New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 337811 | 90 (0.610) | 43 (0.370) | 31/206 | 4.1 | 42.2% | intergenic (‑58/+71) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 337839 | 47 (0.410) | intergenic (‑86/+43) | PP_0279/PP_0280 | hypothetical protein/amino acid ABC transporter permease | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GCCAGCTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/337638‑337811 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cttcgcgggcacgcccgctcccacaggtGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCCT < NC_002947/337839‑337692 ccagcCTGCA‑GCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCG > 1:1488723/6‑150 GCTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCCCGCTATCATACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGG < 1:230396/150‑1 TGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGC > 1:3233758/1‑150 CAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCAC > 1:210936/1‑150 GCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCC > 2:348436/1‑150 GTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCT < 1:1107142/150‑1 GTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCT > 1:3461274/1‑150 GGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCAC > 1:445533/1‑150 GGGCGCGGTTTACACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCTCTCGCACA < 2:2520906/150‑1 GGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:2129584/150‑1 GCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG < 1:559396/150‑1 GCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGAATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGG > 1:2053202/1‑150 TGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG > 1:1139162/1‑133 TGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 2:1139162/133‑1 TGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG > 1:2169573/1‑133 CTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAA < 1:5377/150‑1 GTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCAACCTTGAATGT > 1:3361184/1‑150 GCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGG > 2:2198999/1‑150 CGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGC < 1:3422329/150‑1 CGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGC > 2:3422329/1‑150 GATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT > 1:1259350/1‑124 GATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT < 2:1259350/124‑1 GATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCC < 2:2857129/117‑1 GATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCC > 1:2857129/1‑117 TCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTAT > 1:758783/1‑150 TCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTAT < 2:2138029/150‑1 TCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTAT > 2:62261/1‑150 CAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATA < 1:1704379/150‑1 AGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATAC < 1:62261/150‑1 AGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATAC < 2:2626055/150‑1 AGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTATAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATAC < 1:3111430/150‑1 GGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACC < 2:375172/150‑1 GGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGGGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCCCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACC > 1:1974744/1‑150 GAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCT > 2:695944/1‑150 GAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCT < 1:2669840/150‑1 GAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:2444610/116‑1 GAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGGGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG > 2:2444610/1‑116 AACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTG < 2:758783/150‑1 acggggCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTGTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGT < 2:764248/144‑1 ACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGACTGGTTAGTTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGT < 1:1773084/150‑1 TGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGG < 1:2198999/150‑1 TGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGG < 2:445533/150‑1 TCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTC > 1:2725888/1‑87 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TGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTTCCA < 2:3200039/97‑1 TGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTTCCA > 1:3200039/1‑97 GCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGT < 1:360836/131‑1 GCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGT > 2:360836/1‑131 TTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGG < 2:2835538/132‑1 TTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGG > 1:2835538/1‑132 TTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGG < 1:188567/69‑1 TTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGG > 2:188567/1‑69 GTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTG < 1:2396033/97‑1 GTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTG > 2:2396033/1‑97 GAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATAC > 1:513114/1‑103 GAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATAC < 2:513114/103‑1 GGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGC > 2:553319/1‑115 GGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGC < 1:553319/115‑1 GTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGT < 2:1544406/101‑1 GTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGT > 1:1544406/1‑101 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CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCC < 1:3213356/149‑1 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCC < 1:1332340/122‑1 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCC > 2:1332340/1‑122 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATA > 2:414971/1‑43 CCGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATA < 1:414971/43‑1 CGCTCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTC > 1:2217113/1‑150 TCCCACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGAC < 1:3622461/150‑1 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CACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAG > 1:348436/1‑150 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATTCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGT > 2:2053202/1‑150 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGT > 2:2500264/1‑150 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTC > 2:3758520/1‑143 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTC < 1:3758520/143‑1 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCT > 2:1255389/1‑142 ACAGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCT < 1:1255389/142‑1 AGGTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTC > 2:1488723/1‑150 cTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCCT < 1:2290893/149‑1 GTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCCT > 2:2199866/1‑150 GTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACA > 1:2649964/1‑107 GTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACA < 2:2649964/107‑1 GTGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGT < 1:830177/48‑1 GCCAGCTGCAGGCTGGTGAAGGGGCGCGGTTTCCACAGCTGCTGGTGCTCGATCAGGAACTGGTCGAGGGCCTGGAAGCGGGTGCTTAGGTGGGGGCTGTGGAGGTGGTTGGGCATGGCAAGGATGTGTGGTGGTTTTGAGGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/337638‑337811 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cttcgcgggcacgcccgctcccacaggtGTAGCGCCAACCTTGAATGTGGCGCTATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTCAAAACCACCACACATCCTTGCCATGCCCAACCACCTCCACAGCCCCCACCTAAGCACCCGCTTCCAGGCCCTCGACCAGTTCCT < NC_002947/337839‑337692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |