| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2112769 = | 16 (0.830) | 4 (0.220) | 4/246 | NT | 20.4% | coding (1560/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | 2112789 = | 16 (0.870) | coding (1540/4899 nt) | PP_1882 | membrane protein | |||||
TGAACTGGTACTGGGTGGTGGTTTCCAGCTTGTTGCGTTTCACCACCTCCTGATAGCGACGGCCGTGCCGCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAGGGGCTTGCCCCCGGCCGCTGCTCGCCGGGGTGGTGGTTTTGCTC > NC_002947/2112648‑2112934 | tGAACTGGTACTGGGTGGTGGTTTCCAGCTTGTTGCGTTTCACCACCTCCTGATAGCGACGGCCGTGCCGCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAggg > 1:63316/1‑150 (MQ=255) tggtggtTTCCAGCTTGTTGCGTTTCACCACCTCCTGATAGCGACGGCCGTGCCGCAAGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGa > 1:198983/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGTTGCGTTTCACCACCTCCTGATAGCGACGGCCGTGCCGCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCg < 2:168421/150‑1 (MQ=255) cctcctGATAGCGACGGCCGTGCCGCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTtgc > 2:449336/1‑150 (MQ=255) gccactggcaggcaacgccatcaccctcaacccgatgattgtcgagcacagtgaaaccctgacgcatgcgccggatcgtgcgcatGCGTCAgg > 1:386946‑M2/86‑93 (MQ=255) gccactggcaggcaacgccatcaccctcaacccgatgattgtcgagcacagtgaaaccctgacgcatgcgccggatcgtgcgcatGCGTCAgg < 2:386946‑M2/8‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCg < 1:175759/108‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCg > 2:175759/1‑108 (MQ=255) gCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGt > 2:362387/1‑150 (MQ=255) aacgccatcaccctcaacccgatgattgtcgagcacagtgaaaccctgacgcatgcgccggatcgtgcgcatGCGTCAg > 1:205950‑M2/73‑79 (MQ=255) aacgccatcaccctcaacccgatgattgtcgagcacagtgaaaccctgacgcatgcgccggatcgtgcgcatGCGTCAg < 2:205950‑M2/7‑1 (MQ=255) gCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCg > 1:223792/1‑150 (MQ=255) gCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCg > 2:129091/1‑150 (MQ=255) gCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCg > 2:363445/1‑150 (MQ=255) cgcATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCtgagt < 1:362387/150‑1 (MQ=255) aTCGCGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGTTTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAACCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCtgagtgag > 2:438157/1‑150 (MQ=255) ggTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAg < 1:363445/150‑1 (MQ=255) gTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAgg < 2:63316/150‑1 (MQ=255) gTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAGGGGCTTg < 2:198983/150‑1 (MQ=255) cctgacgcATGCGCACGATCCGGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGgc < 2:386946‑M1/85‑1 (MQ=255) cctgacgcATGCGCACGATCCGGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGgc > 1:386946‑M1/9‑93 (MQ=255) ctgacgcATGCGCACGATCCGGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGtt < 2:205950‑M1/72‑1 (MQ=255) ctgacgcATGCGCACGATCCGGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGtt > 1:205950‑M1/8‑79 (MQ=255) aGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGGGAACAGGGGCTTGCCCCCGGCCGCTGCTc > 2:101957/1‑150 (MQ=255) TGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAGGGGCTTGCCCCCGGCCGCTGCTCGCCggg > 1:387345‑M1/1‑150 (MQ=255) gcgcatGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAGGGGCTTGCCCCCGGCCGCTGCTCgccggggtggtggtctcat < 2:223792‑M2/144‑6 (MQ=255) gcatGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGGAATGGCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAGGGGCTTGCCCCCGGCCGCTGCTCGCCGGGGTGGTGGTTTTGctc > 2:489070‑M2/5‑150 (MQ=255) | TGAACTGGTACTGGGTGGTGGTTTCCAGCTTGTTGCGTTTCACCACCTCCTGATAGCGACGGCCGTGCCGCAGGCTGGACTTGGGCGCATCGAGGTAATAGTAAATTTTCTCTTCCAGGGGATGCGCCGGATCGTGCGCATGCGTCAGGGTTTCACTGTGCTCGACAATCATCGGGTTGAGGGTGATGGCGTTGCCTGCCAGTGGCGCCAGCGCCTTGTAGCGGTAGTGCTGAGTGAGAACAGGGGCTTGCCCCCGGCCGCTGCTCGCCGGGGTGGTGGTTTTGCTC > NC_002947/2112648‑2112934 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |