| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,150,067 | 0 | C | T | 6.7% | 283.9 / 5.4 | 98 | intergenic (+22/‑375) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/45); new base T (3/4); total (48/50) | |||||||||||
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Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TAGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCAC > NC_002947/4149918‑4150214 | tAGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGccc < 1:755635/150‑1 (MQ=255) gCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCC‑CT > 2:629007‑M1/1‑150 (MQ=255) ccAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACTAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCC‑CTT > 2:265482‑M1/1‑150 (MQ=255) 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ttCCTCTTGTGCCGGCCA‑CTTCGCGTGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCg < 2:450574/150‑1 (MQ=255) ccTCTTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCa > 1:102198/1‑106 (MQ=255) ccTCTTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCa < 2:102198/106‑1 (MQ=255) ccTCTTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGACTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTg > 2:1826285/1‑150 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAAc > 1:1726716/1‑98 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAAc < 2:1726716/98‑1 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACCTCGCACCCACCCATCCCACCGTGAt > 2:101370/1‑150 (MQ=255) ttGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATcc > 1:677567/1‑150 (MQ=255) ttGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGAAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATcc > 2:612863/1‑150 (MQ=255) tgCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCCGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGcc > 1:936287/1‑105 (MQ=255) gCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGtt < 2:1335493/150‑1 (MQ=255) ccGGCCT‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgg < 1:1631552‑M2/60‑5 (MQ=255) ccGGCCT‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgg > 2:1631552‑M2/1‑56 (MQ=255) ccc‑cTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAGAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGTCAc > 1:620692/1‑150 (MQ=255) ccc‑cTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCAc > 1:1261373/1‑150 (MQ=255) | TAGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCC‑CTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCAC > NC_002947/4149918‑4150214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |