New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3622266 | 111 (1.250) | 11 (0.140) | 9/222 | NT | 9.4% | intergenic (‑186/+40) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3622288 | 111 (1.390) | intergenic (‑208/+18) | PP_3192/PP_3193 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCAT > NC_002947/3622141‑3622433 | gACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGAGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAca < 2:1740132‑M2/150‑3 (MQ=255) tCTTTGCGGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCTGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaa > 2:718567‑M2/1‑142 (MQ=255) gCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcag < 2:1511382‑M2/140‑4 (MQ=255) gCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGt < 2:1002414/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGt < 2:2264932/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTg < 2:2075981/150‑1 (MQ=255) gggTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTgg < 2:2100559/150‑1 (MQ=255) tCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcagg < 2:2182263‑M2/135‑5 (MQ=255) gggATCAACGCCTGCCTTCGAGCCGCACGCCTCCGCCATTACTGGGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCTTCCGCAGCATGAGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAg > 2:992445/1‑150 (MQ=255) gATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTgg < 2:1291819/143‑1 (MQ=255) aTCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGc > 1:542701/1‑150 (MQ=255) aTCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGc > 1:1697913/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCt > 1:2182694/1‑150 (MQ=255) aGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGaa < 2:1863662/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGaa < 2:686402/150‑1 (MQ=255) gCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCGTTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATcgcc > 1:310395/1‑150 (MQ=255) gAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGt > 1:1860140/1‑150 (MQ=255) gAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGt > 2:310430/1‑150 (MQ=255) gAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGt > 2:190741/1‑150 (MQ=255) gCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCg < 2:700432/150‑1 (MQ=255) cGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGcc < 2:2182694/150‑1 (MQ=255) cTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGa < 1:137259/150‑1 (MQ=255) tCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGAt < 1:974226/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAg > 1:199346/1‑150 (MQ=255) gCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAc < 2:945595‑M2/96‑2 (MQ=255) cATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAgc > 1:296602/1‑150 (MQ=255) ttACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAgcgc > 2:2241955/1‑150 (MQ=255) cTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGTGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTc < 1:1720163/150‑1 (MQ=255) cTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAggg > 1:1321909/1‑111 (MQ=255) cTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAggg < 2:1321909/111‑1 (MQ=255) cTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTc > 2:862708/1‑150 (MQ=255) tGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGc < 2:1051196/138‑1 (MQ=255) tGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGc > 1:1051196/1‑138 (MQ=255) cGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGAt < 2:296588/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGAt < 2:296602/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGAt < 2:787484/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATg < 1:67670/150‑1 (MQ=255) gTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATg > 2:487141/1‑150 (MQ=255) gcaTCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCcagca < 2:1850641/150‑1 (MQ=255) gcaTCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCcagca < 1:811716/150‑1 (MQ=255) cccAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCCCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAgcgc < 1:193061/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCTGCCAGATGCGTGCGCAGCATGGGGCGACCAACCCTTGGCCGGGATAAGCATAGTTGTT‑GTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGTCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAgcgcc > 2:1289544/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCca > 2:170524/1‑142 (MQ=255) ccAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAgcgcg > 1:734103/1‑150 (MQ=255) ctccAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCt < 1:486301/125‑1 (MQ=255) tccAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTc > 1:1433399/1‑150 (MQ=255) cAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGaa > 2:1537319/1‑90 (MQ=255) cAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGaa < 1:1537319/90‑1 (MQ=255) gagGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCg < 1:1732642/150‑1 (MQ=255) cGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCC‑C‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg < 1:2031860/150‑1 (MQ=255) gcagcaTGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg < 2:2348757/150‑1 (MQ=255) gcagcaTGGGGCGACCGCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGCAACACGCAGTGGCGTTTGGTCATGTCTTAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg < 1:1150765/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGGGGCGGCCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAGAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg < 2:428197/150‑1 (MQ=255) ggcgCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGTCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTTGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGc < 1:2321476/147‑1 (MQ=255) gggCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGcc > 2:580707/1‑87 (MQ=255) gggCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGcc < 1:580707/87‑1 (MQ=255) ggCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCa < 2:488270/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGAc > 1:1634793/1‑150 (MQ=255) cTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACg > 1:2370671/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTTAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCcagca > 2:824382/1‑108 (MQ=255) tCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCTCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGCCGc < 2:310395/150‑1 (MQ=255) tCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCcagca < 1:824382/108‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCa < 1:563251/120‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCa > 2:563251/1‑120 (MQ=255) ccTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGa > 2:1427615/1‑150 (MQ=255) cTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGAt < 2:494044/150‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCACACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGAt > 2:1644329/1‑150 (MQ=255) ttGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATc > 2:988733/1‑78 (MQ=255) ttGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATg > 1:1243288/1‑150 (MQ=255) ttGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATg > 1:268147/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaat > 2:1895544‑M2/1‑28 (MQ=255) ggCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaat < 1:1895544‑M2/98‑71 (MQ=255) gCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGTGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGAc < 2:469437/140‑1 (MQ=255) gCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGAc > 1:469437/1‑140 (MQ=255) ccTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGaa > 1:1683521/1‑54 (MQ=255) ccTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGaa < 2:1683521/54‑1 (MQ=255) ccTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGgcgc > 2:1248555/1‑150 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagatccgt < 1:2193557‑M2/150‑126 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgag < 1:1262653‑M2/107‑83 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgag > 2:1262653‑M2/1‑25 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctgga < 2:1770332‑M2/67‑43 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctgga > 1:1770332‑M2/1‑25 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGa > 2:1824668/1‑80 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGa < 1:1824668/80‑1 (MQ=255) cTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGcc > 1:917517/1‑150 (MQ=255) tGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagat < 1:10263‑M2/145‑122 (MQ=255) tGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAAcaggccaaggcgaggtcgccccatgctgcggatgcctctggaggacctgggatgctgctgacgcagtaatggccgaggcgagcggctcgcagccaggccttgatcccgacccggcaaagat > 2:10263‑M2/1‑24 (MQ=255) cTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCcagc > 2:2368576/1‑150 (MQ=255) tCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCcagca < 1:2241955/150‑1 (MQ=255) tCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCcagca > 1:1555684/1‑150 (MQ=255) ccGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCcagcag < 1:2169725/150‑1 (MQ=255) gC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGc < 2:2370671/150‑1 (MQ=255) gC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGACCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg < 1:2316421/116‑1 (MQ=255) gC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGACCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAg > 2:2316421/1‑116 (MQ=255) cAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGa < 1:948830/150‑1 (MQ=255) tgttgGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCtt < 2:1555684/150‑1 (MQ=255) gttgGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTc > 2:1537207/1‑150 (MQ=255) ggtggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCa < 2:331377/115‑1 (MQ=255) ggtggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCCTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCa > 1:331377/1‑115 (MQ=255) tggAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGACGCTCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCAt > 2:709069/1‑150 (MQ=255) | GACGGATCTTTGCCGGGTCGGGATCAAGGCCTGGCTGCGAGCCGCTCGCCTCGGCCATTACTGCGTCAGCAGCATCCCAGGTCCTCCAGAGGCATCCGCAGCATGGGGCGACCTCGCCTTGGCCTGGCTCCGC‑CAATTGTTGGTGGAACAGGCCAAGGCGTTGGCTCAGGGCTGAAGATCGCCGCTGTCGCCGATCAGCCCGAGCGCTTCGATGGCCAGCAGCGCGCACCGCTCATCGTTGTCCGAGGTATCGCCACTGACGCCGATGGCGCCCAGCAGGCGACCTTCTGCAT > NC_002947/3622141‑3622433 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |