New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TCGAGCGTCTGCCCCGAATAACAGGCCAGGACTTCGCCCATCAACTGCGACGTACTCCAGCCATCGAGCAAGATATGGTGGTAGGTCCAGATCAGTTGATGGCGCTGATCGTCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATGGCTCATCCAGGTCTTGCCA > NC_002947/4772305‑4772600 | gtggtggcgcgccacgacgtattgcgcaccggcttcctttggcaagacctggatgagccattgcagtacgtggtggggcagttgccactgccattgcgtgagctggactggcgcggtcgtggcgattgcgcgcaggcgctggaggcaCTg > 2:430064‑M1/148‑150 (MQ=255) ggtggcgcgccacgacgtattgcgcaccggcttcctttggcaagacctggatgagccattgcagtacgtgatggggcagttgccactgccattgcgtgagctggactggcgcggtcgtggcgattgcgcgcaggcgctggaggcaCTGGc > 2:355537‑M1/146‑150 (MQ=255) ggtggcgcgccacgacgtattgcgcaccggcttcctttggcaagacctggatgagccattgcagtacgtgatggggcagttgccactgccattgcgtgagctggactggcgcggtcgtggcgattgcgcgcaggcgctggaggcaCTGGc < 2:1400130‑M1/5‑1 (MQ=255) 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ccccGAATAACAGGCCAGGACTTCGCCCATCAACTGCGACGTACTCCAGCCATCGAGCAAGATATGGTGGTAGGTCCAGATCAGTTGATGGCGCTGATCGTCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGaa > 2:640657/1‑150 (MQ=255) ccccGAATAACAGGCCAGGACTTCGCCCATCAACTGCGACGTACTCCAGCCATCGAGCAAGATATGGTGGTAGGTCCAGATCAGTTGATGGCGCTGATCGTCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGaa > 2:839297/1‑150 (MQ=255) ccccGAATAACAGGCCAGGACTTCGCCCATCAACTGCGACGTACTCCAGCCATCGAGCAAGATATGGTGGTAGGTCCAGATCAGTTGATGGCGCTGATCGTCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGaa < 1:2000936/150‑1 (MQ=255) ccGAATAACAGGCCAGGACTTCGCCCATCAACTGCGACGTACTCCAGCCATCGAGCAAGATATGGTGGTAGGTCCAGATCAGTTGATGGCGCTGATCGTCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCt < 1:330515/136‑1 (MQ=255) ccGAATAACAGGCCAGGACTTCGCCCATCAACTGCGACGTACTCCAGCCATCGAGCAAGATATGGTGGTAGGTCCAGATCAGTTGATGGCGCTGATCGTCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCt > 2:330515/1‑136 (MQ=255) 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2:1502898/150‑1 (MQ=255) tCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGcccc > 2:1404360/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGtt > 2:580754/1‑69 (MQ=255) cAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGtt < 1:580754/69‑1 (MQ=255) aGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATc < 2:66890/150‑1 (MQ=255) gcgcACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCAc > 2:1577595/1‑150 (MQ=255) cgcACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACg < 2:451529/150‑1 (MQ=255) cACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTa < 1:1273277/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTAc < 1:683321/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTAc > 2:2051163/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGCCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCCCGCAATGGCAGTGCCAACTGCCCCATCACGTACt < 1:456369/150‑1 (MQ=255) gcagcaTGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTgg < 1:1643863/127‑1 (MQ=255) gcagcaTGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTgg > 2:1643863/1‑127 (MQ=255) agcaTGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAAt < 1:1404360/150‑1 (MQ=255) gcaTGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATg > 1:351207/1‑150 (MQ=255) caTGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATgg < 1:928285/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATGGc < 1:839297/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATgg < 1:1518001/148‑1 (MQ=255) cAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATGGCTCATCCAg < 1:2356658/150‑1 (MQ=255) ggcggcCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATGGCTCATCCAGGTCt < 1:2051163/150‑1 (MQ=255) gcCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTTGCCACTGccattgc > 2:2277201/1‑114 (MQ=255) ccTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATGGCTCATCCAGGTCTTGCCa > 1:196333/1‑150 (MQ=255) | TCGAGCGTCTGCCCCGAATAACAGGCCAGGACTTCGCCCATCAACTGCGACGTACTCCAGCCATCGAGCAAGATATGGTGGTAGGTCCAGATCAGTTGATGGCGCTGATCGTCCAGGCGCACCAGCAGCATGCGCTGCAGCGGCGGCCTGGCCAGGTCGAAGCCGCGTTCACGCTCTTCGTTGGCCAGTGCCTCCAGCGCCTGCGCGCAATCGCCACGACCGCGCCAGTCCAGCTCACGCAATGGCAGTGGCAACTGCCCCATCACGTACTGCAATGGCTCATCCAGGTCTTGCCA > NC_002947/4772305‑4772600 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |