New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1733606 | 53 (0.730) | 4 (0.060) | 4/240 | NT | 7.3% | coding (306/2592 nt) | PP_1526 | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
? | NC_002947 | = 1733638 | 50 (0.710) | coding (274/2592 nt) | PP_1526 | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
CGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGAAAAG > NC_002947/1733489‑1733786 | cgcCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCgg > 2:686557/1‑150 (MQ=255) cgcCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCgg < 1:1528045/150‑1 (MQ=255) ccTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGga > 1:1595251‑M2/1‑148 (MQ=255) cTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGgac > 2:1797118‑M2/1‑147 (MQ=255) cGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCt > 1:1035894/1‑150 (MQ=255) cGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCt < 1:685233/150‑1 (MQ=255) accaccaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg < 1:134821/150‑1 (MQ=255) caccaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGt > 1:635507/1‑150 (MQ=255) caccaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGt > 1:211585/1‑150 (MQ=255) caccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGt < 1:124836/147‑1 (MQ=255) caccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGt > 2:124836/1‑147 (MQ=255) caccacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCATCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCAc < 1:539142/150‑1 (MQ=255) cacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGt > 1:285149/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGtata < 1:465267/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAg < 1:1012612/150‑1 (MQ=255) tGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGa > 1:1334661/1‑150 (MQ=255) gcgACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATAc > 1:1502078/1‑150 (MQ=255) gcgACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATAc < 2:1334661/150‑1 (MQ=255) gcgACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATAc < 1:1931473/150‑1 (MQ=255) aCGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGa < 2:1035894/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACTGTATAGATACGGAt < 2:635507/150‑1 (MQ=255) ttGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCGCCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg > 2:1148808/1‑120 (MQ=255) ttGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCGCCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg < 1:1148808/120‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCg > 1:1329435/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGt > 1:254875/1‑150 (MQ=255) gCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCa < 2:1502078/150‑1 (MQ=255) gCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCa > 2:1068725/1‑150 (MQ=255) ggCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCt < 2:538790/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGt > 2:845493/1‑136 (MQ=255) gCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGt < 1:845493/136‑1 (MQ=255) gCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGc < 2:786800/95‑1 (MQ=255) gCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGc > 1:786800/1‑95 (MQ=255) aaTTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTc > 2:1731848/1‑150 (MQ=255) aaTTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTc > 2:1143273/1‑150 (MQ=255) ttCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCACCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAg < 2:1399402/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACgg > 1:1155584/1‑104 (MQ=255) gcgcTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACgg < 2:1155584/104‑1 (MQ=255) gcTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCt > 1:715903/1‑150 (MQ=255) ggTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGgac > 1:1473114‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGgac < 2:1473114‑M2/64‑4 (MQ=255) gggCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTg > 1:1516718/1‑150 (MQ=255) gggCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTg < 2:1516718/150‑1 (MQ=255) ggCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTTCTCCAGGTCCTGGCGCATTTAGTCGTCAGTgg > 2:344278/1‑150 (MQ=255) aTCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTAc > 2:91895/1‑150 (MQ=255) cATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGa < 1:91895/150‑1 (MQ=255) atatCCCCGGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTgg < 2:1140124/141‑1 (MQ=255) atatCCCCGGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTgg > 1:1140124/1‑141 (MQ=255) cccAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgggtggtg < 1:106075‑M2/144‑104 (MQ=255) cccAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgggtggtg > 2:106075‑M2/1‑41 (MQ=255) ccAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgggtggtggtcggca < 2:237406‑M2/150‑111 (MQ=255) cAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCtg > 2:562805/1‑150 (MQ=255) aGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCtgt < 1:1143273/150‑1 (MQ=255) tCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAG‑CGGGTgacgctggggatatggatcagcccggacctggagcgcaacgagcgcgaaattgccacggccatccagctggccaacacgtcgcgcagcgtggtgcgggtggtggtcggcaacgaggc < 2:243521‑M2/150‑118 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg > 1:1936399/1‑43 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTgg < 2:1936399/43‑1 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCGTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTc > 1:414949/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGc > 1:585511/1‑150 (MQ=255) cGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGAGACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGc > 1:896164/1‑150 (MQ=255) cctcGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGAATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCTCCCAGGCGGAACg > 2:1027376/1‑150 (MQ=255) tcGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGc > 1:1933417/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGaa < 1:211498/150‑1 (MQ=255) aGGCGGGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCAGTTCGTCGTCAGTGGGGNACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATAc < 1:344278/150‑1 (MQ=255) gggACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGAAAAg > 1:30875/1‑150 (MQ=255) | CGCCTCGTTGCCGACCACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGGACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGAAAAG > NC_002947/1733489‑1733786 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |