| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1419553 = | 11 (0.240) | 10 (0.290) | 9/200 | 2.7 | 53.6% | intergenic (‑36/+101) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1419647 = | 9 (0.260) | intergenic (‑130/+7) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
GTCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAA > NC_002947/1419404‑1419701 | gTCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTG < 1:817775‑M1/150‑1 (MQ=255)gTCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTG > 2:121519‑M1/1‑150 (MQ=255)gTCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGG‑TCAGTGGGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTG > 1:583721‑M1/1‑150 (MQ=255) ccTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGC < 2:119291‑M1/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCT > 1:18624‑M1/1‑150 (MQ=255) caaacccaccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGcc < 1:1013997‑M1/4‑1 (MQ=255) caccgcccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTcg < 2:604549‑M1/10‑1 (MQ=255) ccGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCAC < 2:589154‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCAC < 2:18624‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTG > 1:118941‑M1/1‑124 (MQ=255) tGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTG < 2:118941‑M1/124‑1 (MQ=255) gCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCA < 2:457166‑M1/150‑1 (MQ=255) gtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 2:364478‑M1/29‑1 (MQ=255) tgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcgttcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 1:364478‑M1/121‑150 (MQ=255) gatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg > 2:1089658‑M1/120‑150 (MQ=255) aaCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG < 1:906699‑M1/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG > 1:754694‑M1/1‑150 (MQ=255) atgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:1069823‑M1/119‑150 (MQ=255) gcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTa < 1:734563‑M1/34‑1 (MQ=255) gggTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG < 2:547204‑M1/144‑1 (MQ=255) gggTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG > 1:547204‑M1/1‑144 (MQ=255) gttgttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgt > 1:571585‑M1/1‑136 (MQ=255) ttttCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGC > 1:957107‑M1/1‑111 (MQ=255) ttttCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGC < 2:957107‑M1/111‑1 (MQ=255) gaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAc < 1:457276‑M1/50‑1 (MQ=255) gCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCtg > 1:1050141/1‑150 (MQ=255) ccTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCtgt > 1:950467/1‑150 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCtgtg < 2:1050141/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGTGTGGCCTGGGCTGGC < 2:849045‑M1/92‑1 (MQ=255) gTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGC > 1:849045‑M1/1‑92 (MQ=255) gAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcc < 1:525659‑M2/150‑3 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGTTTACcctgt > 2:583721‑M2/1‑145 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgt > 2:525659‑M2/1‑145 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgt > 2:950467‑M2/1‑145 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgt < 1:1004365‑M2/150‑6 (MQ=255) ggggtggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggccaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCtgtg > 1:604549‑M1/83‑150 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgtgg > 2:1004365‑M2/1‑143 (MQ=255) ggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtctGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTgg > 1:473740‑M1/82‑150 (MQ=255) ctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtctGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGa > 2:496817‑M1/80‑150 (MQ=255) tggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAg > 2:457276‑M1/79‑150 (MQ=255) ttaccgacTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGC > 2:284735‑M1/4‑87 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgtg > 1:344973‑M2/1‑138 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgtg < 2:344973‑M2/144‑7 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGC < 1:284735‑M1/87‑1 (MQ=255) tGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgtgggagcgg > 1:121519‑M2/1‑137 (MQ=255) tcgagaccgcgttgatgcagttgcagatgcgctcgcatttacccacagcgcctcacaccttgcattggcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGagccg > 2:19842‑M1/76‑148 (MQ=255) gCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCTGTTGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgtgggagcggg > 1:289754‑M2/1‑136 (MQ=255) cgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGAGCCTGTGGGAGCggg > 2:734563‑M1/75‑150 (MQ=255) ccGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggc < 2:795363‑M1/150‑46 (MQ=255) gagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCgg < 1:527110‑M1/75‑1 (MQ=255) gagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCgg > 2:527110‑M1/74‑148 (MQ=255) gACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgggcgt < 2:571585‑M1/150‑48 (MQ=255) gACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGAATATCGGCACGCCAGCCCAGCGTCTCCGCAGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGt < 1:369672/150‑1 (MQ=25) tgtgGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa > 2:889833/1‑109 (MQ=255) tgtgGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa < 1:889833/109‑1 (MQ=255) tttgcTGT‑TGTGTTGTCGCTGGGAATTGTTTTGTTCCCCTCACCACTCGGTTGTCAAGGATGGCCTCTTCGCGGGGGCGCCCGTTCCCACATGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAag < 2:59667/146‑1 (MQ=21) ttCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGTACTGTGCCGGGCGTGACTGGCTC‑GGTGACcctgtgggagccggcgtgcccgcgacgaa < 1:59667‑M2/150‑30 (MQ=255) ttCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgg < 2:557565‑M1/134‑44 (MQ=255) ttCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgg > 1:557565‑M1/1‑91 (MQ=255) ttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgg > 2:466249‑M1/1‑81 (MQ=255) ttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgg < 1:466249‑M1/124‑44 (MQ=255) ttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgg < 2:1007013‑M1/118‑38 (MQ=255) ttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgg > 1:1007013‑M1/1‑81 (MQ=255) tttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAg < 2:754694/150‑1 (MQ=255) cTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgg > 2:385109‑M1/1‑55 (MQ=255) cTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagcgg < 1:385109‑M1/98‑44 (MQ=255) tGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagc < 2:441209‑M1/88‑42 (MQ=255) tGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgtcaccacagccgtcacgcactgcacagtacctgtgggagc > 1:441209‑M1/1‑47 (MQ=255) cTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAgg > 2:749595/1‑126 (MQ=255) cTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAgg < 1:749595/126‑1 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgt < 2:615172‑M2/80‑18 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACcctgtgggagcgggcgt > 1:615172‑M2/1‑63 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCAGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCaa > 2:1013997/1‑150 (MQ=255) | GTCCTGGCAGGGGATGCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGT‑TGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAC‑GGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAA > NC_002947/1419404‑1419701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |