New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4401734 = | 87 (1.190) | 6 (0.090) | 6/238 | NT | 7.0% | coding (1464/1809 nt) | PP_3881 | terminase large subunit |
? | NC_002947 | 4401761 = | 77 (1.100) | coding (1437/1809 nt) | PP_3881 | terminase large subunit |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCTGGCGTCGTTTCCAG > NC_002947/4401612‑4401910 | tCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGGCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAgt < 2:73967/150‑1 (MQ=255) tCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAgt > 1:715126/1‑150 (MQ=255) gcaagctgcatgtgttgcgtcggctgcagactatctgtgacttcttccaggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacaCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAgt > 1:892011‑M1/123‑150 (MQ=255) cgcATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGtgtg > 2:1742099/1‑142 (MQ=255) gcATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTAc > 2:1698562/1‑150 (MQ=255) catcatCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACt < 1:960458/150‑1 (MQ=255) tcGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCtc > 2:626384/1‑150 (MQ=255) tcGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCtc < 2:517247/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGTGCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACCCGTCTACCGCCGGTCCCATATCCTTGAAGCACTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTTATGTCGTACTCGCtcagc < 2:335277/150‑3 (MQ=255) aaaaaCTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCtcatc > 2:1490709/1‑150 (MQ=255) aaaCTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCaa < 1:1243101/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGc > 1:1917575/1‑150 (MQ=255) tCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGc < 2:22322/150‑1 (MQ=255) tCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCACTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTc > 2:1318990/1‑131 (MQ=255) tCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCACTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTc < 1:1318990/131‑1 (MQ=255) cgcgCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCAt < 1:662200/150‑1 (MQ=255) ccACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCt < 1:311667/150‑1 (MQ=255) tgacttcttccaggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacactgcccgaactcaacgagctcaggcagTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGc > 1:1112724‑M2/113‑143 (MQ=255) tgacttcttccaggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacactgcccgaactcaacgagctcaggcagTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGc < 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tCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGACCGCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCACATCAACTGCCGCATGTCCTCACTgcgc > 2:23750/1‑150 (MQ=255) tctGGTTGCTGCTCGATAATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCaa > 2:477616/1‑150 (MQ=255) ggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacactgcccgaactcaacgagctcaggcagTGTGAt < 2:1469813‑M2/6‑1 (MQ=255) ggtggacaagatcgcctttgaccgttggcgcattgaagacatgcggcagttgatgagcgagtacgacatcacactgcccgaactcaacgagctcaggcagTGTGAt > 1:1469813‑M2/101‑106 (MQ=255) gTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGt < 1:466841/105‑1 (MQ=255) gTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGt > 2:466841/1‑105 (MQ=255) 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tCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCg > 1:1826647/1‑150 (MQ=255) aTCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATc < 1:626384/150‑1 (MQ=255) aTCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATc < 2:1826647/150‑1 (MQ=255) aTCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATc < 2:715126/150‑1 (MQ=255) tCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATg < 2:1265272/92‑1 (MQ=255) tCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATg > 1:1265272/1‑92 (MQ=255) 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CCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATg < 1:627715‑M1/150‑1 (MQ=255) gAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGgc > 2:1272980/1‑150 (MQ=255) aCTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGgcgc < 2:627715/150‑1 (MQ=255) aaCGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCa < 1:564234/131‑1 (MQ=255) aaCGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCa > 2:564234/1‑131 (MQ=255) aaCGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGccc > 1:199732/1‑150 (MQ=255) ttgagttcgggcagTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCt < 2:892011‑M2/136‑1 (MQ=255) cGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGAACTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGACAATCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCTg > 1:1097356/1‑150 (MQ=255) gCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCa < 1:1159928/126‑1 (MQ=255) gCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCa > 2:1159928/1‑126 (MQ=255) cTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGAGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAg < 2:917840/101‑1 (MQ=255) cTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGAGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAg > 1:917840/1‑101 (MQ=255) gcagTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCTGGCGTCGttt > 2:1447353‑M2/5‑150 (MQ=255) cagTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCTGGCGTCGTTTc < 1:1447353‑M2/147‑1 (MQ=255) gTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCTGGCGTCGTTTCCa < 2:312819‑M2/149‑1 (MQ=255) tgtgATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCTGGCGTCGTTTCCAg < 1:1698562/150‑1 (MQ=255) | TCAGCCGGCAGCGCATCATCGAAAAACTCCGCCGCGCCACCCTCTTCCTCTGGTTGCTGCTCGATCATGCCGAGCAGGCGCCGCTCAAACTCGTCTACCGCCGGCCCCATATCCTTGAAGCCCTGCCCGAACTCAACGAGCTCAGGCAGTGTGATGTCGTACTCGCTCATCAACTGCCGCATGTCTTCAATGCGCCAACGGTCAAAGGCGATCTTGTCCACCTGGAAGAAGTCACAGATAGTCTGCAGCCGACGCAACACATGCAGCTTGCTGATGGCGCGCCCTGGCGTCGTTTCCAG > NC_002947/4401612‑4401910 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |