| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 6000988 | 28 (0.670) | 7 (0.220) | 7/210 | 2.9 | 20.1% | intergenic (+39/+70) | PP_5256/amaA | cyclic nucleotide‑binding protein/L‑pipecolate oxidase |
| ? | NC_002947 | = 6001022 | 34 (1.050) | intergenic (+73/+36) | PP_5256/amaA | cyclic nucleotide‑binding protein/L‑pipecolate oxidase | |||||
GTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTCCGCAGCGAAGGCG > NC_002947/6000844‑6001137 | gTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTAAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAagtag > 2:627167/1‑150 (MQ=255) cAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCAcc > 2:179519/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGcc < 1:377886/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGACGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGCTGGTTGCACAAGTGAAGGT‑CGCTGGTCCTCTTCCCGGGTAAGCCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTga < 1:179519/150‑1 (MQ=255) ggcggcAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTgtgg < 2:436534/150‑1 (MQ=255) agagCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAAcc > 2:729261/1‑150 (MQ=255) gCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgt > 2:656513‑M2/1‑147 (MQ=255) cGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTGCGCGGGTAAACCCGCCCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcggg > 1:258457‑M2/1‑138 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcg > 2:715578‑M2/1‑137 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcg < 1:715578‑M2/147‑11 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCggtaggagcgggt < 1:1006322‑M2/150‑14 (MQ=255) gttgttgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggttta < 1:604645‑M2/150‑17 (MQ=255) tgttgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacc > 2:174940‑M2/1‑132 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGCGTACGTACCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaa > 1:836531‑M2/1‑126 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgg < 1:257895‑M1/137‑46 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgg > 2:257895‑M1/1‑92 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagacctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:574165‑M1/150‑59 (MQ=255) aGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 2:291522‑M2/1‑123 (MQ=255) aGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTAAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagag > 1:627167‑M2/1‑123 (MQ=255) ccGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACACGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggc > 1:625747‑M2/1‑121 (MQ=255) tcaaGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacagg < 2:70101‑M1/149‑73 (MQ=255) tcaaGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacagg > 1:70101‑M1/1‑77 (MQ=255) aagaagGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAagttcaccacagccctctcaggcggtgcac < 2:221212‑M1/105‑31 (MQ=255) aagaagGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAagttcaccacagccctctcaggcggtgcac > 1:221212‑M1/1‑75 (MQ=255) aagaagGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTacaa > 2:944685/1‑150 (MQ=255) aagaagGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTacaa > 2:432669/1‑150 (MQ=255) gggTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTTCAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTacaacacaa > 2:657503/1‑150 (MQ=255) gggTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcggg < 1:591985‑M2/116‑13 (MQ=255) gggTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcggg > 2:591985‑M2/1‑104 (MQ=255) gattCGTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGACTGAGGGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGGCTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTc < 2:582699/148‑1 (MQ=38) cTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtag < 2:216128‑M2/103‑6 (MQ=255) cTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtag > 1:216128‑M2/1‑98 (MQ=255) ttCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAg < 1:704250/150‑1 (MQ=255) ggCACAACTGGGCCTGTGCAGG‑CCTCTTCGCCGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGTCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCcgcg < 1:85770/149‑1 (MQ=38) gCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCAGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGt < 2:155649/150‑1 (MQ=255) acaAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCTCCTGCGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACACCCCTCAGGCACTGCCCCGCGTgg > 2:400891/1‑150 (MQ=255) gTGAGCCTGTGCCGG‑CTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACa < 2:604645/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttga < 2:70101‑M2/149‑78 (MQ=255) ccTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttga > 1:70101‑M2/1‑72 (MQ=255) cTGTCCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGaaa > 2:794338/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGaaaa > 2:186588/1‑150 (MQ=255) gCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAAcc < 1:558878/150‑1 (MQ=255) ccGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTacaa > 1:830259/1‑107 (MQ=255) ccGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTacaa < 2:830259/107‑1 (MQ=255) gg‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGa < 1:339661/150‑1 (MQ=255) g‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacgtgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccgg > 1:625747‑M1/1‑29 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggcttacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggct > 1:627167‑M1/1‑27 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggct > 2:291522‑M1/1‑27 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtggtacgtacgcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttct > 1:836531‑M1/1‑24 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGTCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttct < 1:574165‑M2/150‑93 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATa > 1:1001186/1‑150 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGAACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGa > 2:611694/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaaca > 2:174940‑M1/1‑18 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaagccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaac < 1:604645‑M1/150‑135 (MQ=255) aCCCGCTCCTACCggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaacaac < 1:1006322‑M1/150‑138 (MQ=255) cccGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggggcgggtttacccgcgcagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaacaacg > 1:258457‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccaccc > 2:591985‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccaccc < 1:591985‑M1/116‑105 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttct > 2:257895‑M2/1‑45 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttct < 1:257895‑M2/137‑93 (MQ=255) cGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaacaac < 1:715578‑M1/147‑138 (MQ=255) cGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaacaac > 2:715578‑M1/1‑10 (MQ=255) cTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaag > 1:216128‑M1/1‑5 (MQ=255) cTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaag < 2:216128‑M1/103‑99 (MQ=255) cTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTg < 2:922653/107‑1 (MQ=255) cTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTg > 1:922653/1‑107 (MQ=255) cTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTCCGcgccttc < 1:186588/150‑7 (MQ=255) tACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTCCGCAGCGAAg < 1:794338/150‑1 (MQ=255) aCAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaacaacgactcccggc > 2:656513‑M1/1‑3 (MQ=255) aaGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGACCCACTATTGCGTGGTACAGAGAAAAACCGGACTCAGAGAACGCTGTCCGCAGCGAAGgcg > 1:780415/1‑150 (MQ=38) | GTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGG‑CCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTCCGCAGCGAAGGCG > NC_002947/6000844‑6001137 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |