New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3676073 | 55 (0.750) | 5 (0.080) | 5/220 | NT | 8.6% | intergenic (+37/+55) | PP_3240/PP_5592 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3676096 | 57 (0.880) | intergenic (+60/+32) | PP_3240/PP_5592 | hypothetical protein/hypothetical protein |
CGACCCCGACTCCCCGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCG > NC_002947/3675949‑3676242 | cGACCCCGACTCCCCGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgc > 2:604830‑M2/1‑148 (MQ=255) ccccGACTCCCCGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttg > 2:1856114‑M2/1‑145 (MQ=255) cccGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacg < 2:186652‑M2/150‑15 (MQ=255) ggATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTc < 1:1252389/150‑1 (MQ=255) aTGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGGGTAGCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTcac < 1:821410/150‑1 (MQ=255) cGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACcaca > 2:1481831/1‑150 (MQ=255) gAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAg > 2:332557/1‑150 (MQ=255) aaGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAga < 1:567405/150‑1 (MQ=255) ccTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACt > 2:1578103/1‑150 (MQ=255) cTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCTGCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTTCGATCTTTTGTGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTg > 2:1390214/1‑150 (MQ=255) cTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTg < 1:1466520/150‑1 (MQ=255) tCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGt < 1:1595751/150‑1 (MQ=255) gTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCATCACAGACGACTGTCAGc < 1:1181249/150‑1 (MQ=255) ccACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTc < 2:1746587/141‑1 (MQ=255) ccACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTc > 1:1746587/1‑141 (MQ=255) caGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAgcgc < 1:1578103/150‑1 (MQ=255) caGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAgcgc < 1:327922/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAgcgcgc < 2:255300/150‑1 (MQ=255) gggCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGcc > 2:328402/1‑150 (MQ=255) ggccggccAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagac > 2:393359‑M2/1‑101 (MQ=255) ggccggccAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagac < 1:393359‑M2/119‑19 (MQ=255) ggccAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTg‑gcg < 2:384639/150‑1 (MQ=255) ggccAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTg‑gcg > 2:106546/1‑150 (MQ=255) agaCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTAcgcccgcc > 1:1653738/1‑150 (MQ=255) agaCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTAcgcccgc > 2:1258125/1‑149 (MQ=255) agaCATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGAGCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTAcgcccgc < 1:1258125/149‑1 (MQ=255) aTTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTg < 2:136115/128‑1 (MQ=255) aTTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTg > 1:136115/1‑128 (MQ=255) aaaaGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCctct > 2:1076294/1‑130 (MQ=255) aaaaGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCctct < 1:1076294/130‑1 (MQ=255) aaaGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCTGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTg > 1:1853698/1‑150 (MQ=255) aaaGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTg > 1:76149/1‑150 (MQ=255) ggAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATc < 1:1481831/150‑1 (MQ=255) gAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgac > 1:1356954‑M2/1‑66 (MQ=255) gAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgac < 2:1356954‑M2/79‑14 (MQ=255) aGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCgg > 2:386781/1‑150 (MQ=255) aGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCgg < 1:332557/150‑1 (MQ=255) gTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCggg < 2:76149/150‑1 (MQ=255) aaCCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTcac < 2:70295/80‑1 (MQ=255) aaCCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTcac > 1:70295/1‑80 (MQ=255) aCCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGCAGGCGACCACAGACGACAGTAAAACATCA‑CACGTCTGAACTGCCGTTACTCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGt > 1:917828/1‑150 (MQ=255) ccACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACAAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTg > 2:752801/1‑150 (MQ=255) cACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGc > 2:1913683/1‑150 (MQ=255) gCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGc < 1:106546/150‑1 (MQ=255) cTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCAGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTg > 2:168941/1‑150 (MQ=255) gATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGACCGGGTAGTGCACGCTGATc > 2:1280553/1‑150 (MQ=255) aCCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGt < 1:707225/150‑1 (MQ=255) ccGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTg > 1:1705793/1‑150 (MQ=255) cGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCa < 2:761071/77‑1 (MQ=255) cGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCa > 1:761071/1‑77 (MQ=255) cgtcgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTg < 1:328402/150‑1 (MQ=255) tcgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtt < 1:806694‑M2/73‑39 (MQ=255) tcgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtt > 2:806694‑M2/1‑35 (MQ=255) tcgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTg < 2:1276546/138‑1 (MQ=255) tcgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTg > 1:1276546/1‑138 (MQ=255) cgCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgtgggtcgacttgagggtcttcggcatccggggag < 1:127349‑M2/150‑117 (MQ=255) ccGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTAc < 1:1586490/150‑1 (MQ=255) ggCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgt > 1:1032194‑M2/1‑30 (MQ=255) ggCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAgcttgccggcgacgagaccggtaatcaaggccgtggtttactcctttttctcaatgtctctaggcggcttggccggcccctgt < 2:1032194‑M2/113‑84 (MQ=255) tgtgCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCAACAGCTTGGTCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTAc > 2:1509021/1‑150 (MQ=255) gCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTgat < 2:159089/123‑3 (MQ=255) gCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTgat > 1:159089/1‑121 (MQ=255) gCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGt > 2:1692413/1‑150 (MQ=255) gATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGc > 2:199402/1‑93 (MQ=255) gATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGc < 1:199402/93‑1 (MQ=255) gATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCa > 1:1534271/1‑150 (MQ=255) gATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTCATTATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCa < 1:1509021/150‑1 (MQ=255) cTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAAt < 2:1653738/150‑1 (MQ=255) ttGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGa < 1:1031206/117‑1 (MQ=255) ttGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGa > 2:1031206/1‑117 (MQ=255) ttGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATc > 2:1027655/1‑150 (MQ=255) gAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCAACGCTACCGTGATGAATCAAAc > 1:91988/1‑150 (MQ=255) gAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCCCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAAc < 1:1390214/150‑1 (MQ=255) aCCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAAcct > 1:681085/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTg < 2:868523/94‑1 (MQ=255) ccAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTg > 1:868523/1‑94 (MQ=255) | CGACCCCGACTCCCCGGATGCCGAAGACCCTCAAGTCGACCCACAGGGGCCGGCCAAGCCGCCTAGAGACATTGAGAAAAAGGAGTAAACCACGGCCTTGATTACCGGTCTCGTCGCCGGCAAGCCATGTGCGATCCCTTGGGAACCAGCTTGCCGGCGACGGTCACCACAGACGACTGTCAGCCTTCAGCGCGCCTG‑GCGGCCTCTACGCCCGCCGCCGACAGCTTGATCGGGTAGTGCACGCTGATCTGGTGATCATTGCTTACCGCCACGCTACCGTCATGAATCAAACCG > NC_002947/3675949‑3676242 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |