Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,741,285 | 2 bp→CT | intergenic (+476/+275) | gltA → / ← yeiW | citrate synthase/putative oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,741,285 | 0 | A | C | 84.6% | 248.0 / 24.9 | 91 | intergenic (+476/+276) | gltA/yeiW | citrate synthase/putative oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (9/5); new base C (40/37); total (49/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
* | NC_002947 | 4,741,286 | 0 | C | T | 85.7% | 225.3 / 24.6 | 91 | intergenic (+477/+275) | gltA/yeiW | citrate synthase/putative oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (8/5); new base T (41/37); total (49/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
GGGTCAGGCTGCCATCCGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑AA‑CC‑TCC‑GCCAAC‑TGCATT‑CGTGAA‑CCAAGCAACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGCCACCTCAC > NC_002947/4741153‑4741409 || gggTCAGGCTGCCATCCGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGaatcc > 2:535397/1‑147 (MQ=255) ccATCCGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GCTTCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGcc > 2:1041719/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGcccc < 2:760678/150‑1 (MQ=255) gCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGac > 1:2842730/1‑150 (MQ=255) gCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGAACAGGCCCCGGac > 2:2280472/1‑150 (MQ=255) gCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGac > 2:1121333/1‑150 (MQ=255) cctcctTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGaca > 1:2905531/1‑150 (MQ=255) ctcctTGATGGTCGTAATGTTCAGAACGGAATCACTCGTCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTTGTCACCTTCTTGCTTTATCAG‑CT‑TCT‑GCCACT‑TGCATT‑CTTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGacac < 2:296401/150‑1 (MQ=255) cctTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGt < 1:3347423/150‑1 (MQ=255) ctTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGtc < 2:1150161/150‑1 (MQ=255) ttGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGaa > 2:903311/1‑124 (MQ=255) ttGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGaa < 1:903311/124‑1 (MQ=255) ttGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGtcc > 1:2781685/1‑150 (MQ=255) gATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGtcctc > 1:3704054/1‑150 (MQ=255) gATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGtcctc < 2:2050525/150‑1 (MQ=255) aTGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATATGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGtcctcc < 1:2777483/150‑1 (MQ=255) aTGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTCTGCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGtcctcc < 1:1494610/150‑1 (MQ=255) gTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACG‑GAAGTGCACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGc > 1:1979253/1‑150 (MQ=255) tCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCa > 1:3103878/1‑150 (MQ=255) tCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCa > 1:1357761/1‑150 (MQ=255) gTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAgc < 1:1766183/150‑1 (MQ=255) tAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGacac < 1:2259511/136‑1 (MQ=255) tAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGacac > 2:2259511/1‑136 (MQ=255) tgtgCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCt > 1:3307229/1‑150 (MQ=255) gcagcaCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGtcctc > 2:1130069/1‑136 (MQ=255) gcagcaCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGtcctc < 1:1130069/136‑1 (MQ=255) gcagcaCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGa > 1:3554435/1‑150 (MQ=255) gcagcaCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGa < 2:2260105/150‑1 (MQ=255) agcaCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGAcc < 2:373613/150‑1 (MQ=255) agcaCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGAcc < 1:2347133/150‑1 (MQ=255) agcaCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGACTGGTGGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGAcc > 1:2926224/1‑150 (MQ=255) aCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTg < 1:3153694/150‑1 (MQ=255) aCGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTg < 1:1041719/150‑1 (MQ=255) ggAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTCTACGTTGCTGGCTTGGCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGc < 2:1979253/150‑1 (MQ=255) ggAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTCTAACTCCAACCCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGc < 2:2926224/150‑1 (MQ=255) ggAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGc > 1:2975940/1‑150 (MQ=255) ggAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGAACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGc < 1:2280472/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGa < 1:1410021/114‑1 (MQ=255) aCGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGa > 2:1410021/1‑114 (MQ=255) aCGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAgcgg > 1:258627/1‑150 (MQ=255) gcggcgT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAgcggcg > 1:2286093/1‑150 (MQ=255) ggcgT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGcc < 1:1708022/150‑1 (MQ=255) gcgT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCt < 2:2975940/150‑1 (MQ=255) cgT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCtt < 1:2637550/150‑1 (MQ=255) aCCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATc < 1:535397/150‑1 (MQ=255) cGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTCTGCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCAc < 1:2303464/150‑1 (MQ=255) gCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACgg > 2:3118930/1‑150 (MQ=255) gCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACg < 1:1004242/149‑1 (MQ=255) gCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑TA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGAGCCTCGTCCTGGGCCAGCGGCGCCGTGATCACgg < 2:1357761/150‑1 (MQ=255) gCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTCTGCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACg > 2:1004242/1‑149 (MQ=255) tGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTcac > 1:3249657/1‑150 (MQ=255) gCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCacac > 2:3286493/1‑150 (MQ=255) gTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACcg > 2:2688411/1‑150 (MQ=255) 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tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCCTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTgg > 1:1079240/1‑150 (MQ=255) ccAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGa > 1:3045529/1‑150 (MQ=255) cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGcc > 1:335091/1‑138 (MQ=255) cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGcc < 2:335091/138‑1 (MQ=255) cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGAc < 2:3249657/150‑1 (MQ=255) tctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACTTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCgg > 2:1841452/1‑150 (MQ=255) ctGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CAGCT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGc < 2:3554435/150‑1 (MQ=255) tGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGcc < 1:182447/150‑1 (MQ=255) tGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GCTTCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGcc > 2:663898/1‑150 (MQ=255) tGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTCTGCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGcc > 2:1213731/1‑150 (MQ=255) tGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGcc > 1:27339/1‑150 (MQ=255) ggTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGCCa > 1:18520/1‑150 (MQ=255) gTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTg > 2:2237207/1‑91 (MQ=255) gTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTg < 1:2237207/91‑1 (MQ=255) tCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGCCAcc > 2:292536/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GC‑TTC‑TGCGACTTGCATT‑CGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGCCACCTc > 2:2216324/1‑150 (MQ=255) cTTCGTGCTTGAGCAG‑CT‑TCT‑GCGACT‑TGCATT‑CGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGCCACCTCAc < 2:2873597/150‑1 (MQ=255) || GGGTCAGGCTGCCATCCGCCTCCTTGATGGTCGTAATGTGCAGCACGGAATCACGCGGCGT‑CACCGGCCATGGCGTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑AA‑CC‑TCC‑GCCAAC‑TGCATT‑CGTGAA‑CCAAGCAACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTTGTACTTGGACCCGGCCACCTCAC > NC_002947/4741153‑4741409 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |