New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 562730 | 45 (0.620) | 5 (0.070) | 5/232 | NT | 9.9% | coding (453/621 nt) | rpsD | 30S ribosomal protein S4 |
? | NC_002947 | = 562763 | 49 (0.720) | coding (486/621 nt) | rpsD | 30S ribosomal protein S4 |
TGGGCTTCGGCTCGACTCGTTCCGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGT > NC_002947/562591‑562879 | ggggCGTCGGCTCGACTCGTTCAGAGTCCAGTCAGCTGGTTTCGCAAAAATCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCa < 2:1773590/149‑1 (MQ=255) gggCTTCGGCTCGACTCGTTCCGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCAt > 1:1632960/1‑150 (MQ=255) gggCTTCGGCTCGACTCGTTCCGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCAt > 1:183509/1‑150 (MQ=255) aCTCGTTCCGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCtt < 2:1632960/150‑1 (MQ=255) tCGTTCCGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGa > 1:211043/1‑150 (MQ=255) ttCCGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACt > 1:1220860/1‑150 (MQ=255) ccGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACtgt < 2:137145/150‑1 (MQ=255) cGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCgcacagttcaagggcttgaacaatgcgcaact > 2:1607147‑M1/1‑118 (MQ=255) aGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCg > 2:723834‑M2/1‑149 (MQ=255) gTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcccagc > 2:183509‑M2/1‑143 (MQ=255) cAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCgcacagttcaagggcttgaacaatgcgcaactggcccagcga < 1:1607147‑M1/150‑43 (MQ=255) aGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTg > 2:1926582/1‑150 (MQ=255) cTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCGATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTGGTAGATCCCGAGAAATCTCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGc > 1:442353/1‑150 (MQ=255) cTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGc > 1:1567261/1‑150 (MQ=255) tGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCgcacagttcaagggcttgaacaatgcgcaactggcccagcgatttc < 2:562517‑M1/150‑47 (MQ=255) gCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGa > 2:659027/1‑150 (MQ=255) cacaAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAg < 1:1337952/150‑1 (MQ=255) aaaGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTgg < 2:819510/150‑1 (MQ=255) aaGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTggg < 2:1881522/150‑1 (MQ=255) aGCGATCAGCGTCGAAGGTGCGACTGTTCAGGCTCGACCTGACCATGTGCTGCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGt < 2:211043/150‑1 (MQ=255) aGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTTGGCTCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGt < 1:544150/150‑1 (MQ=255) gATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGCACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGa < 2:692044/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGCTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGt < 1:816867/150‑1 (MQ=255) aGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTg < 2:1127696/150‑1 (MQ=255) ggcAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCGGGGTGACGTGGTCGCAGTACGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCGGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTTCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAt > 2:132836/3‑150 (MQ=255) tCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCtt > 2:1902631/1‑104 (MQ=255) tCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCtt < 1:1902631/104‑1 (MQ=255) ggTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATgctgct > 2:263202/1‑150 (MQ=255) ttCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGttt > 1:1660205/1‑150 (MQ=255) cATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCgcacagttcaagggcttgaacaatgcgcaactggcccagcgatttctcg < 2:814572‑M1/112‑50 (MQ=255) cATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCgcacagttcaagggcttgaacaatgcgcaactggcccagcgatttctcg > 1:814572‑M1/1‑63 (MQ=255) aTCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct > 1:664929/1‑127 (MQ=255) aTCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct < 2:664929/127‑1 (MQ=255) tACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCg < 2:1643682/135‑1 (MQ=255) tACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCg > 1:1643682/1‑135 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGt > 2:1002682/1‑113 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGt < 1:1002682/113‑1 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGtt > 2:962623/1‑150 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGtt > 2:925679/1‑150 (MQ=255) gTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct > 2:131570/1‑113 (MQ=255) gTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct < 1:131570/113‑1 (MQ=255) tCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc < 1:107002/114‑1 (MQ=255) tCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc > 2:107002/1‑114 (MQ=255) gggTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAg < 2:442353/150‑1 (MQ=255) ggTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACtgt < 2:487605/67‑1 (MQ=255) ggTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACtgt > 1:487605/1‑67 (MQ=255) cccGTGGTTGCGGTCCTCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCGTTTCAACTGTTCGCCCAGCGGGGGCGCGTTGAATGGGTTGACGTGCATGCTGATAAAAAGTCGGGCGTGTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGAc < 2:200923/148‑1 (MQ=255) gTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc < 1:890861/104‑1 (MQ=255) gTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc > 2:890861/1‑104 (MQ=255) tGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGt < 2:1220860/150‑1 (MQ=255) cGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGc < 1:263202/150‑1 (MQ=255) gcgAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCa < 1:1926582/150‑1 (MQ=255) cgAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcaactggcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatg > 1:814572‑M2/1‑49 (MQ=255) cgAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcaactggcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatg < 2:814572‑M2/112‑64 (MQ=255) gaAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatggaatgtttacagtcttaccgttgacgctgatcgctttgtgcgaaacca < 2:562517‑M2/150‑105 (MQ=255) tCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatggaatgtttacagtcttaccgttgacgctgatcgctttgtgcgaaaccagctg < 1:1607147‑M2/150‑109 (MQ=255) gCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCgcacagttcaagggcttgaacaatgcgcaactggcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatggaatgtttacagtcttaccgttgacgctgatcgctttgtgcgaaaccagctgac > 2:183509‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTg > 1:85993/1‑150 (MQ=255) cgcacagttcaagggcttgaacaatgcgcaactggcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatggaatgtttacagtcttaccgttgacgctgatcgctttgtgcgaaaccagctgacgggact > 2:723834‑M1/1‑1 (MQ=255) ccAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGt > 2:956725/1‑150 (MQ=255) | TGGGCTTCGGCTCGACTCGTTCCGAGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGG‑‑‑‑‑‑‑GCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGT > NC_002947/562591‑562879 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |