New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4861197 | 58 (1.400) | 12 (0.350) | 9/220 | 2.5 | 20.3% | intergenic (‑103/+134) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
? | NC_002947 | = 4861238 | 47 (1.390) | intergenic (‑144/+93) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861054‑4861346 | aGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAg > 1:681078/1‑150 (MQ=255) tCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGc < 1:385550/150‑1 (MQ=255) tCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTGCTGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGc > 1:542765/1‑150 (MQ=255) cGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGGTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAACCCGCTCCGACAAGGGCg > 1:565810/1‑150 (MQ=255) cACGCAGTTCGAGGATACGGGCTTGGGCGGTCATGGGATTAGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTca > 2:352258/1‑150 (MQ=255) gCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCcac > 1:737349/1‑137 (MQ=255) gAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCACAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCATATGCCCTAg < 2:653090/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa < 2:534208/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 2:439120/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 1:954017/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGACGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCATCTTCTCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGa > 1:954013/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc < 2:605862/150‑1 (MQ=255) gcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCATGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc < 1:998386/147‑1 (MQ=255) gcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCATGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAc > 2:998386/1‑147 (MQ=255) gcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCg < 1:952423/121‑1 (MQ=255) gcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCg > 2:952423/1‑121 (MQ=255) gTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgg > 2:846611‑M1/1‑108 (MQ=255) gTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAg < 1:363566‑M2/150‑2 (MQ=255) gTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAg > 2:681078‑M2/1‑149 (MQ=255) cATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtggga < 1:317880‑M1/150‑45 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAgg < 1:677542/111‑1 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAgg > 2:677542/1‑111 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGTCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg < 1:518093‑M1/150‑49 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgg < 2:284041‑M1/150‑49 (MQ=255) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttaccc < 1:377476‑M1/150‑57 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccg < 2:576195‑M2/150‑17 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgc > 1:439120‑M2/1‑133 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTGggagcgggtttacccgcgaa > 2:599531‑M2/1‑130 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaa < 1:51909‑M2/150‑21 (MQ=255) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaa > 1:497247‑M2/1‑130 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 2:729654‑M1/1‑88 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCC < 1:729654‑M1/88‑1 (MQ=255) tGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaaga > 2:542765‑M2/1‑128 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggc < 2:338782‑M2/150‑26 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgg > 1:476498‑M2/1‑125 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgg < 2:476498‑M2/132‑8 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGcc < 2:363566/150‑1 (MQ=255) agcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg < 1:338782/150‑1 (MQ=255) gcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > 1:108825/1‑150 (MQ=255) aaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGcaca > 2:932486/1‑150 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcggg > 2:755731‑M2/1‑116 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcggg < 1:755731‑M2/124‑9 (MQ=255) cagcTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCaa > 1:937851/1‑150 (MQ=255) cTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGCGACGTGCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacgg > 1:577438/1‑149 (MQ=255) ggggTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAAcgacga < 1:923682/150‑1 (MQ=255) gtggtgCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAc < 1:576195/150‑1 (MQ=255) gtgCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCg > 1:155340/1‑150 (MQ=255) tGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt < 2:257150‑M1/105‑51 (MQ=255) ggggTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTATTACACGGTCGTGGAGGACCGCGAATTGGGTCACATCCTCGACGGCGGTGATGTACCTGTGGGAGCGGTCTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGCACCgg > 1:19257/1‑150 (MQ=255) gggTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGc > 1:301891/1‑150 (MQ=255) ggtgtaGGTGTCTGTTGTCTGTGTCCTTCTCTTCGCGGGTAAACGCGCTCGAACAGGGGGGTCGAATTCCCTAGGGTGGTGCTGTACCTGTAGGAGCGGGTTTTCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCa < 2:825970/145‑1 (MQ=25) tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt < 2:220245‑M1/82‑51 (MQ=255) tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggt > 1:220245‑M1/1‑32 (MQ=255) tgtgACAGCCTCTTCGCGGGTAAAGATGCTGCTTGGATGGCGTGGGATGGTCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGCGCGGGTTTAAACACGAGCAGGCCAGCTGTAGCTACCACGGGACCCGGACCGACCAGCACGCCCTCAGGCTGctc > 2:482976/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagc > 1:60388‑M1/1‑28 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagc < 2:60388‑M1/74‑47 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAcc > 1:638500/1‑65 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTAcc < 2:638500/65‑1 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 2:19257/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 2:927970/150‑1 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 1:211919/149‑1 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAgg > 1:458187/1‑139 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc > 2:211919/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttt < 2:338782‑M1/150‑126 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAccc < 2:332136/113‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAccc > 1:332136/1‑113 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgca > 2:542765‑M1/1‑22 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaag < 1:51909‑M1/150‑131 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCcacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaag > 2:599531‑M1/1‑20 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCTAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTg > 1:62238/1‑145 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagaga > 1:439120‑M1/1‑17 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaa < 2:576195‑M1/150‑135 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgg < 1:313044‑M1/58‑43 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgg > 2:313044‑M1/1‑16 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTc > 2:99655/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGccc > 1:224464/1‑121 (MQ=255) tAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgc < 2:155340/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaacccca > 1:257150‑M2/1‑50 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaacccca < 2:257150‑M2/105‑56 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcaca > 1:220245‑M2/1‑50 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcaca < 2:220245‑M2/82‑33 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAAcgacga < 2:97376/93‑1 (MQ=255) cccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctc < 1:755731‑M1/124‑117 (MQ=255) cccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctc > 2:755731‑M1/1‑8 (MQ=255) ccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttt < 2:476498‑M1/132‑126 (MQ=255) ccGCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgcttt > 1:476498‑M1/1‑7 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcc < 2:284041‑M2/150‑103 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctgacacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcc < 1:518093‑M2/150‑103 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAcc > 1:27692/1‑95 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAcc < 2:27692/95‑1 (MQ=255) gCTCCtacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatccca < 2:923682‑M1/150‑146 (MQ=255) gCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatccca < 1:846611‑M2/150‑105 (MQ=255) gCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctgg > 1:60388‑M2/1‑46 (MQ=255) gCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctgg < 2:60388‑M2/74‑29 (MQ=255) ctacccACAGGGGCGTCACATGCTGTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTg < 1:352258/147‑1 (MQ=255) cTCCAACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTAACCCCCGCCTGATCCGTCACAGGCCACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 1:999448/150‑1 (MQ=255) ctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccatgac > 2:681078‑M1/1‑1 (MQ=255) ctacaggtacatcaccgccctagggcatgtgacgcccttgtgggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccatgac < 1:363566‑M1/150‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccgcgaagaggctggcacagtcaacagacacctggaaccccacgcaccaccccaagctgctcttttgctttgcaagagaagacaaatcccatgac > 2:846611‑M2/1‑42 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAggagcgggtttacccg < 1:313044‑M2/58‑17 (MQ=255) | AGCTCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGCGGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTT > NC_002947/4861054‑4861346 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |