New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1487042 | 58 (0.910) | 16 (0.320) | 10/214 | 4.1 | 27.1% | intergenic (+51/+79) | yhdZ/degS | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/serine endoprotease DegS |
? | NC_002947 | = 1487072 | 41 (0.830) | intergenic (+81/+49) | yhdZ/degS | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/serine endoprotease DegS | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
TGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTT > NC_002947/1486928‑1487220 | tGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGAGCGGAGCAAGTTGGTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCtgt < 2:402987/150‑1 (MQ=255) tGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCtgt < 2:393978/150‑1 (MQ=255) tGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCGGCGTAATTCCtgt > 1:316205/1‑150 (MQ=255) aCTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTgg < 2:1244538/150‑1 (MQ=255) aCTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGCTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTgg < 1:470086/150‑1 (MQ=255) ttcttcGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGa < 2:1142026/150‑1 (MQ=255) ttcttcGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGa > 1:571203/1‑150 (MQ=255) ttcGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTgg > 1:1118853/1‑145 (MQ=255) ttcGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTgg < 2:1118853/145‑1 (MQ=255) ccGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAg < 2:1342504/143‑1 (MQ=255) ccGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAg > 1:1342504/1‑143 (MQ=255) aGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAg < 1:182754/150‑1 (MQ=255) cAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAAcgc > 1:922775/1‑150 (MQ=255) cAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAAcgc > 1:1183464/1‑150 (MQ=255) gttgttCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGc < 1:622394/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGTGAACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGtt > 1:875435/1‑150 (MQ=255) tCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGc > 1:12674/1‑112 (MQ=255) tCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGc < 2:12674/112‑1 (MQ=255) tCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGtt > 1:138880/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTAGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGttt > 1:476338/1‑150 (MQ=255) aGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTa < 2:730499/150‑1 (MQ=255) aGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTtc < 1:1497668/150‑1 (MQ=255) aGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCCGTGGCAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTtc > 1:1250386/1‑150 (MQ=255) tCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTctct < 2:922775/150‑1 (MQ=255) tGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTcc > 1:920319/1‑150 (MQ=255) aTTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTc < 1:242466/146‑1 (MQ=255) aTTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTc > 2:242466/1‑146 (MQ=255) ttGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCctggc < 2:1183464/150‑1 (MQ=255) tGTTTGGGCTGGGCGGAAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGc < 2:912806/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCgg > 2:1486294/1‑150 (MQ=255) gcgccccAGCCCTTGGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGt < 2:875435/144‑1 (MQ=255) cgGCAGCGATTCCCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACCCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTggc < 1:1025089/150‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGcc > 2:1228439/1‑100 (MQ=255) ccTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGcc < 1:1228439/100‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAg > 1:360275/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCgg < 2:1428719/68‑1 (MQ=255) tCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCgg > 1:1428719/1‑68 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTgg < 2:1119752/54‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTgg > 1:1119752/1‑54 (MQ=255) gCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATc < 1:1096209/150‑1 (MQ=255) cTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCa < 2:316205/150‑1 (MQ=255) cccACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGc < 2:571203/150‑1 (MQ=255) ccgcaGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGgcgc > 1:1036122/4‑115 (MQ=255) ccgcaGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGgcgc < 2:1036122/112‑1 (MQ=255) cacaGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCa < 2:1185204/146‑1 (MQ=255) cacaGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCa > 1:1185204/1‑146 (MQ=255) acaGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTACTGCGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTc > 1:649546/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACtgctgc < 2:1445952/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTg < 2:360275/150‑1 (MQ=255) tGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCa < 2:920319/150‑1 (MQ=255) gAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTAt < 2:450694/66‑1 (MQ=255) gAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTAt > 1:450694/1‑66 (MQ=255) aGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCa > 1:406760/1‑150 (MQ=255) tGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCtt < 1:912204/123‑1 (MQ=255) tGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCtt > 2:912204/1‑123 (MQ=255) tAATTCCTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATg < 1:620644/150‑1 (MQ=255) ttCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGtt < 1:1486294/150‑1 (MQ=255) tCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTgc > 2:448391/1‑132 (MQ=255) tCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTgc < 1:448391/132‑1 (MQ=255) | TGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTT > NC_002947/1486928‑1487220 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |