New junction evidence | |||||||||||
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GCTCGATATGGCCGCCTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAGTCCAACCTCAAGCAGGTGTGGCTGGAGT > NC_002947/2957787‑2958079 | tgtcgaacaccaggtttgggctcttgccgccgcactccagccacacctgcttgaggttggactgcgccgagtactgcatgaagtacttgcccacctgggtggagccggtgaataccaggcagtccacatccgggtgcaggcccagcgcct > 1:1914259‑M1/150‑150 (MQ=255) tcgaacaccaggtttgggctcttgccgccgcactccagccacacctgcttgaggttggactgcgccgagtactgcatgaagtacttgcccacctgggtggagccggtgaataccaggcagtccacatccgggtgcaggcccagcgccTGc < 2:1662190‑M1/3‑1 (MQ=255) tCGATATGGCCGCCTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGc < 1:527754/150‑1 (MQ=255) atatGGCCGCCTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCgg > 1:788821/1‑150 (MQ=255) atGGCCGCCTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCACTCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGc < 1:899416/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGAAGCTGGCCCCGGCGCCGGAGGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTg > 1:2245019/1‑150 (MQ=255) ccgccTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTgg < 2:1166699/150‑1 (MQ=255) ccgccTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTgg < 1:688371/150‑1 (MQ=255) gtttgggctcttgccgccgcactccagccacacctgcttgaggttggactgcgccgagtactgcatgaagtacttgcccacctgggtggagccggtgaataccaggcagtccacatccgggtgcaggcccagcgccTGc > 2:1687873‑M1/137‑139 (MQ=255) gtttgggctcttgccgccgcactccagccacacctgcttgaggttggactgcgccgagtactgcatgaagtacttgcccacctgggtggagccggtgaataccaggcagtccacatccgggtgcaggcccagcgccTGc < 1:1687873‑M1/3‑1 (MQ=255) gccTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGc < 2:2391143/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTgctcgc < 2:2108663/150‑6 (MQ=255) gAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCGAGCGCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCa < 1:139140/150‑1 (MQ=255) tcttgccgccgcactccagccacacctgcttgaggttggactgcgccgagtactgcatgaagtacttgcccacctgggtggagccggtgaataccaggcagtccacatccgggtgcaggcccagcgccTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGc > 1:74514‑M1/129‑150 (MQ=255) cccGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCa > 1:2088065/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAg > 2:862110/1‑150 (MQ=255) gctgCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGc > 1:1493813/1‑150 (MQ=255) tgCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGAGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCt < 2:623007/150‑1 (MQ=255) 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gcgcTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCg < 1:862110/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCCGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCg < 1:1132027/150‑1 (MQ=255) gcTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGgc > 2:1073664/1‑150 (MQ=255) gcTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGgc < 1:731865/150‑1 (MQ=255) gcTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTCGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGgc < 2:1416595/150‑1 (MQ=255) ggAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCa > 1:944026/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAg > 1:682547/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGGGGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAg < 2:1068331/150‑1 (MQ=255) aggcagtccacatccgggtgcaggcccagcgccTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCgg < 1:136372‑M1/25‑1 (MQ=255) aggcagtccacatccgggtgcaggcccagcgccTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCgg > 2:136372‑M1/34‑58 (MQ=255) aaGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAGt < 2:246891/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAGTcc > 1:1317792/1‑150 (MQ=255) tccacatccgggtgcaggcccagcgccTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGAtgt < 1:394893‑M1/52‑1 (MQ=255) tgtgCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAGTCCAACCt > 2:1596146/1‑150 (MQ=255) acatccgggtgcaggcccagcgccTGCCCGGCCTGCTCGCCCAGGCCCGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGa < 2:394893‑M1/55‑1 (MQ=255) ggAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTggg > 1:756922/1‑108 (MQ=255) ggAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTggg < 2:756922/108‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAGTCCAACCTCAAGCAGGTGTGGCTGGAgg > 1:1343748/1‑149 (MQ=255) | GCTCGATATGGCCGCCTGGAAGCTGGCCCCGGCGCTGGCTGCCGGTAACAGCGTGGTACTCAAGCCCGCCGAGCAATCACCGTTTTCGGCCCTGCGCCTGGCCCAGCTGGCGCTGGAAGCCGGTGTGCCGGAAGGCGTGCTGAACGTGGTGCCGGGCCTGGGCGAGCAGGCCGGGCAGGCGCTGGGCCTGCACCCGGATGTGGACTGCCTGGTATTCACCGGCTCCACCCAGGTGGGCAAGTACTTCATGCAGTACTCGGCGCAGTCCAACCTCAAGCAGGTGTGGCTGGAGT > NC_002947/2957787‑2958079 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |