New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_002947 | = 4345623 | 96 (1.080) | 7 (0.080) | 6/238 | NT | 7.4% | coding (1155/1308 nt) | PP_3818 | phosphate‑binding protein |
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ACAGAGTACCTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGTGCGCATGGTCACGAACTCTTCGGC > NC_002947/4345525‑4345818 | aCAGAGTACCTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTggcg < 2:843277‑M2/150‑5 (MQ=255) agTACCTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCATGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGgtgt < 1:2296853/150‑1 (MQ=255) agTACCTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGgtgt < 1:241730/150‑1 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGtt > 2:587716/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCa < 1:1482395/150‑1 (MQ=255) cTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAg < 2:810867/150‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAg < 1:1382872/149‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAg > 2:1382872/1‑149 (MQ=255) gcCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGa > 2:1959416/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGAcc > 1:2409515/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGAcc > 1:2203724/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCg > 1:1219370/1‑150 (MQ=255) gCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCggg > 2:1164499/1‑150 (MQ=255) 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gCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCgg < 1:1164499/150‑1 (MQ=255) gtggGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAAt < 2:2156759/150‑1 (MQ=255) gtggGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAAt > 2:2121852/1‑150 (MQ=255) gtggGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGAGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAAt > 2:1890819/1‑150 (MQ=255) tggGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATg < 2:1739745/150‑1 (MQ=255) 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tcCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGgtg > 1:1028939/1‑150 (MQ=255) tcCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGgtg > 1:431536/1‑150 (MQ=255) tcCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gagagcagggctgcgcgcccaggggtttcctttgggtcgccgaaccccaccagcactgccttgccctgcagcttcccggcctggcgcaggtactctgtcacccgctgcac < 2:1621663‑M2/150‑111 (MQ=255) cTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGa < 1:669225/150‑1 (MQ=255) cgcAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAg < 2:885905/150‑1 (MQ=255) 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1:807415/150‑1 (MQ=255) ccgcGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGTgc < 2:1219370/150‑1 (MQ=255) cgAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGTGCGCa < 1:1959416/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGTGCGCATGGt < 2:2384136/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGatcat > 2:1417136/1‑126 (MQ=255) tGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGatcat < 1:1417136/126‑1 (MQ=255) gTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCa < 2:1606131/42‑1 (MQ=255) gTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCa > 1:1606131/1‑42 (MQ=255) gTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGTGCGCATGGTCACGAAct < 2:1215676/143‑1 (MQ=255) gTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGTGCGCATGGTCACGAAct > 1:1215676/1‑143 (MQ=255) gTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGGCGAGGTGTGGGGGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGGGCGCATGGTCACGAACTCTTCGgc > 1:308344/1‑150 (MQ=255) | ACAGAGTACCTGCGCCAGGCCGGGAAGCTGCAGGGCAAGGCAGTGCTGGTGGGGTTCGGCGACCCAAAGGAAACCCCTGGGCGCGCAGCCCTGCTCTCCCGCCTACGTGCGCAAGCGGTGCGCCGCGAACTGGCGCGCGGTGGCGTGGAGGTGTTGCAGGTGACCGGGATGGGCGATGAACTACCAGTGGCCGGGAATGAACTGGAGCAAGGCCGGCTGCGCAACCGGCGGGTCGAGGTGTGGGTGTATTGATCATCAGCGGGTGACGGTGCGCATGGTCACGAACTCTTCGGC > NC_002947/4345525‑4345818 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |