| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2429960 | 92 (1.220) | 14 (0.250) | 12/204 | 4.5 | 18.9% | intergenic (+47/+66) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase |
| ? | NC_002947 | = 2429975 | 51 (0.890) | intergenic (+62/+51) | PP_2129/PP_2130 | hypothetical protein/lytic transglycosylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTAC > NC_002947/2429830‑2430124 | ggCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGt < 2:1817066/150‑1 (MQ=255) gCGACGTGCTGTTCGGCCAGAAAGTGGGAGGCGGTGAAAGAGGTGCGCGTGGGGGGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGTCCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTa < 2:953492/150‑1 (MQ=21) gCGACGTGCTGTTCGGCCAGAAAATGGCTGTGGATGGCAGTGTGTGTCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTa < 2:953643/150‑1 (MQ=255) cGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAg < 1:1390256/150‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGc > 1:880087/1‑150 (MQ=255) cTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTCGGCATTGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCACTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCggg < 1:1516414/150‑1 (MQ=255) gCCAGAACATGGCGTTGGAGGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCAccc < 2:47391/150‑1 (MQ=255) aGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCcgcg > 1:637760/1‑150 (MQ=255) aaCCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGTCTCTTCGCAGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:291356/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGCGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:1207562/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCAGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:291322/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga > 2:716552/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 1:930508/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga > 2:930508/1‑149 (MQ=255) tGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTGTGCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAgg > 1:1049957/1‑150 (MQ=255) ggCTGTGGATGGTAGTGTGTGGCTGGAGGTGGGGATAGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCGTGTAGGAGCCGGTTCACCCGCGAAGAGGc < 2:937014/150‑1 (MQ=38) cTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACCGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg < 2:1692161/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg < 1:1070449/150‑1 (MQ=255) tgtgGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 1:1822577/142‑1 (MQ=255) tgtgGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa > 2:1822577/1‑142 (MQ=255) gtgGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGt > 2:274024/1‑150 (MQ=255) tgGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAAGG‑‑‑GTTTGAGCGGTCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCggca < 1:963398/150‑3 (MQ=11) aTGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAg < 2:1049957/150‑1 (MQ=255) ggCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGc < 1:1336818/150‑1 (MQ=255) cAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 2:1792088/130‑1 (MQ=255) cAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGGTCACCcgc > 1:1792088/1‑130 (MQ=255) gtgggtggTGGGAGGAGGGGATGGAAGTCGAACTCCTGGAGCAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACTCTGTCCTACAACGACCGCTCAACC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCaa < 2:1303949/150‑1 (MQ=37) tgggtggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAAc > 2:416186/1‑150 (MQ=255) tgggtggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAAc < 1:845219/150‑1 (MQ=255) tggCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCa > 1:1197208/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAAt < 2:1249493/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAAt < 1:716552/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGCCCTCCTCGCGCATGACCCCTCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAAt < 1:1627977/150‑1 (MQ=39) gAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATcaca > 2:280001/1‑150 (MQ=255) ggggATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCa > 1:280053/1‑150 (MQ=255) gggATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTg < 1:1347043/92‑1 (MQ=255) gggATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTg > 2:1347043/1‑92 (MQ=255) gAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg < 1:635574/115‑1 (MQ=255) gAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCg > 2:635574/1‑115 (MQ=255) aaGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGa < 1:365977/146‑1 (MQ=255) aaGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGa > 2:365977/1‑146 (MQ=255) aGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTa < 1:678524/86‑1 (MQ=255) aGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTa > 2:678524/1‑86 (MQ=255) gAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACa < 1:613050/123‑1 (MQ=255) gAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACa > 2:613050/1‑123 (MQ=255) aaaTCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTc < 1:280001/150‑1 (MQ=255) aTCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCAt < 2:637760/150‑1 (MQ=255) tCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATg < 2:1197208/150‑1 (MQ=255) ccTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGc < 1:416186/150‑1 (MQ=255) tGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCa > 2:186411/1‑150 (MQ=255) gAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAAt > 1:1764973/1‑150 (MQ=255) aaTAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATc > 1:1708582/1‑150 (MQ=255) ggTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAA‑‑‑CATTGTAGGAGCGGGCTTACCAAAGGTGCAGATGGGAAGGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTAATGCCAATcgacc > 1:890438/1‑150 (MQ=21) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCaa < 2:962820/107‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCaa > 1:962820/1‑107 (MQ=255) tGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCt > 1:1536758/1‑150 (MQ=255) 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tACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAAt > 1:1836747/1‑150 (MQ=255) tACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAAt > 1:31180/1‑150 (MQ=255) tACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAAt > 1:1237197/1‑150 (MQ=255) aCAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATa < 2:1237197/150‑1 (MQ=255) aCAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATa < 2:1194575/150‑1 (MQ=255) aCGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGt < 2:1205402/115‑1 (MQ=255) aCGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGt > 1:1205402/1‑115 (MQ=255) aCCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAg > 1:1394258/1‑150 (MQ=255) cAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGtt < 2:1394258/150‑1 (MQ=255) aaC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCt < 2:1836747/150‑1 (MQ=255) aC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTg < 2:280053/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACATGCGCAACAGCAAGCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATACCCCCCTGAGTGGAACGGATGAAACTGCTACCCGCATATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTAc > 2:875537/1‑150 (MQ=255) | GGCGACGTGCTGTTCGGCCAGAACCTGGCTGTGGATGGCAGTGGGTGGCTGGAGGTGGGGATGGAAGTAGAAATCCTGGAATAGGTGTGTTGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGACCGCTCAAAC‑‑‑CCTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGCTCAACAGCAATCACATGTCATCGAAATACCGTTCATGCCAATCCACCAATGGCTGCGGTGAATTCAGCTTCTGCCCGTAGATCACCGAATACGACAGCACGTTCTGTAC > NC_002947/2429830‑2430124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |