New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
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ttcttcAAGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGAt > 1:558217/1‑150 (MQ=255) cttcAAGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAg > 1:1796472/1‑150 (MQ=255) ttcAAGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCTGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTg > 2:941716/1‑106 (MQ=255) ttcAAGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCTGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTg < 1:941716/106‑1 (MQ=255) tcAAGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGc > 1:1256255/1‑150 (MQ=255) cAAGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCt < 2:558217/150‑1 (MQ=255) aaGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGa > 2:1827112/1‑105 (MQ=255) aaGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGa < 1:1827112/105‑1 (MQ=255) gcagcTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGTGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTga > 1:546906/1‑150 (MQ=255) cagcTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTgaa < 1:1926324/150‑1 (MQ=255) cagcTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTgaa < 2:122327/150‑1 (MQ=255) cagcTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTgaa < 2:1796472/150‑1 (MQ=255) tCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGATCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTGaagaag < 1:441128/150‑1 (MQ=255) tCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTGaagaag > 2:334519/1‑150 (MQ=255) tCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTGaagaag < 2:1985002/150‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTGAAGAAGcc < 2:832238/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGgt > 2:778033/1‑107 (MQ=255) aGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGgt < 1:778033/107‑1 (MQ=255) gTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTGAAGAAGCCGACCt > 1:2337947/1‑150 (MQ=255) | CGGCATCCAGGCTCTTGGCCAGGTGCAGGTTGACCCGCGCTGCGTAGCTGGCGTGGCGCGTGGGCACCATTCCCTCGACCACAACCACGTCATTGCCGACGCAGGCTTGCTGGTAGAGGCGGATGATTTCTTCAAGCAGCTCGTCCAGTTGGCC‑ATCGCCGAGCATGCGCTCGACGTGGGCCAGGCTCAGTGGGACCGGTGGCTTGATGCCGTGAGTGCGGGCGACCAGTTCGGTGGAGCGCTCGGGGCCGGTGTCACCCGGGTGGGGCTGGGCGATAGGCTTGAAGAAGCCGACCT > NC_002947/893327‑893623 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |