTaca < 2:132013/150‑1 (MQ=255) tCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAt < 2:535365/150‑1 (MQ=255) tCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAt < 1:513580/150‑1 (MQ=255) | AGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTC‑CCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAT > NC_002947/1021925‑1022219 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |