New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5513315 | 71 (1.800) | 8 (0.250) | 7/214 | 3.1 | 12.6% | intergenic (+45/‑109) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | = 5513371 | 54 (1.710) | intergenic (+101/‑53) | urtD/urtE | ABC transporter ATP‑binding protein/ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGC > NC_002947/5513170‑5513459 | aCCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAACGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTCAcccc > 1:19492/1‑150 (MQ=255) aTGTGACCGTGCTGCACCAGTGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGtt > 1:525011/1‑150 (MQ=255) gACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTa > 2:680943/1‑150 (MQ=255) gACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTa > 2:878908/1‑150 (MQ=255) aCCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGACCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTAc < 1:727039/150‑1 (MQ=255) ccGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACa < 1:972230/150‑1 (MQ=255) tgctgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑Tg < 1:878908/150‑1 (MQ=255) ctgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑Tggg < 1:532078/150‑1 (MQ=255) tgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAcccc > 2:914283/1‑135 (MQ=255) tgcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAcccc < 1:914283/135‑1 (MQ=255) gcACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑Cg > 2:183940/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTaa < 2:684727/150‑1 (MQ=255) aGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑g < 2:364372/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATgggg < 1:424785/150‑1 (MQ=255) gtgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATgggg < 1:135721/150‑1 (MQ=255) tgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGc < 1:636470/150‑1 (MQ=255) tgCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGc > 2:810759/1‑150 (MQ=255) gCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTc > 1:181986/1‑150 (MQ=255) gCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGACGGTTc > 1:48999/1‑150 (MQ=255) aGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCcgt‑c < 2:512932/150‑1 (MQ=255) gCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TTGG‑TGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCcgt‑cgt > 1:95916/1‑150 (MQ=255) cTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTa < 1:810759/150‑1 (MQ=255) aGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCggg < 1:680943/150‑1 (MQ=255) gaaGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGt < 2:483855/148‑1 (MQ=255) gTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATgggg > 1:957109/1‑123 (MQ=255) gTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATgggg < 2:957109/123‑1 (MQ=255) gTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTAc < 2:224860/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCAGATGAGTCATTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGAGCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTAcc > 1:527140/1‑150 (MQ=255) gcaggcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTAccc > 1:113954/1‑150 (MQ=255) gcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑Tgg < 2:643712/101‑1 (MQ=255) gcagATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑Tgg > 1:643712/1‑101 (MQ=255) aTGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 2:582733/150‑1 (MQ=255) gAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggcacaggcac > 1:230929/1‑150 (MQ=255) gAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTGCCCGT‑CGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAGGCCggcacaggccc > 2:359338/1‑148 (MQ=255) gAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggcacaggcac > 1:378801/1‑150 (MQ=255) tCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACGAGGCCGGCACAGGCACAGCATccc > 2:143712/1‑150 (MQ=255) tCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATccc > 2:18007/1‑150 (MQ=255) ggCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTc < 2:726345/150‑1 (MQ=255) ccGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTACCCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTcgg < 1:212893/150‑3 (MQ=255) ccGCTGACCGGATTTGAATTGTTGGCGCCTGTGCCCGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAGCCGGGAAGTCATCGCCTT‑‑TGC‑TTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAg < 2:527140/150‑1 (MQ=21) cGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGttt < 2:970665/109‑1 (MQ=255) cGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGttt > 1:970665/1‑109 (MQ=255) gACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAAct > 2:147998/1‑150 (MQ=255) gACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGCCCGGCAGGTGCACAGCATCCCTTTCAGGAAct < 1:761804/150‑1 (MQ=255) ccGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCcgt‑c < 1:398157/89‑1 (MQ=255) ccGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCcgt‑c > 2:398157/1‑89 (MQ=255) ccGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGCGGGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAActct < 1:183940/150‑1 (MQ=255) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTa > 1:525139/1‑91 (MQ=255) cGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTa < 2:525139/91‑1 (MQ=255) ggATTTGAATTTTTGCCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTACCCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTca < 2:19492/150‑1 (MQ=255) tGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGc < 2:525011/150‑1 (MQ=255) gAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCgg > 2:910902/1‑91 (MQ=255) gAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCgg < 1:910902/91‑1 (MQ=255) tGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATc < 2:48999/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATc < 2:230929/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCTGTGCCCGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑CGGG‑AGTAAG‑ACCAGAGGTCAG‑TCGTGTGCGTAGGCGCGGGTTTACCAGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATc < 1:319572/150‑1 (MQ=25) gcgcCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGa < 1:760574/150‑1 (MQ=255) tgCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTg > 1:591189/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGaa > 2:262304/1‑119 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGaa < 1:262304/119‑1 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCAc < 2:113954/150‑1 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCa > 2:262830/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCa > 1:347853/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑GGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCa < 1:359338/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGt > 2:221300/1‑150 (MQ=255) tctTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTca > 1:601870/1‑120 (MQ=255) tctTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTca < 2:601870/120‑1 (MQ=255) cgcgGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGtactac < 2:181986/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCa < 1:366801/96‑1 (MQ=255) gcgGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCa > 2:366801/1‑96 (MQ=255) gggTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTAcggc > 1:592663/1‑150 (MQ=255) | ACCATGTGACCGTGCTGCACCAGGGGAGTGTGCTGGCGGAAGGCTCGCTGGAGCAGGTGCAGGCAGATGAGCGGGTGGTCGAGGTGTATCTGGGCCGCTGACCGGATTTGAATTTTTGGCGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGTTCCTACAG‑TGGG‑CGTAAT‑GCCATGGGGCGGTTCCCGT‑CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACAGCATCCCTTTCAGGAACTCTCACATGCTCAAGATCGACACCCTGCACCAGTACTACGGC > NC_002947/5513170‑5513459 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |