New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1114899 | 47 (1.190) | 9 (0.280) | 9/216 | 2.6 | 17.8% | intergenic (‑88/+91) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | = 1114925 | 45 (1.410) | intergenic (‑114/+65) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAC > NC_002947/1114750‑1115047 | gggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA < 1:658888‑M1/150‑1 (MQ=255) ggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACaggag < 1:494046/150‑1 (MQ=255) ggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGATTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACaggag > 2:191000/1‑150 (MQ=255) gTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTg < 1:263390/150‑1 (MQ=255) gTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTGTGCGACACAAGGCAGCTCCCACAGGAcggcgcca > 2:190290‑M1/1‑142 (MQ=255) gCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCATGGTGGGTTTGTTCGGAGTGCTCCGCGATG‑CCGTCGGCAGAGTAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCt < 1:116026/150‑1 (MQ=21) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGaa < 1:893908/150‑1 (MQ=255) tggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCtt < 2:231005/144‑1 (MQ=255) tggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCtt > 1:231005/1‑144 (MQ=255) tggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTACGGGTT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGt < 2:963339/150‑1 (MQ=255) gtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTg < 1:767864/150‑1 (MQ=255) gtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTg > 2:767864/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGaa > 2:840558/1‑139 (MQ=255) gTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGaa < 1:840558/139‑1 (MQ=255) tGCGCGGGGGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctc < 2:886236‑M1/150‑29 (MQ=255) gcgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctg < 1:432934‑M2/150‑6 (MQ=255) gcgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctg < 2:614419‑M2/150‑6 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgt > 2:432934‑M2/1‑144 (MQ=255) gggTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGTTcgtcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtg < 1:190290‑M1/150‑34 (MQ=255) ggTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgg > 2:903485‑M2/1‑142 (MQ=255) gCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggag < 1:878495‑M2/150‑12 (MQ=255) ggggttTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcct > 2:300110‑M2/2‑133 (MQ=255) gggtTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGTGCCGtcctgtgggagcggcccc > 2:876834‑M2/1‑132 (MQ=255) gT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagg < 2:28165‑M1/150‑58 (MQ=255) ggCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgg > 1:411686‑M1/1‑88 (MQ=255) ggCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgg < 2:411686‑M1/122‑35 (MQ=255) ggCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGt > 1:748065/1‑150 (MQ=255) cTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGTACGGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagg < 1:580627‑M1/150‑77 (MQ=255) gAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCATCAGGGTTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctc > 1:553848/1‑150 (MQ=39) tGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGt < 2:748065/150‑1 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACa < 1:91850/123‑1 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACa > 2:91850/1‑123 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGc > 2:471838/1‑125 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGc < 1:471838/125‑1 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCCAGTGAtt > 2:523741/1‑150 (MQ=255) aaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcctt > 2:290967‑M2/1‑81 (MQ=255) aaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcctt < 1:290967‑M2/99‑19 (MQ=255) aGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcctt > 1:873124‑M2/1‑80 (MQ=255) aGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcctt < 2:873124‑M2/98‑19 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcgaaagggccgtacagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatag < 1:580627‑M2/150‑75 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAg < 2:575023/106‑1 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAg > 1:575023/1‑106 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 1:809758/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 2:240162/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 1:442458/1‑150 (MQ=255) aaaagggCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 1:832043/5‑150 (MQ=255) aaagggCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTg < 2:832043/147‑1 (MQ=255) ggCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAAt < 1:87601/150‑1 (MQ=255) ctgctgCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGACTTCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATcc > 1:79023/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGc < 2:179780/101‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGc > 1:179780/1‑101 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcg > 1:918288/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc > 2:922884/1‑148 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc < 1:922884/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcc > 2:250990‑M2/1‑64 (MQ=255) gcgcAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggcc < 1:250990‑M2/80‑17 (MQ=255) aGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc < 2:667946/143‑1 (MQ=255) aGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc > 1:667946/1‑143 (MQ=255) gCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtgctg > 1:508275/1‑150 (MQ=255) ccTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcgaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgac < 2:28165‑M2/150‑94 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCg > 2:957269/1‑98 (MQ=255) cTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCg < 1:957269/98‑1 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcc < 2:288648‑M1/58‑30 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcc > 1:288648‑M1/1‑29 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCg > 2:270075/1‑150 (MQ=255) ttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCg < 2:553848/150‑1 (MQ=255) ttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTAggg < 1:191000/150‑2 (MQ=255) gACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAg > 2:457019/1‑150 (MQ=255) ggggccGCTCCCACAGGAcggcaccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaaccc > 2:876834‑M1/3‑18 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtctt > 2:290967‑M1/1‑18 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtctt < 1:290967‑M1/99‑82 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtct > 1:873124‑M1/1‑18 (MQ=255) aaGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtct < 2:873124‑M1/98‑81 (MQ=255) aGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccc > 2:300110‑M1/1‑17 (MQ=255) ggCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgc > 2:250990‑M1/1‑16 (MQ=255) ggCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgc < 1:250990‑M1/80‑65 (MQ=255) cTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgc < 1:878495‑M1/150‑140 (MQ=255) tCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 1:752216/1‑110 (MQ=255) tCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt < 2:752216/110‑1 (MQ=255) tCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCt > 2:581233/1‑150 (MQ=255) ccACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacc > 2:903485‑M1/1‑8 (MQ=255) ccACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgcc > 1:411686‑M2/1‑34 (MQ=255) ccACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgcc < 2:411686‑M2/122‑89 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGACGaactgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcaccc < 1:190290‑M2/150‑118 (MQ=255) acaGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg > 2:432934‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCCGGTTGAAGGTTGGCGTCGTGCTGTGGGAGCGGGCTCGTGTCGCGAAGGGGCCGTACAGCGGACCCAACGATCTCTCTAGTGATTACAGCGGTGCAATGCGCGGATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCGGGGctggttt > 2:160294/1‑144 (MQ=255) caGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccgc < 1:432934‑M1/150‑146 (MQ=255) caGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccgc < 2:614419‑M1/150‑146 (MQ=255) ggaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaa > 1:288648‑M2/1‑29 (MQ=255) ggaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaa < 2:288648‑M2/58‑30 (MQ=255) gaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcccccgcgca < 2:886236‑M2/150‑123 (MQ=255) | GGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGT‑CATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAC > NC_002947/1114750‑1115047 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |