New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
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aTCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTTCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTAt < 2:1185247/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATg > 2:2208492/1‑150 (MQ=255) cccGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCgagatcgg > 2:372562/1‑143 (MQ=255) cGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGt > 1:277228/1‑142 (MQ=255) gCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCgg < 1:1633733/150‑1 (MQ=255) 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> 2:1960577/1‑122 (MQ=255) acaTACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAggg < 1:1960577/122‑1 (MQ=255) acaTACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACg < 1:414988/150‑1 (MQ=255) tCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcg < 1:883059‑M2/88‑67 (MQ=255) cGGCACGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgcc > 2:185501‑M2/1‑20 (MQ=255) cGGCACGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgcc < 1:185501‑M2/65‑46 (MQ=255) gCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGt > 2:427006/1‑144 (MQ=255) gCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGt < 1:427006/144‑1 (MQ=255) cACGCCtctggaaagagggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactactgggtggtcagacgctggagatccaccgcatcgagcgggatgagcagatga < 1:1431899‑M1/150‑145 (MQ=255) aCGCCtctggaaagagggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactgctgggtggtcagacgctggagatccaccgcatcgagcgggatgagcagatgat > 2:983186‑M1/1‑5 (MQ=255) aCGCCtctggaaagagggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactgctgggtggtcagacgctggagatcca > 2:723134‑M1/1‑5 (MQ=255) aCGCCtctggaaagagggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactgctgggtggtcagacgctggagatcca < 1:723134‑M1/123‑119 (MQ=255) aCGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactgctgggtggt > 2:644565‑M2/1‑16 (MQ=255) aCGCCCTCTTTCCAGAggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactgctgggtggt < 1:644565‑M2/106‑91 (MQ=255) cGCCCTCTTTCCAGAGGCGGGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCTTGGTTCTGCACATCGTCAGCCCCGATCTCCTCTCGGTCTTTATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGAGCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTc < 2:595025/150‑1 (MQ=255) gCCtctggaaagagggcgtgccggagtatgtgcagctgcaggtgatgcaccagctcgccgtcaccggcaagcaggcggcggatgtagcagtactgctgggtggtcagacgctggagatccaccgcatcgagcgggatgagcagatgatcg > 1:1601976‑M1/1‑3 (MQ=255) gCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGtt < 2:468779/141‑1 (MQ=255) cccTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGGCGCTATGGATCCGGGTGCTGCAGGACGGCGTTGATGCGTCGa > 1:1055236/1‑150 (MQ=255) ccTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGaa > 1:1029461/1‑150 (MQ=255) | AGGCGAGCGATCATCTGCTCATCCCGCTCGATGCGGTGGATCTCCAGCGTCTGACCACCCAGCAGTACTGCTACATCCGCCGCCTGCTTGCCGGTGACGGCGAGCTGGTGCATCACCTGCAGCTGCACATACTCCGGCACGCCCTCTTTCCAGAGGCGTGCCCCGTTTATGCCGGCTGTCTTGCATTCCAGGATCTGCACATCGTCAGCCCCGATCACCTCGCGGTCGATATTGGCCAGCATCCAGGGCAGCTCTGGATCCGGGTGCTGCAGAACGGCGTTGATACGTCGAA > NC_002947/2844085‑2844376 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |