Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,165,997 | A→C | 5.5% | Q129P (CAG→CCG) ‡ | PP_2780 → | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,165,997 | 0 | A | C | 5.5% | 390.3 / 8.9 | 129 | Q129P (CAG→CCG) ‡ | PP_2780 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/66); new base C (4/3); total (59/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CCGCTTTGGCTGGATCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGG > NC_002947/3165848‑3166146 | ccGCTTTGGCTGGATCGCGGCCACCCAAGCCCTTGCCGCTTGAGGTCTCACTTCTTAACAGTTGCGTGGCTTGTCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCa > 1:2224455/1‑150 (MQ=255) ccGCTTTGGCTGGATCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATGGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCa < 1:630745/150‑1 (MQ=255) gCTGGATCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGt > 2:2009884/1‑150 (MQ=255) cTGGATCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCCTGCGCCggg < 1:180979/150‑3 (MQ=255) tGGATCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCCTGCGCCggg > 2:1712267/1‑147 (MQ=255) tGGATCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCCTGCGCCggg < 1:1712267/149‑3 (MQ=255) tCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCNCGAANAGTNGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTggg > 1:2300348/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTggg > 2:2350409/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTggg < 2:701313/150‑1 (MQ=255) ggcACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCaa < 2:1862204/148‑1 (MQ=255) gCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCaa < 2:2022698/150‑1 (MQ=255) ccACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAAt < 1:154462/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGAt > 2:2196191/1‑150 (MQ=255) cAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATg > 2:141020/1‑150 (MQ=255) gCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAg > 2:2247124/1‑123 (MQ=255) gCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAg < 1:2247124/123‑1 (MQ=255) gCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGgcg > 1:2250995/1‑150 (MQ=255) cATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGCTGC‑AAGAACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGACTCAATTGATGGcgcg > 1:1955880/1‑150 (MQ=255) ttGCCGATAGTGGTCTGAGCCGCGAACCGTTGCGTGGCGCGGGGGTATTGTCAGCGGCCGGCGCACCTGCTCATCGGTTG‑CAGTTCATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCACTTGATGACGTGat < 2:226393/150‑2 (MQ=255) ttGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGAc > 2:1805407/1‑150 (MQ=255) cGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGgc > 2:1144835/1‑150 (MQ=255) gATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGgcg > 1:1849244/1‑150 (MQ=255) cgtcgTCTGAGCCTCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCCGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAg < 2:2309911/146‑1 (MQ=255) tGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCCTGCGCCgggtt < 2:1451497/114‑5 (MQ=255) tGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCCTGCGCCgggtt > 1:1451497/1‑110 (MQ=255) tGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATc > 2:731857/1‑150 (MQ=255) tGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATc < 1:610664/150‑1 (MQ=255) tGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATc < 1:2009884/150‑1 (MQ=255) tGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGACCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATc < 1:1609117/150‑1 (MQ=255) gCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTg < 1:7371/150‑1 (MQ=255) ccGAACAGTTGCGTGGCTCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTAAGTCAGGA‑TGACCACGCAGCCGGGCGGATAATCCGGCGCAGGAGCCCTACCGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACa < 1:2350409/150‑1 (MQ=255) ccGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACa < 2:887764/150‑1 (MQ=255) cGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAg > 1:89303/1‑150 (MQ=255) cGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTAGTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATGGATGGCGCGACAGGCGCAAGTCGATCCTGACAg > 2:1780460/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGTACCTGCTAATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCa < 1:852463/150‑1 (MQ=255) ttGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTg > 2:2057467/1‑150 (MQ=255) tGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTCCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGc < 1:1135347/150‑1 (MQ=255) tgTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGt < 1:2318133/149‑1 (MQ=255) cGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGc < 2:1826549/148‑1 (MQ=255) cGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGt < 2:1784105/150‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCa < 1:2238644/150‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCaga < 2:2300348/150‑1 (MQ=255) ggcggTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCaa < 2:135038/150‑1 (MQ=255) gcggTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAAc < 2:1575125/150‑1 (MQ=255) aGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTgc < 2:1193267/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCggg < 2:2224455/150‑1 (MQ=255) ggCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTAAGAGCAACGAGCGCATTacggtagga > 2:2317641/1‑144 (MQ=255) gcgcACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGa > 1:954218/1‑150 (MQ=255) gcACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGAtt < 1:1774038/150‑1 (MQ=255) gCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGAt < 2:1849244/150‑1 (MQ=255) 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g‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATg < 1:484792/140‑1 (MQ=255) g‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATg > 2:484792/1‑140 (MQ=255) g‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCggacc < 1:1891934/150‑4 (MQ=255) g‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaa < 1:2317641/150‑2 (MQ=255) g‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaa < 1:141020/150‑2 (MQ=255) cAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGAt < 2:1601849/138‑1 (MQ=255) cAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGt < 2:1182936/150‑1 (MQ=255) cAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGGTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGAt > 1:1601849/1‑138 (MQ=255) aGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATc < 1:996554/143‑1 (MQ=255) aGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTg > 2:1949928/1‑150 (MQ=255) gACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCggg < 2:766345/124‑1 (MQ=255) gACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCggg > 1:766345/1‑124 (MQ=255) aTGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGc > 1:643307/1‑150 (MQ=255) gctgctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAg < 1:329028/146‑1 (MQ=255) gctgctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAg > 2:329028/1‑146 (MQ=255) tgctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCgg > 1:1904414/1‑150 (MQ=255) 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aGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATc > 2:1780501/1‑150 (MQ=255) tccTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCa < 1:1956188/79‑1 (MQ=255) gCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCa > 2:1956188/1‑80 (MQ=255) ccTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCaa > 1:1992959/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCaa < 1:1805407/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAAt < 2:2250995/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGc < 1:181548/98‑1 (MQ=255) tGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGc > 2:181548/1‑98 (MQ=255) gCGGATACCCCGGCGAAGCGGCCGCCCTGGCCTAAATTGTTGGCGCGACAGCCGAAGGCCGATCCTCACAGTTCACTGCGTAAGAGCAACGACCCCCTTGCGCGGGGGATTGCCGATGGAATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTc < 2:954218/150‑1 (MQ=255) cGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTca < 2:283364/150‑1 (MQ=255) cGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTca < 1:1780501/150‑1 (MQ=255) ggATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACt < 1:2121340/75‑1 (MQ=255) ggATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACt > 2:2121340/1‑75 (MQ=255) ggATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcag > 1:1384100/1‑150 (MQ=255) gATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcagc < 1:1272728/150‑1 (MQ=255) aggacGGCGCCTGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCagcagc > 2:501258/5‑150 (MQ=255) cccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTCCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTAATCAATGTCATCAgcgc < 2:1955880/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGcc > 1:742888/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaatca < 2:1262267/122‑5 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaatca > 1:1262267/1‑118 (MQ=255) cAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGcgcg < 1:693601/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCgg < 1:852253/150‑1 (MQ=255) | CCGCTTTGGCTGGATCGCGGCCACCCAAGCCATTGCCGATAGTGGTCTGAGCCCCGAACAGTTGCGTGGCGCGGCGGTATTGTCAGCGTCCGGCGCACCTGCTCATCGTTTG‑CAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTGCGCGG > NC_002947/3165848‑3166146 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |