Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,427,336 | T→A | 7.9% | D272V (GAC→GTC) | rhlE‑I ← | ATP‑dependent RNA helicase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,427,336 | 0 | T | A | 7.9% | 456.9 / 20.4 | 149 | D272V (GAC→GTC) | rhlE‑I | ATP‑dependent RNA helicase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (59/78); new base A (4/8); total (63/86) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.61e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GCAGGTCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCACCAG > NC_002947/5427187‑5427484 | gCAGGTCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGt > 2:1080885/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGt > 2:1322850/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGCCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTCGAGGGTGGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGc < 1:193321/150‑1 (MQ=255) aGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGCTGACGTCGGCATTc < 2:2210991/150‑1 (MQ=255) gTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCAc > 2:2347143/1‑150 (MQ=255) ttGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACTGCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGAATGCCGACGGCATCCACg < 1:872010/150‑1 (MQ=255) ttGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGAATGCCGACGGCATCCACg < 1:1830462/150‑1 (MQ=255) acCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGAATGCCGACGGCATCCACggtgacc < 1:1049868/150‑7 (MQ=39) cAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGAATGCCGACGGCAtcca > 1:1070972/1‑137 (MQ=255) cAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGAATGCCGACGGCATCCa > 2:2117224/1‑140 (MQ=255) gCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCa > 1:2187793/1‑150 (MQ=255) tCAACGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCGCTCGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCAACGTGGATGCCGTCGGCATTCCCGCCTTCGGCCAGCAAgcgc < 2:343058/150‑1 (MQ=39) aTCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGGGTGGATGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTc > 1:419265/1‑150 (MQ=39) aTCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTc < 1:778578/150‑1 (MQ=255) tCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTcc < 1:1080885/150‑1 (MQ=255) atatCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAg < 2:1758954/137‑1 (MQ=255) atatCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAg > 1:1758954/1‑137 (MQ=255) atatCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTccacc < 1:1154809/150‑1 (MQ=255) tatCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTccacca > 1:1243244/1‑150 (MQ=255) atCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAg < 2:131050/150‑1 (MQ=255) cAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGc > 2:1256460/1‑122 (MQ=255) cAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGc < 1:1256460/122‑1 (MQ=255) cAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTg > 2:612064/1‑150 (MQ=255) cAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTg > 2:2024095/1‑150 (MQ=255) aGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGACCCCGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTAGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGa > 1:1172216/1‑150 (MQ=255) ggCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGAt < 1:258981/150‑1 (MQ=255) gCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATc < 2:458989/150‑1 (MQ=255) gCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATc < 2:1925609/150‑1 (MQ=255) gCCACGGACCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATc > 2:527484/1‑150 (MQ=255) cccACTGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTCAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGCGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATc < 1:255346/149‑1 (MQ=255) ccACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTccac > 1:1542984/1‑140 (MQ=255) cACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGATGTTGAACGCACGCTTGCGTGGTGCCTTTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGa > 1:2100580/1‑150 (MQ=255) aCGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGAc > 2:1918793/1‑150 (MQ=255) gggCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGc < 1:1713395/150‑1 (MQ=255) ccACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCt > 1:38342/1‑135 (MQ=255) acctCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCgg < 2:1019723/147‑1 (MQ=255) acaTCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCa > 1:2298200/1‑103 (MQ=255) acaTCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCgg > 2:1864684/1‑150 (MQ=255) acaTCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCgg < 1:1764955/150‑1 (MQ=255) gTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCACACGTCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTg > 1:1811836/1‑150 (MQ=255) ccaGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCg > 1:774774/1‑98 (MQ=255) ccaGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAaca > 2:1236804/1‑150 (MQ=255) caGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAagac < 2:1200036/150‑1 (MQ=255) caGCACTTGCACCTCAAGGGCCTTGAAGATGTCCAGCGCACGCTGGCGGGGTGCCTGTGGGCGGTGACCGTGGATGCCGTCGGCATTAACGCCTTGGGCCAGCAAGCGCGCCACAAGCTGATCGACGACGTTGCGGGGCGTGGCGAacag > 2:2047013/1‑149 (MQ=255) gCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCgccaaaca < 2:1243244/150‑8 (MQ=255) cTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCa < 2:419265/150‑1 (MQ=255) cTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACAACAGCa < 2:1202608/150‑1 (MQ=255) ttGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCgg > 2:168352/1‑130 (MQ=255) ttGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCgg > 2:856844/1‑130 (MQ=255) ttGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCgg < 1:168352/130‑1 (MQ=255) ttGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGTCGAACACCAGCAc < 2:2394989/150‑1 (MQ=255) ttGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCAc > 1:940824/1‑150 (MQ=255) aCCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGc < 2:283010/150‑1 (MQ=255) cTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCtt > 1:2025885/1‑150 (MQ=255) aCGGGCCTTGAAGCTGTCCACCGCACGCTGGCGGGTTGCCGGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTGCCa < 1:1350989/150‑1 (MQ=255) cGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAg < 1:1236804/150‑1 (MQ=255) gCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGc > 2:1056861/1‑109 (MQ=255) ttGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAg < 2:1648049/144‑1 (MQ=255) gAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCtt > 2:1444170/1‑150 (MQ=255) cccgccAGCGTGCGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTgcgc > 2:40270/5‑150 (MQ=255) tCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTccac < 1:1189967/83‑1 (MQ=255) acttgcgcACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCgcagc > 2:1553081/5‑150 (MQ=255) ccAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCGCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCgcagca < 2:754883/150‑1 (MQ=255) aGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAgg < 1:2335605/150‑1 (MQ=255) gcgcACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGt > 1:857053/1‑150 (MQ=255) gcACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGACCGTGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTgg < 1:1956558/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGTATTCACCCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGCTCGACGCCATTGCGGGTCTTNGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCa < 1:677362/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGCCAGa > 2:1376571/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAAc < 1:474228/150‑1 (MQ=255) ggCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACa < 1:2024095/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAg > 1:1568018/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAg < 1:699159/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAg < 1:69435/146‑1 (MQ=255) gTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAg > 2:69435/1‑146 (MQ=255) gTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCa > 2:766608/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCa < 2:1841770/150‑1 (MQ=255) cTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCAGCCACCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCtt < 1:1467433/150‑1 (MQ=255) tgtgGGCGGTTACCGTTGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGTTCAGCCTTg < 2:1079711/150‑1 (MQ=255) gggCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCCCATACGGCTGCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTgcgc < 1:1376571/150‑1 (MQ=255) gggCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTgcgc < 1:1322850/150‑1 (MQ=255) gCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGctt < 2:1809402/150‑1 (MQ=255) cGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGcttc < 1:2347143/150‑1 (MQ=255) ggTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCAcc > 2:586498/1‑95 (MQ=255) ggTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCAcc < 1:586498/95‑1 (MQ=255) gTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGAAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCa < 2:1751047/89‑1 (MQ=255) gTCACCGTCGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGcttctt < 1:1037922/150‑1 (MQ=255) aCCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTc > 1:380310/1‑150 (MQ=255) cGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCca < 2:680483/150‑1 (MQ=255) gTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTg > 1:326937/1‑145 (MQ=255) gTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTg < 2:326937/145‑1 (MQ=255) gTGAATGCCGACGGCATCCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGc < 2:1174711/91‑1 (MQ=255) ggATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGt < 1:2369684/114‑1 (MQ=255) gATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCa < 2:1329108/80‑1 (MQ=255) aTGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCTATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGc < 2:1172216/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCa < 1:527484/150‑1 (MQ=255) cGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGcttctt < 1:2111191/136‑1 (MQ=255) cGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGcttctt > 2:2111191/1‑136 (MQ=255) cGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCACCa > 1:1180443/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCATGCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCACCa < 2:1811836/150‑1 (MQ=255) gTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCACCAg > 2:2209782/1‑150 (MQ=255) | GCAGGTCGAGGTTGACGACCAGCGGCAAGTCATCGATATCCAGGCCACGGGCCGCCACATCGGTCGCCACCAGCACTTGCACCTCACGGGCCTTGAAGCTGTCCAGCGCACGCTGGCGGGTTGCCTGTGGGCGGTCACCGTGGATGCCGTCGGCATTCACGCCTTCGGCCAGCAAGCGCTCCACCAGCTGATCGACGCCATTGCGGGTCTTGGCGAACACCAGCACCTGCTTCCAGCGCTGCTTGCGCAGCAGGTGGCAGAACAGGTCAGCCTTGCGCTTCTTGTCCACAGGCACCAG > NC_002947/5427187‑5427484 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |