New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 358055 = | 53 (0.770) | 14 (0.270) | 11/196 | 4.3 | 31.2% | intergenic (+20/‑110) | tdcG‑I/PP_5441 | L‑serine dehydratase/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 358133 = | 22 (0.430) | intergenic (+98/‑32) | tdcG‑I/PP_5441 | L‑serine dehydratase/hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
ACACTGATCGCGACATCCGACGATCGGTAGGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/358228‑358055 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGGGAAACCCATGCGGCGC > NC_002947/358133‑358281 ACACTGATCGCGACATCCGACGATCGGTAGGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGA < 2:941444/150‑1 GATCGCGACATCCGACGATCGGTAGGCCGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGG < 1:13275/150‑1 TCGCGACATCCGACGATCGGTAGGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCa > 2:950888/1‑149 CGCGACATCCGACGATCGGTAGGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTT < 1:1106875/150‑1 CCGACGATCGGTAGGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCAAGCCCGCtc < 1:950888/150‑3 GGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGG < 1:1512638/125‑1 GGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGG > 2:1512638/1‑125 CATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGG < 2:442838/120‑1 CATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGG > 1:442838/1‑120 AGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGG > 2:930799/1‑91 AGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGG < 1:930799/91‑1 CCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCC > 2:66787/1‑74 CCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCC < 1:66787/74‑1 GGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTC > 1:608011/1‑150 CGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAG < 2:608011/150‑1 GCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGT > 2:1106472/1‑150 GCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGC > 1:1331985/1‑105 GCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGC < 2:1331985/105‑1 CTACAGGGATTGCACCGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGTTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCTACCCGCCTACCGATCGTTGGATGTCGAGTCCAGTGTGG > 2:338931/1‑150 CTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGT > 1:1046979/1‑99 CTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGT < 2:1046979/99‑1 CTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAG < 2:340991/67‑1 CTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAG > 1:340991/1‑67 ACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGG < 2:1086450/96‑1 ACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGG > 1:1086450/1‑96 AGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGT > 2:1256/1‑150 ACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGA < 1:1106472/150‑1 CCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGC > 2:1504628/1‑133 CCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGC < 1:1504628/133‑1 CCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGG > 2:401204/1‑84 CCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGG < 1:401204/84‑1 TGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAA < 1:1334914/150‑1 GCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGAAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGAGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCG > 1:131164/1‑150 CGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGC < 1:941444/150‑1 GCTTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTC < 1:1414453/150‑1 TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTA > 2:1075325/1‑87 TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTA < 1:1075325/87‑1 CCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGG < 1:789981/147‑1 CCGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGG > 2:789981/1‑147 CGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGC > 1:1386468/1‑79 CGCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGC < 2:1386468/79‑1 GCGAAGAGGCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGAGTTGGCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGGGAAAC < 1:578336/150‑1 GCCCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGGGAAACCCATGCGG > 2:770960/1‑150 CCTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGGGAAACCCATGCGGCG > 2:767098/1‑150 CTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGGGAAACCCATGCGGCGC > 2:1666859/1‑150 ACACTGATCGCGACATCCGACGATCGGTAGGCGGGGCGCCCATCACCGCACCATAAAGAGGCATAGGCGGTTGTGTTGCACCTGCATCAGCCTCAAGGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTACAGGGATTGCACAGTTCCTGTAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/358228‑358055 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctgtaggagcgggcttgcccgcgaagaggcccTTGAGGCTGATGCAGGTGCAACACAACCGCCTATGCCTCTTTATGGTGCGGTGATGGGCGCCCCGCCTACCGATCGTCGGATGTCGCGATCAGTGTGGGCGTTGTCGGTGACACTTAAAGGTGTCGCTTCTGGGAAACCCATGCGGCGC > NC_002947/358133‑358281 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |