| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4861197 | 93 (1.460) | 18 (0.350) | 12/224 | 3.8 | 19.6% | intergenic (‑103/+134) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| ? | NC_002947 | = 4861238 | 72 (1.380) | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861048‑4861346 | tGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:768174/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCca > 1:1401093/1‑150 (MQ=255) gAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACaa > 2:128069/1‑150 (MQ=255) cTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAggg > 2:1304693/1‑150 (MQ=255) tCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGc < 2:1129996/150‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 1:589560/1‑136 (MQ=255) aCGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:589560/136‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTcac > 2:346122/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAGAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGGGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTcaca > 1:953699/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACaa > 1:576297/1‑139 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACaa < 2:576297/139‑1 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAt > 1:511168/1‑150 (MQ=255) gTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGcc < 2:1285687/150‑1 (MQ=255) ttCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGCCACAAGCGCGTCACATcccc > 2:1096002/1‑150 (MQ=255) tCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAGAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCt < 2:953699/150‑1 (MQ=255) gATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGc > 2:952725/1‑150 (MQ=255) aTACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGTGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTATACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCg < 1:1341768/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGt < 1:1085390/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGt < 1:128069/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGCGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGAt < 1:1414108/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc < 2:1401093/150‑1 (MQ=255) cggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTaac < 2:258437/150‑3 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCt < 1:568613/150‑1 (MQ=255) ggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTa > 2:928257/1‑150 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAg > 2:1042803/1‑150 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAg > 1:1342563/1‑150 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAg < 1:922973/127‑1 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAg > 2:922973/1‑127 (MQ=255) gggAGTTCTCTTATCTGACAAAGCAAAAGTGCAGCATGGCGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTTTC‑T‑TT‑TGAATGTACCATCCTCTTCGAGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGCCACATACCGTAGGGAAGTGATGGACCTGTAGGAGCg > 2:451699/1‑150 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGGAGAGCAAAGGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GTCTTGCT‑TGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:95482/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 2:511168/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACCTGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGTAGCgtg < 2:1207501/150‑3 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCggg < 1:240331/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCAGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGt < 1:976802/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCCTGAGGGCGTGC‑TGGCCGGTT‑CGGGTATCGTCGT‑TGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:850491/150‑1 (MQ=2) tGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCAAACCTCTTCCCGGATAAACACGATGTCACAAGGGCGTCACATGCCCTCGGGCGCCGATGTACCTGTAGGAGCCGGTGTa > 1:1489422/1‑150 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTTGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCggg > 2:351331/1‑144 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTTGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCggg < 1:351331/144‑1 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCTCTAGGGTGGGGAGGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAcc > 2:1015545/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:1402715/1‑150 (MQ=255) tGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCACGTCTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCTGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga > 1:1414271/1‑150 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc > 1:313578/1‑150 (MQ=255) agcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 2:1448871/150‑1 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAg < 2:1392221/85‑1 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAg > 1:1392221/1‑85 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGcac > 1:878165/1‑150 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTACACCCGCCACTCAAACGGCGTCACTTGCGCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg < 1:952725/150‑1 (MQ=38) tggtgCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAcc < 1:23083/150‑1 (MQ=255) gggtgCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAcc < 2:106579/149‑1 (MQ=255) gtgCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCg > 1:877948/1‑150 (MQ=255) gtgCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCg > 1:221717/1‑150 (MQ=255) tGG‑‑AGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TTACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCTCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGAGGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCTCGAAGAGGCCGGCACAGGGGACGACGATACCCgcccca > 2:707008/1‑145 (MQ=37) gg‑‑ggTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCgg > 2:1400506/1‑150 (MQ=255) ggTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGcc < 2:768174/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCCGCTAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 1:1190668/150‑1 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc < 1:640510/143‑1 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc > 2:640510/1‑143 (MQ=255) aGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGt < 2:363688/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAAACCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTg > 1:688743/1‑150 (MQ=255) ggtgcgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAt < 1:21048/147‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt < 1:1109670/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTg > 2:881689/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc > 1:355587/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgctc > 1:845274/1‑65 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCcgctc < 2:845274/67‑3 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:465874/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGACAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:426855/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGCTAACTACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTg > 1:720217/1‑150 (MQ=255) ctgccACAAGGGGGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 1:828301/147‑1 (MQ=255) tCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg < 2:688743/150‑1 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 2:342195/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAACTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 2:173797/1‑150 (MQ=255) | TGATCGAGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGG‑‑GGTTCCAGGTGTC‑T‑GT‑TGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861048‑4861346 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |