Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,614,754 | A→C | 5.7% | I273M (ATT→ATG) | hldE ← | bifunctional heptose 7‑phosphate kinase/heptose 1‑phosphate adenylyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,614,754 | 0 | A | C | 5.7% | 464.3 / 10.4 | 153 | I273M (ATT→ATG) | hldE | bifunctional heptose 7‑phosphate kinase/heptose 1‑phosphate adenylyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/74); new base C (6/3); total (76/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.24e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
CCAGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAGGCGCCCAG > NC_002947/5614606‑5614903 | ccAGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCaa > 2:503555/1‑150 (MQ=255) aGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATg < 2:1404239/150‑1 (MQ=255) cgcgTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCgg < 2:1685039/150‑1 (MQ=255) gcgTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCATAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCCATTGCCGCggg < 2:905369/150‑2 (MQ=255) gcgTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGc < 1:115991/150‑1 (MQ=255) ttCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTCATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCCATTGCCGCgggtga < 2:1612866/150‑5 (MQ=255) tCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCACATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAgg < 2:1243802/150‑1 (MQ=255) ggAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGt < 1:165587/150‑1 (MQ=255) ggAGCCTTCCTCACGCTGGATCGCCCGGCGCAGCTCGGGGGCGCTGATCGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACGATGCCCGCCGCCAGGTTGGCCAGGGCCA‑CGGCGTGGGGCAGGTCCTCGCCGGCAGCGATGGCCGCGGCGAGGGt > 1:2216880/1‑150 (MQ=255) gAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTg > 2:1278528/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGa > 2:955426/1‑150 (MQ=255) cTTCCCGACGCGGGATGGCCCGGCGCAGTTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGaaa < 2:422186/150‑1 (MQ=255) ttCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAAt > 1:1495420/1‑150 (MQ=255) ccTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGa < 1:503555/150‑1 (MQ=255) cTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTACTCAACCGCGGAAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGaa > 2:2300083/1‑149 (MQ=255) tCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACa < 2:1495420/150‑1 (MQ=255) tCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACa > 1:959724/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAGATGACAGt > 1:1469904/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGt < 1:858317/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGATGGCCCGCCGCAGCTCAGGGGAGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGt > 2:703084/1‑150 (MQ=255) cGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTa < 1:1662312/150‑1 (MQ=255) cGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTa > 2:1363625/1‑150 (MQ=255) gCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTAt > 1:2150102/1‑150 (MQ=255) gCTGGATGGCCAGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTAt > 1:477959/1‑150 (MQ=255) aTGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCg < 1:1370123/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAggg > 1:1861114/1‑126 (MQ=255) cccGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAggg < 2:1861114/126‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCAACCATAAGGCCGGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCAcc > 2:340509/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTCGCCGACCACCCTCCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCAcc > 1:297451/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGt < 2:2044914/150‑1 (MQ=255) tCAGGGGCGCTGGTGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACa > 2:972851/1‑126 (MQ=255) aGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGaa < 2:428223/150‑1 (MQ=255) tGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc > 1:685207/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGt < 1:181231/130‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGt > 2:181231/1‑130 (MQ=255) aGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCcg > 2:1284107/1‑150 (MQ=255) tACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcag > 2:2770/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcaggca > 1:1928818/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcaggca > 1:524694/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcaggca > 1:569148/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCTGCTCGA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGGATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcaggcag < 1:634322/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcaggcag < 1:373644/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgcaggcag < 1:1671874/150‑1 (MQ=255) aGCTTGCCGACCACAATGACCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGATCCTCAACCACGGCAATAGCGGCAGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGGACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCgaaagcaag > 2:3135/1‑148 (MQ=255) gCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGAAAACAATGACGCAAGGCTGGAAGTGTCATTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGt < 1:2100355/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGc < 1:1363625/150‑1 (MQ=255) gCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCaa < 2:685207/150‑1 (MQ=255) cGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCAc < 1:2006017/105‑1 (MQ=255) cacaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGcc > 2:1441099/1‑67 (MQ=255) cacaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGaa > 1:2375574/1‑114 (MQ=255) cacaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCgg > 1:1071043/1‑150 (MQ=255) cacaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCgg > 2:2232670/1‑150 (MQ=255) acaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc > 1:1178085/1‑121 (MQ=255) acaATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc < 2:1178085/121‑1 (MQ=255) caATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTACTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCGCGCACAGGCAGGTGCAACGCCGGcc > 2:51518/1‑149 (MQ=255) aaTGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTg > 2:2385102/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTgcc > 2:1048428/1‑148 (MQ=255) tGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGAc < 2:840856/150‑1 (MQ=255) ccGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCACCCGCA‑CGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCCATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCaa > 1:64163/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCCCCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCaa > 2:1781934/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCaa < 1:689568/150‑1 (MQ=255) gCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAaca > 1:576764/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCa < 2:477959/150‑1 (MQ=255) gTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAg > 2:1190098/1‑150 (MQ=255) gTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAg < 2:524694/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGAc > 1:1033708/1‑132 (MQ=255) ccAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGAc < 2:1033708/132‑1 (MQ=255) cAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTAACTTCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcat < 1:1957466/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATAGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcat < 2:1929958/150‑1 (MQ=255) aGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCCCATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatg > 1:2394038/1‑150 (MQ=255) aGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGt < 1:2224195/115‑1 (MQ=255) aGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGt > 2:2224195/1‑115 (MQ=255) aGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatg < 2:626017/150‑1 (MQ=255) aGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatg > 1:779780/1‑150 (MQ=255) gCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgcca > 1:190157/1‑150 (MQ=255) cA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccatg < 1:1284107/150‑1 (MQ=255) cA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccatg > 1:2143241/1‑150 (MQ=255) a‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccatgc < 2:190157/150‑1 (MQ=255) a‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccatgc > 2:1918615/1‑150 (MQ=255) a‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTc > 1:2248415/1‑141 (MQ=255) cGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTc > 1:1019507/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc > 1:808235/1‑81 (MQ=255) gCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTcgc < 2:808235/81‑1 (MQ=255) gCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTcatgccat < 2:616696/138‑1 (MQ=255) cAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGt < 1:2770/150‑1 (MQ=255) gTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCgg > 1:2140403/1‑145 (MQ=255) gTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGAc < 2:779780/150‑1 (MQ=255) ctCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGGCCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGAc > 2:1651152/2‑150 (MQ=255) ccTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCa < 1:1190098/150‑1 (MQ=255) cTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAg < 2:2143241/150‑1 (MQ=255) cACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCa > 2:2073057/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCaa < 2:2145083/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGATAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAg < 1:1256944/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAg < 2:1137526/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCCATTGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAgg > 2:543859/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCCATTGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGACAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAgg > 2:1776328/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGcc > 2:1078661/1‑95 (MQ=255) ccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGcc < 1:1078661/95‑1 (MQ=255) ccGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAgg < 1:955426/150‑1 (MQ=255) aaTGGCCGCGGCAAGGGTAAAAAAGACAGTACACCCGACGGCAGTCGCATCGAATACTTCGTTTGCTCTGGCAGGCAGGTGCAACGCCTGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAGGCGCccag > 2:1481194/1‑150 (MQ=255) | CCAGCACGCCGCGTTCGGAGCCTTCCTCACGCTGGATGGCCCGGCGCAGCTCAGGGGCGCTGATGGCAGCCGTACCCAGCTTGCCGACCACAATGCCCGCTGCCAGGTTAGCCAGGGCCA‑CCGCATGGGGCAGGTCCTCACCCGCGGCAATGGCCGCGGCAAGGGTGGAAATGACAGTATCGCCGGCACCGGTCACATCGAACACTTCGCGTGCCCGCGCAGGCAGGTGCAACGCCGGCTGACCAACACGCAACAGGGTCATGCCATGCTCACCGCGGGTGACCAGCAAGGCGCCCAG > NC_002947/5614606‑5614903 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |