| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1064979 | 90 (1.230) | 15 (0.220) | 8/230 | NT | 14.7% | intergenic (+33/+80) | PP_0922/PP_0923 | hypothetical protein/acyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 1065023 | 91 (1.340) | intergenic (+77/+36) | PP_0922/PP_0923 | hypothetical protein/acyltransferase | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
ATGGCCGGGGTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGTGAAT > NC_002947/1064830‑1065127 | aTGGCCGGGGTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGT > 1:868701‑M1/1‑150 (MQ=255) ggTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1810106/150‑1 (MQ=255) gtggAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACg < 2:405648/150‑1 (MQ=255) aaCTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccga > 1:1817639‑M1/1‑131 (MQ=255) gcaggagcGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgag > 1:1037584‑M1/4‑130 (MQ=255) cTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAAt < 1:605595/150‑1 (MQ=255) tGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGgtg > 2:63900/1‑150 (MQ=255) gTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:1029197/1‑126 (MQ=255) gTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1029197/126‑1 (MQ=255) aTGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg < 2:754526/150‑1 (MQ=255) aTGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAg < 1:1056983/150‑1 (MQ=255) gAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGa > 1:710982/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGc > 1:379601/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgg < 2:1817639‑M1/150‑41 (MQ=255) cGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgg < 2:1037584‑M1/150‑41 (MQ=255) gctgGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTc < 1:605177/150‑1 (MQ=255) gCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCaccc > 1:1084757‑M2/1‑146 (MQ=255) tttgCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGGTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCAAACGCATTGTACGTAGGAGCGGGTTTacccgcgaa > 2:565673‑M2/1‑141 (MQ=255) tttCGCCAGTTCTACCCTCAGCTGCAGGCTTTTGCGGCGTTAGTGCTTATTTCTGACAGTTATAGGTGTGTGGTTGATACTCGCCTCTTCGCGTTTTAACCCTCTCCTACGGGCAATGCCCTCTGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaaa < 2:655791/150‑1 (MQ=255) tCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAgg < 2:329951/150‑1 (MQ=255) gcgAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcg < 2:675745‑M1/131‑40 (MQ=255) gcgAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTAATACTGCCCTCTTCTCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGc < 1:1614697/150‑1 (MQ=255) gAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCa < 1:308307/150‑1 (MQ=255) ttCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACTGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGaa > 2:1297423/1‑150 (MQ=255) ttCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTGAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAggg > 2:1242736/1‑144 (MQ=255) tACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAAt < 1:724922/105‑1 (MQ=255) tACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCac > 1:834274‑M2/1‑128 (MQ=255) tACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCac < 2:834274‑M2/130‑3 (MQ=255) tACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAg > 1:1659634/1‑150 (MQ=255) tACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAAAGCGCGCGGTGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAAAGGGCCAGAACAg > 1:109357/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAgg < 1:1820636/149‑1 (MQ=255) cccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAgg > 2:1820636/1‑149 (MQ=255) cccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCCACCCGCAATGCGCTCGGTGAGGGAGCGGGTTCACCCGCGAACGGGCCCGAACAGGc > 2:460341/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCCTTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacc < 1:1722779‑M1/150‑69 (MQ=255) cccGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACACCGGTGGTTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGc < 1:1180569/150‑1 (MQ=38) cAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTg < 1:377179/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAg < 1:1731568/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTTCCTGCTCTGTGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAg < 2:1927515/150‑1 (MQ=38) cAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCa > 2:192403/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCAtt < 2:710982/150‑1 (MQ=255) gCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaaa < 2:1440973/123‑1 (MQ=255) gCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaaa > 1:1440973/1‑123 (MQ=255) gCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGACAGAACAGTCAGTGCAGGCATTc > 2:449455/1‑150 (MQ=255) cGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCa < 1:316072/150‑1 (MQ=255) cggcggTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaaga > 1:583765‑M1/1‑62 (MQ=255) cggcggTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaaga < 2:583765‑M1/117‑56 (MQ=255) cggcggTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGc < 2:1578169/150‑1 (MQ=255) ggcggTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGcc > 2:376723/1‑150 (MQ=255) gcggTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGccc > 1:521235/1‑150 (MQ=255) gcggTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGccc > 1:792183/1‑150 (MQ=255) ggaGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCcgcg < 2:765844/148‑1 (MQ=255) aGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTGCTGCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGcc > 1:1087803/1‑150 (MQ=255) gggCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAg < 1:1222328/129‑1 (MQ=255) gggCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAg > 2:1222328/1‑129 (MQ=255) gggCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCCTTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcggg > 1:1472895‑M1/1‑54 (MQ=255) gggCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCCTTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcggg > 1:1472852‑M1/1‑54 (MQ=255) gggCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCCTTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcggg < 2:1472895‑M1/95‑42 (MQ=255) gggCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCCTTTCGCGGGTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcggg < 2:1472852‑M1/95‑42 (MQ=255) 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tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccg > 1:583765‑M2/1‑55 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccg < 2:583765‑M2/117‑63 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAgcgc > 2:821840/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAgcgc < 1:1369182/150‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAgcgc < 1:63900/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTaaacccgctcctacgtacaatgcgtttggtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctacctgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggtagaactcgcgcaaa > 2:565673‑M1/1‑9 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAg < 1:1599404/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGAGCCTTCTCCACTTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGt < 1:460341/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGCGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGt > 2:334670/1‑150 (MQ=255) gggTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggtagaactcgcgaaaatccgc > 1:1084757‑M1/1‑4 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTACCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAgc < 1:944811/140‑1 (MQ=255) gTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggta < 2:834274‑M1/130‑129 (MQ=255) gTgaacccgctcctacaccgagcgcattgcccgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccagtatcacccacacacctctaactgtcagacatccgccctaccgccgcaaacgcctgcagctgcgggta > 1:834274‑M1/1‑2 (MQ=255) | ATGGCCGGGGTGATGGTGGAACTGGAGCGGCTGTATGAGCCGCTGCTGGCGGATTTTCGCGAGTTCTACCCGCAGCTGCAGGCGTTTGCGGCGGTAGGGCGGATGTCTGACAGTTAGAGGTGTGTGGGTGATACTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGCAATGCGCTCGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCAGAACAGGCAGTGCAGGCATTCAGGCAGCCCGCGCCTGCCGACGTGGCGCCATCTCCACGTCTTCAACCCCGAACAGCGCCAGGTGAAT > NC_002947/1064830‑1065127 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |